New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2056021 | 48 (1.060) | 6 (0.150) | 5/216 | NT | 10.8% | intergenic (+27/‑116) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
? | NC_002947 | = 2056095 | 57 (1.450) | intergenic (+101/‑42) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
GCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGGGC > NC_002947/2055946‑2056241 | gcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTc > 1:525075/1‑150 (MQ=255) tGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCATACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgc < 2:776387‑M2/150‑7 (MQ=255) ccGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcga > 2:270706‑M2/1‑142 (MQ=255) gtgCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCACTCCGGTTCAGTGACAGGGTGAAAGCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagagg < 1:219588‑M2/150‑14 (MQ=255) gaaagtGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGCGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTACacccgcgaagaggcc > 2:171242‑M2/3‑135 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccgg > 1:537604/1‑150 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagag > 2:139301‑M2/1‑128 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagag < 1:139301‑M2/140‑13 (MQ=255) aTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGGGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAgg < 1:846811/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAGCCCCCCGCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCcaca < 1:73309/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAg < 2:104511/150‑1 (MQ=255) cAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAccc > 1:466173/1‑150 (MQ=255) cgcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCTTGGGATATCGCTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAt < 2:864150/150‑1 (MQ=255) cgcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAAGCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAt < 1:134439/150‑1 (MQ=255) cgcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTACTACATTGGCATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGAGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAt < 2:50921/150‑1 (MQ=255) aTCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAAc > 1:47392/1‑150 (MQ=255) cAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCa > 2:284662/1‑150 (MQ=255) aaCTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGGCCTCAGTTGCAGTGACAAGGTGAAATCCGCGTAGCAGGGGGGCAACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCGCAGCAGGCCACCCCAT‑GCAAACCAt > 1:403159/1‑150 (MQ=255) aaCTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCAt > 1:373037/1‑150 (MQ=255) aaCTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCAt < 2:226890/150‑1 (MQ=255) aaCTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCGCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCAt > 2:146878/1‑150 (MQ=255) aCTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACCGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATc < 1:383735/150‑1 (MQ=255) cTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATcc < 1:284662/150‑1 (MQ=255) gCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATcccc < 1:775294/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTa > 1:1005813/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGgcgc < 2:484237/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGgcgc > 1:1070289/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGAGGAGGAGCGGGTTCACACGCGAAGAAGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCt > 1:687434/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcatt < 2:278398‑M2/150‑73 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAgg < 1:405919/112‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAgg > 2:405919/1‑112 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGATTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCa < 1:1174859/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCCCCTACGTTGGGATATCACTGCTCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCa < 2:1191519/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGc < 1:614055/150‑1 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCt < 2:47392/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgca < 2:626623‑M2/150‑80 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcac < 1:818786‑M2/150‑81 (MQ=255) ccGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTAc < 2:1070289/150‑1 (MQ=255) cGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacg > 2:818786‑M2/1‑69 (MQ=255) gCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGACATCCGCGCACCCCCGGGTTCACCCGCCAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACCAGGCCACCCCCT‑CCCACCCCTCCCCTACTCGCCCCTGTCCCGCTCCCAccc > 1:628236/1‑149 (MQ=255) cTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTg < 2:631015/150‑1 (MQ=255) tCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCATCTTCTACCTGt > 1:848415/1‑150 (MQ=255) cTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTc > 2:467893/1‑150 (MQ=255) cTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTc < 2:373037/150‑1 (MQ=255) aTTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCGAGCTTATAACTGTTCTAtt > 2:558483/1‑150 (MQ=255) gggATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacggtggcgcagcag > 1:278398‑M2/1‑57 (MQ=255) gggATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgatgtcggatcagcgctggctctccaccaggggtttcacgtgcacatcggcattctgcgcacggtggcgcagcag > 1:626623‑M2/1‑57 (MQ=255) ggATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGc > 1:388078/1‑150 (MQ=255) tatCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCct > 2:645497/1‑150 (MQ=255) tCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCctgc > 2:1024198/1‑150 (MQ=255) cACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGCCGCTGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCTTCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCctgct < 1:558483/150‑1 (MQ=255) aCTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAC‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCctgctg > 2:6930/1‑150 (MQ=255) tGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTggg > 1:491976/1‑150 (MQ=255) cccTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCt > 1:507394/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcac < 2:687434/150‑1 (MQ=255) gACAGAGTGAACCCCGGGTAGGAGAGGGTTCACCAGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGTCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCCCTCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTc < 2:525075/150‑1 (MQ=255) aCAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTcc < 2:466173/150‑1 (MQ=255) gggTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAg < 2:409784/60‑1 (MQ=255) gggTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAg > 1:409784/1‑60 (MQ=255) ggTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcac > 2:760813/1‑135 (MQ=255) ggTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCcac < 1:760813/135‑1 (MQ=255) gTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcg < 2:89205/150‑1 (MQ=255) gTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcg > 1:89205/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTGTTTCGCGCTCCTGGGCTTCACCGCACAGTTCATGgcg > 2:33505/1‑150 (MQ=38) tGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGgcgc > 1:528434/1‑150 (MQ=255) ccGCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAAGCCGGCTCGTCGCCGCCC‑GCTGCGGCGGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACt < 1:574440/150‑1 (MQ=255) gcgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTc > 1:504576/1‑150 (MQ=255) gcgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTc > 1:386357/1‑150 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTc < 2:930144/148‑1 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTc > 1:930144/1‑148 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTCACCCGCCAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGac < 2:537604/150‑1 (MQ=255) ggTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTggg < 2:1005813/150‑1 (MQ=255) ggTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTggg < 1:1024198/150‑1 (MQ=255) gTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattctgcgcacggtggcgcagcaggtggtccatcaacgcaatggccatcatcgcctcggcaatcggcgtggcacgga < 2:372980‑M2/150‑147 (MQ=255) gTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGGGc < 2:504576/150‑1 (MQ=255) | GCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCAT‑GCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGGCTCCACCGCACCGTTCCTGGCGCTGTACTTCGACCACCTGGGC > NC_002947/2055946‑2056241 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |