New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1906749 | 36 (0.800) | 4 (0.110) | 4/196 | NT | 11.4% | intergenic (+47/+81) | nirD/PP_1707 | nitrite reductase/D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
? | NC_002947 | = 1906791 | 34 (0.950) | intergenic (+89/+39) | nirD/PP_1707 | nitrite reductase/D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
CTTCAGCCTGCTGAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAACACATCCACCAGGCTGGCCACCACCATCT > NC_002947/1906600‑1906894 | cTTCAGCCTGCTGAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACACCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCC > 2:627914‑M1/1‑150 (MQ=255) tCAGCCTGCTGAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTa < 1:387283/150‑1 (MQ=255) cAGCCTGCTGAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTAc < 1:682254/150‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACg < 2:451231/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGa < 2:1036160/150‑1 (MQ=255) ctgctgAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGCTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTGGAAGGGGGTGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTCCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCCCTCCTACGGaa > 2:1043134/1‑150 (MQ=255) tgctgAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCcacagggt > 2:396060‑M1/1‑142 (MQ=255) gctgAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATc < 1:266669/150‑1 (MQ=255) ctgAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCt < 2:558169/150‑1 (MQ=255) tgAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTg < 1:420443/150‑1 (MQ=255) gAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTCGTCAGTGCGGTTAACGGGAGTGGCGGTGGAGGTGGCGGTGGCCTTATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGc < 2:439387/150‑1 (MQ=38) aGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCa > 2:278173/1‑150 (MQ=255) gTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGTTCCTATTGAATCTGCAc < 2:951221/150‑1 (MQ=255) tCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTaa < 2:669883/150‑1 (MQ=255) ttGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCtgtg < 1:325406/146‑1 (MQ=255) ttGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCtgtg > 2:325406/1‑146 (MQ=255) tGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGggagc > 1:1088371‑M2/1‑145 (MQ=255) gggTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGggagcggg > 1:545612‑M2/1‑142 (MQ=255) gggTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGg < 2:673555‑M2/143‑2 (MQ=255) gggTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGg > 1:673555‑M2/1‑142 (MQ=255) ggTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGggagcgggc > 1:1046822‑M2/1‑141 (MQ=255) tgtgGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggctt < 1:396060‑M1/150‑54 (MQ=255) tgtgGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGggagcgggctt > 2:627764‑M2/1‑139 (MQ=255) tgtgGCCGGTGCGACTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGggagcgggctt < 2:50332‑M2/150‑12 (MQ=255) gTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGg > 2:204429‑M2/1‑131 (MQ=255) gTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGg < 1:204429‑M2/132‑2 (MQ=255) ggTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGggagcgggcttgcccgcgaagag > 1:117838‑M2/1‑127 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcggg > 2:1014588‑M1/1‑84 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcggg < 1:1014588‑M1/134‑51 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCtgtg > 2:229603/1‑126 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCtgtg < 1:229603/126‑1 (MQ=255) gggggAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACACCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGca < 1:627914/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATa > 2:529530/1‑98 (MQ=255) ggCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATa < 1:529530/98‑1 (MQ=255) gTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACt < 2:1028084/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGGCCAGCACAAGCCGACTAGa > 2:473636/1‑150 (MQ=255) cccTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCACCCCTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTgc > 1:616769/1‑150 (MQ=255) ccTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTgcg > 2:49551/1‑150 (MQ=255) tgcCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCCGCa > 2:289622/1‑150 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAg < 1:1170825/104‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAg > 2:1170825/1‑104 (MQ=255) cTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAac > 2:229030/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAac < 1:49551/150‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGTAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAACACATcca > 2:472624/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaacc > 1:117838‑M1/1‑23 (MQ=255) ctctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGccc > 2:53038/1‑133 (MQ=255) ctctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGccc < 1:53038/133‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCaaa < 2:174266/136‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCaaa > 1:174266/1‑136 (MQ=255) gCAAGCCCGCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcaga > 1:562700‑M1/1‑13 (MQ=255) gCAAGCCCGCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcaga < 2:562700‑M1/48‑36 (MQ=255) gCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCa < 1:216308/82‑1 (MQ=255) gCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCa > 2:216308/1‑82 (MQ=255) aaGCCCGCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcagtcgcaccggccaca < 2:50332‑M1/150‑140 (MQ=255) aaGCCCGCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaaccgcaccggccaca > 2:627764‑M1/1‑11 (MQ=255) aaGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaaccgcaccggccaca < 1:396060‑M2/150‑98 (MQ=255) aaGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAACACATCCACCAGGCTGGccacca < 1:50332/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaaccgcaccggccacacc > 1:1046822‑M1/1‑9 (MQ=255) cccGCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaaccgcaccggccacaccc > 1:545612‑M1/1‑8 (MQ=255) cccGCTCCTACGTAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAACACATCCACCAGGCTGGccaccacca < 1:472624/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaac < 1:1014588‑M2/134‑85 (MQ=255) cccGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaac > 2:1014588‑M2/1‑50 (MQ=255) cccGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAACACATCCACCAGGCTGGccaccacca > 2:112751/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAACACATCCACCAGGCTGGCCACCACCAt > 1:743902/1‑150 (MQ=255) gCTCCcacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaaccgcaccggccacacccgca > 1:1088371‑M1/1‑5 (MQ=255) cTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTg > 1:953013/1‑102 (MQ=255) cTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTg < 2:953013/102‑1 (MQ=255) ccacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaaccgcaccggccacaccc > 1:673555‑M1/1‑1 (MQ=255) ccacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaaccgcaccggccacaccc < 2:673555‑M1/143‑143 (MQ=255) ccacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaaccgcac > 2:204429‑M1/1‑1 (MQ=255) ccacagggtcggcgccgtattacaaggcggtgcagattccgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggccggcacaggcagcaaaggggtatcaggccaccgccagctccaccgcctcccccttcaaccgcac < 1:204429‑M1/132‑132 (MQ=255) cTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAACACATc > 1:672014/1‑123 (MQ=255) cTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAACACATc < 2:672014/123‑1 (MQ=255) | CTTCAGCCTGCTGAGTGGGGAGTGTCTGGAGGATGCCGGGCAGAGGTTGCGGGTGTGGCCGGTGCGGTTGAAGGGGGAGGCGGTGGAGCTGGCGGTGGCCTGATACCCCTTTGCTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACGGAATCTGCACCGCCTTGTAATACGGCGCCGACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAAGCCGACTAGATAACCAACCCCTGCGGCGTGCGCCCGGCAAACACATCCACCAGGCTGGCCACCACCATCT > NC_002947/1906600‑1906894 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |