| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2295818 = | 43 (0.950) | 5 (0.140) | 5/200 | NT | 12.7% | intergenic (+21/+112) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| ? | NC_002947 | 2295903 = | 34 (0.930) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein | |||||
GGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2295988‑2295818‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCA > NC_002947/2295903‑2296051 GGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTC > 1:788781/1‑150GGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTAAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTC < 2:774717/150‑1 GCTGGCTGGGGGGGTGGCTGGGTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCG < 2:239233/150‑1 GCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCG < 2:330649/150‑1 CTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 2:564000/150‑1 CTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 1:497975/150‑1 CTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 2:933346/150‑1 GAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCC > 2:994151/1‑150 GGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGC > 1:964090/1‑150 GTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTC < 1:604296/150‑1 TGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCC < 2:964090/150‑1 GCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCA < 2:581169/150‑1 GAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCC > 1:290888/1‑126 GAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCC < 2:290888/126‑1 TGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGC > 1:964451/1‑150 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTC > 2:1133133/1‑125 CCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTC < 1:1133133/125‑1 TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTC < 1:330649/150‑1 GCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGG > 2:379062/1‑131 GCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCAATGTTCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGG < 1:379062/131‑1 CGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACC > 2:650756/1‑150 CGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGA > 2:321349/1‑117 CGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGA < 1:321349/117‑1 GCATGCGCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCG < 2:932918/150‑1 TCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGC < 1:581169/150‑1 TCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCCCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGC < 1:239233/150‑1 CACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCA < 2:1091142/150‑1 CACACGGAACCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCA < 2:1091001/150‑1 ACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCAT > 1:651915/1‑150 ACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCA > 1:862469/1‑150 GGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2295988‑2295818‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCA > NC_002947/2295903‑2296051 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |