New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5175524 = | 32 (0.710) | 4 (0.090) | 4/234 | NT | 10.0% | coding (279/945 nt) | PP_4551 | alpha/beta family hydrolase |
? | NC_002947 | 5175583 = | 42 (0.990) | coding (338/945 nt) | PP_4551 | alpha/beta family hydrolase |
GTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCA > NC_002947/5175436‑5175731 | gTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCa > 1:505909/1‑150 (MQ=255) ccACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATggg < 2:505909/150‑1 (MQ=255) ctaaggatcgccccgtgcaggctgccactgtgatgcagccggtacgcctgggcgatgtagctgcccatgcTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGc > 1:1056408‑M1/71‑140 (MQ=255) ctaaggatcgccccgtgcaggctgccactgtgatgcagcaggtacgcctgggcgatgtagctgcccatgcTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGc < 2:1056408‑M1/70‑1 (MQ=255) aaCTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAgg < 1:186090/150‑1 (MQ=255) aCTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGc < 1:231753/150‑1 (MQ=255) aCCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACctgc < 1:728808/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGGGCAGCACATAGCCGCCCAGTTCTCGCGCGCGCCGCTCTGCTTCTTTTCCCCCACCATGGGCGCCTCCACCTCCCCGGCGTACCtcctgc > 2:556915/1‑150 (MQ=255) cTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATcac > 2:1020741/1‑150 (MQ=255) tGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACctgc < 2:781158/141‑1 (MQ=255) tGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACctgc > 1:781158/1‑141 (MQ=255) tGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATcaca < 2:1034343/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGt < 2:809478/150‑1 (MQ=255) cgcccgccATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGACAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCACCACAGTgg < 1:662866/150‑1 (MQ=255) tcatGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCGGCTGCACAGTGGCAGCCTGCa > 2:880167/1‑150 (MQ=255) gcagcaggtacgcctgggcgatgtagctgcccatgcTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGc < 2:480651‑M1/61‑1 (MQ=255) gcagcaggtacgcctgggcgatgtagctgcccatgcTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGc > 1:480651‑M1/37‑97 (MQ=255) atGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACg > 1:86358/1‑150 (MQ=255) gCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACgggg < 2:661115/150‑1 (MQ=255) ggAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTGCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGa < 1:1169947/150‑1 (MQ=255) tGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGc < 1:183458/133‑1 (MQ=255) tGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGc > 2:183458/1‑133 (MQ=255) gTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGc > 1:357935/1‑150 (MQ=255) gTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGc > 2:344010/1‑150 (MQ=255) aaTGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTcc < 1:344010/150‑1 (MQ=255) gctgcccatgctgtggccgaacaggaacagcggcgtgcacgggaactgctggccgatgtgctgggccacaGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAg < 2:1056408‑M2/70‑1 (MQ=255) gctgcccatgctgtggccgaacaggaacagcggcgtgcacgggaactgctggccgatgtgctgggccacaGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCGGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAg > 1:1056408‑M2/71‑140 (MQ=255) ccTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTa > 1:1157906/1‑150 (MQ=255) ggTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAAc < 2:1157906/150‑1 (MQ=255) tgtgtgGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGGAAGCGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGACCCCAGCCACTCTTTGCGGTTTCATCTACCAACCg > 1:866755/1‑150 (MQ=255) gctgtggccgaacaggaacagcggcgtgcacgggaactgctggccgatgtgctgggccacaGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCtgctgc < 2:480651‑M2/36‑1 (MQ=255) gctgtggccgaacaggaacagcggcgtgcacgggaactgctggccgatgtgctgggccacaGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCtgctgc > 1:480651‑M2/62‑97 (MQ=255) cAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTg > 1:350466/1‑150 (MQ=255) aacaTCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTATGCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTAc < 1:1036043/149‑1 (MQ=255) caTCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCg > 2:1060169/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTAc > 2:419502/1‑75 (MQ=255) aTCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTAc < 1:419502/75‑1 (MQ=255) cagcagTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTgcg > 2:110199/1‑150 (MQ=255) tCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGa < 1:880167/150‑1 (MQ=255) ccGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTAc > 2:1129943/1‑60 (MQ=255) ccGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTAc < 1:1129943/60‑1 (MQ=255) cGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCCGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTg < 2:743009/150‑1 (MQ=255) tGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGcc > 1:508071/1‑150 (MQ=255) gCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGccc < 2:350466/150‑1 (MQ=255) gccgcTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCt < 1:1020741/150‑1 (MQ=255) gccgcTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCt < 1:110199/150‑1 (MQ=255) gcTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGa < 2:685950/150‑1 (MQ=255) tcctgttcGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGa < 2:282583/145‑1 (MQ=255) tcctgttcGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGa > 1:282583/1‑145 (MQ=255) ctgttcGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTgg < 1:1060169/150‑1 (MQ=255) ctgttcGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTgg > 2:1206552/1‑150 (MQ=255) tgttcGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGgc < 1:556915/150‑1 (MQ=255) gttcGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGgcg > 1:646571/1‑150 (MQ=255) ttcGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGgcgc > 2:48206/1‑150 (MQ=255) gccacaGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAgg > 1:304313‑M2/7‑150 (MQ=255) ccacaGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAggg < 2:646571‑M2/145‑1 (MQ=255) ccacaGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAggg > 1:292298‑M2/6‑150 (MQ=255) cacaGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTg > 2:394958‑M2/5‑140 (MQ=255) cacaGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTg < 1:394958‑M2/136‑1 (MQ=255) aGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCa > 1:861683‑M2/2‑150 (MQ=255) | GTGGCCACGGGCGCACTGCCGAACTGGGCAACCTCGGCCTGTTCGCCCGCCATCATGGCTGGAATGCCGTGGTCAATGACCTGGGGTGTGTGGCCCAGCACATCGGCCAGCAGTTCCCGTGCACGCCGCTGTTCCTGTTCGGCCACAGCATGGGCAGCTACATCGCCCAGGCGTACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCA > NC_002947/5175436‑5175731 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |