New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4354950 | 39 (0.860) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 8.9% | coding (106/681 nt) | modB | molybdate ABC transporter permease ModB |
? | NC_002947 | = 4354978 | 44 (1.000) | coding (134/681 nt) | modB | molybdate ABC transporter permease ModB |
GAACGCTGATGCCACTCGATGCCAGTGACCTGGGCGCCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCA > NC_002947/4354837‑4355121 | gAACGCTGATGCCACTCGATGCCAGTGACCTGGGCGCCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCggtgg < 1:716180/150‑1 (MQ=255) aaCGCTGATGCCACTCGATGCCAGTGACCTGGGCGCCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCggtggg > 2:328930/1‑150 (MQ=255) tGATGCCACTCGATGCCAGTGACCTGGGCGCCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCgg > 2:962718/1‑150 (MQ=255) cACTCGATGCCAGTGACCTGGGCGCCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGtggtgg < 2:214641/150‑1 (MQ=255) tCGATGCCAGTGACCTGGGCGCCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCAc < 2:793584/150‑1 (MQ=255) cAGTGACCTGGGCGCCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCt > 2:1048510/1‑150 (MQ=255) aGTGACCTGGGCGCCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACACGTCACCTGGTGGGGCGCACGCTCGCGCGCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGAGCGGTGGTGTCGCTGCCGCTg > 1:142600/1‑150 (MQ=255) gggCGCCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGcc > 2:1159252/1‑150 (MQ=255) gcgcCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCAc < 2:655570/150‑1 (MQ=255) tCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACgg > 2:4766/1‑150 (MQ=255) cTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTCCCACCGACGGTGATc < 1:340477/150‑1 (MQ=255) gACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGTTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCgg < 2:453202/150‑1 (MQ=255) cGTAAAACTGGCCAGCCTGACCCCCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGttt < 2:162486/150‑1 (MQ=255) aaaCTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTAc < 1:343715/150‑1 (MQ=255) tGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGccc > 1:993470/1‑150 (MQ=255) caccCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTCgg > 2:246423/1‑150 (MQ=255) ccTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGccc < 1:826989/150‑1 (MQ=255) ccTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGCGCGGTAGTTGCCATGCCCACACTTCGGCGACGGACGGTGTGCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGccc < 1:328930/150‑1 (MQ=255) ctgctgATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACggc > 2:757800/1‑150 (MQ=255) gctgATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTTGCCCGCACggctg > 2:862241/1‑150 (MQ=255) tcatcGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGTTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCCCCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTg < 1:267361/150‑1 (MQ=255) tcatcGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTg < 1:4766/150‑1 (MQ=255) tcatcGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTg < 2:680801/150‑1 (MQ=255) tcatcGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTg < 1:193060/150‑1 (MQ=255) atcGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTggg > 1:1094552/1‑149 (MQ=255) tcGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTc > 2:982345/1‑150 (MQ=255) cacaCCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGc < 1:962718/150‑1 (MQ=255) acCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACggctggct > 1:939636/1‑138 (MQ=255) acCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACggctggct < 2:939636/138‑1 (MQ=255) acCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCAc > 2:638071/1‑150 (MQ=255) ccGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCAccc > 1:117909/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCTGGTGGCGCGCGAGCAAGAGCTACAGCCTGCGAGAGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTGCTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCa < 2:132517/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGgccaccaggcgacgggtgtgccgatgatcagcaggatcagggtggtcaggctggccagttttacggtcagccagatggcgcccaggtcactggcatcgagtggcatcagcgttc < 2:406226‑M2/150‑115 (MQ=255) tggtggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGgccaccaggcgacgggtgtgccgatgatcagcaggatcagggtggtcaggctggccagttttacggtcagccagatggcgcccaggtcactggcatcgagtg > 2:375275‑M2/1‑35 (MQ=255) tggtggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGgccaccaggcgacgggtgtgccgatgatcagcaggatcagggtggtcaggctggccagttttacggtcagccagatggcgcccaggtcactggcatcgagtg < 1:375275‑M2/137‑103 (MQ=255) tggtggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTa < 1:1048510/150‑1 (MQ=255) gtggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCGGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGGTCGGTTTTTCCCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTaag > 2:441679/1‑148 (MQ=255) gtggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAg‑g > 2:654988/1‑150 (MQ=255) tggcgagcACGAGCTCTTGGCTGCCTGGGCCGGTGGGTTCGTGGGTGGCACTGCCGCCGGAACTTCCACCGACGGTGATCGGTTTTTAGATGTTGATGGCCCTTGGCTCGCGCGGGTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑TCCTgg > 2:355278/3‑150 (MQ=255) tCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTgg > 2:46979/1‑150 (MQ=255) gcgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggt < 1:757800/150‑2 (MQ=255) gcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggtgg < 1:982345/150‑4 (MQ=255) cgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGgccaccaggcgacgggtgtgccgatgatcagcaggatcagggtggtcaggctggccagttttacggtcagccagatggcgcccaggtcactggcatcgagtggcatcagcgttcataaccataggat > 1:406226‑M2/1‑23 (MQ=255) aCGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGtgtg > 1:420555/1‑150 (MQ=255) ctTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCa < 1:1039463/150‑1 (MQ=255) ttGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAg > 1:638228/1‑150 (MQ=255) ttGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAg < 1:46979/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCtt > 1:757613/1‑150 (MQ=255) tGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTca > 1:805128/1‑150 (MQ=255) | GAACGCTGATGCCACTCGATGCCAGTGACCTGGGCGCCATCTGGCTGACCGTAAAACTGGCCAGCCTGACCACCCTGATCCTGCTGATCATCGGCACACCCGTCGCCTGGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCA > NC_002947/4354837‑4355121 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |