New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4335068 | 34 (0.750) | 3 (0.070) | 3/236 | NT | 8.4% | coding (527/720 nt) | PP_3807 | thioesterase |
? | NC_002947 | = 4335096 | 33 (0.770) | coding (499/720 nt) | PP_3807 | thioesterase |
AGAAATGGCCACCTGGGAACATCTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGCAGCGCGCGCAACTCGCTGATCAGCTCGGCGTCGCTCTTGGGCTCGCGCCAGTTG > NC_002947/4334949‑4335241 | agaaATGGCCACCTGGGAACATCTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAag < 2:732827‑M2/150‑3 (MQ=255) aCCTGGGAACATCTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCacaa > 1:619825/1‑150 (MQ=255) ccTGGGAACATCTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGcaccac < 2:1143387/150‑1 (MQ=255) tctcATCTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCGATTGCCGG‑AGGTGTAAGTGCCGCACAACAGaaa < 1:634932/147‑1 (MQ=255) aCATCTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCacaa > 1:102891/1‑142 (MQ=255) aCATCTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCacaa < 2:102891/142‑1 (MQ=255) aTCTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCTGTGGGCGGAAGAGCGCCGGGCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGaaaaaga > 2:634932/1‑147 (MQ=255) aTCTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCg < 1:8401/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGgc < 2:1049902/150‑1 (MQ=255) gagaACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAg > 2:1121156/1‑150 (MQ=255) tGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTc < 2:871634/150‑1 (MQ=255) gggTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCa < 2:256193/150‑1 (MQ=255) ggTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAg > 2:806419/1‑150 (MQ=255) aCTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCtcat > 1:321957/1‑150 (MQ=255) gcCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCAtcagct > 2:332393/1‑150 (MQ=255) cATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCAtcagctca < 2:695805/150‑1 (MQ=255) gTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCa < 1:996026/150‑1 (MQ=255) ggCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAgg < 1:916670/150‑1 (MQ=255) ggCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAgg < 1:330313/150‑1 (MQ=255) gCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCATGc < 2:619825/150‑1 (MQ=255) ttCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTg > 2:745590/1‑150 (MQ=255) acCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGCAgcgcgcg > 1:376313/1‑150 (MQ=255) cccAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGgc < 2:228609/74‑1 (MQ=255) cccAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGgc > 1:228609/1‑74 (MQ=255) ccAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAagtgcccactgcatgtgctgggtggagtggaagaccgggccagcgatgagcaactgcgggcatggcgcagtgaaacccaaggcgcgttctcgctgcagatg < 1:401852‑M2/150‑102 (MQ=255) ccAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAg > 1:491867/1‑129 (MQ=255) ccAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAg < 2:491867/129‑1 (MQ=255) aGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTg < 1:290517/132‑1 (MQ=255) aGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTg > 2:290517/1‑132 (MQ=255) aTGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGCAGCGCGCGCAACTCGCt > 2:882003/1‑150 (MQ=255) aGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGCAGCGCGCGCAACTCGCTGATc < 2:376313/150‑1 (MQ=255) tGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAagtgcccactgcatgtgctgggtggagtggaagaccgggccagcgatgagcaactgcgggcatggcgcagtgaaacccaaggcgcgttctcgctgcagatgttcccaggtggcc < 2:239665‑M2/150‑115 (MQ=255) cACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGCAGCGCGCGCAACTCGCTGATCAGCTCg < 1:110899/150‑1 (MQ=255) cTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAagtgcccactgcatgtgctgggtggagtggaagaccgggccagcgatgagcaactgcgggcatggcgcagtgaaacccaaggcgcgttctcgctgcagatgttcccaggtggccatttct > 2:401852‑M2/1‑30 (MQ=255) tGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGCAGCGCGCGCAACTCGCTGATCAGCTCGGCg > 1:377086/1‑150 (MQ=255) cGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGCAGCGCGCGCAACTCGCTGATCAGCTCGGCGTCGCTCTTGGGCTCgcgc < 1:332393/150‑1 (MQ=255) gTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGCAGCGCGCGCAACTCGCTGATCAGCTCGGCGTCGCTCTTGGGCTCGCGCCa > 1:60285/1‑150 (MQ=255) gtgtAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTg < 1:754527/69‑1 (MQ=255) gtgtAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTg > 2:754527/1‑69 (MQ=255) gtgtAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGc > 2:364485/1‑96 (MQ=255) gtgtAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGc < 1:364485/96‑1 (MQ=255) gtgtAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGCAGCGCGCGCAACTCGCTGATCAGCTCGGCGTCGCTCTTGGGCTCGCGCCAgttg < 1:806419/150‑1 (MQ=255) | AGAAATGGCCACCTGGGAACATCTGCAGCGAGAACGCGCCTTGGGTTTCACTGCGCCATGCCCGCAGTTGCTCATCGCTGGCCCGGTCTTCCACTCCACCCAGCACATGCAGTGGGCACTGCAACGCCGGTCG‑CTGCCGGTAGGTGTAAGTGCCGCACAACAGAAAATCGGCGCGCAAGGTCGGCAAGGTCAGGCTCATCAGCTCAGCGTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCGTGCCCTGCAGCGCGCGCAACTCGCTGATCAGCTCGGCGTCGCTCTTGGGCTCGCGCCAGTTG > NC_002947/4334949‑4335241 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |