New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6005467 = | 57 (1.260) | 3 (0.070) | 3/244 | NT | 5.4% | coding (274/1395 nt) | ydcJ | metalloprotein |
? | NC_002947 | 6005524 = | 49 (1.100) | coding (331/1395 nt) | ydcJ | metalloprotein |
AAATCGAGCGCCTGGACCAGGAACGTCACGGCGCCATCCGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGCACAGAGCATCCTGGCCAAGCGCCAGATCTTCACCTC > NC_002947/6005375‑6005669 | gggttgtcgatcagctccaggcgcagcagcgaggtgaacacacggaacgggctgacatgcagcgattgctcgtgcaccgcgcgaaaggcagtGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCa > 1:704975‑M1/93‑150 (MQ=255) aaaTCGAGCGCCTGGACCAGGAACGTCACGGCGCCATCCGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCa < 1:705046/150‑1 (MQ=255) aTCGAGCGCCTGGACCAGGAACGTCACGGCGCCATCCGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACt < 2:806422/150‑1 (MQ=255) gACCAGGAACGTCACGGCTCCACCCCGGGCCGCTCCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGTCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTcgcgcg < 1:127/150‑1 (MQ=255) ccAGGAACGTCACGGCGCCATCCGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTAGACTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGt > 1:317019/1‑150 (MQ=255) cAGGAACGTCACGGCGCCATCCGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTg < 2:1012634/150‑1 (MQ=255) gAACGTCACGGCGCCATCCGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCAc < 2:946600/150‑1 (MQ=255) aCGTCACGGCGCCATCCGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGa > 2:1110375/1‑150 (MQ=255) ggCGCCATCCGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCg > 1:273224/1‑150 (MQ=255) ccATCCGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGc < 2:478800/150‑1 (MQ=255) cagttcgTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCAt > 1:254045/6‑150 (MQ=255) agccGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCAt < 2:789316/148‑1 (MQ=255) gcgTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCCGCATGTCa > 2:551417/1‑150 (MQ=255) tCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCAt > 1:283907/1‑143 (MQ=255) tCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCAt < 2:283907/143‑1 (MQ=255) cgccgAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCg > 2:322631/1‑150 (MQ=255) gccgAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCgt < 2:712201/150‑1 (MQ=255) caTCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCGATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCgctgct > 2:874857/1‑150 (MQ=255) gcccgccTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTACGTGTGTTCACCTCGCTGCTgcgc < 2:478571/150‑1 (MQ=255) cgccTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTg < 1:874857/150‑1 (MQ=255) ccTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGTCCTGTCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGa < 2:595360/150‑1 (MQ=255) ccTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCgc < 1:948425/137‑1 (MQ=255) ccTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCgc > 2:948425/1‑137 (MQ=255) ccTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTgca < 2:883225/150‑3 (MQ=255) ccTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCCGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGa < 1:551417/150‑1 (MQ=255) cGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGAt > 2:86902/1‑150 (MQ=255) ccGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGa < 1:787500/142‑1 (MQ=255) ccGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGa > 2:787500/1‑142 (MQ=255) tCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCATGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACa > 2:624741/1‑150 (MQ=255) aTGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAAc > 2:751477/1‑150 (MQ=255) tggaatgcaccggtacgccagcggagctgaggtcataatagccgaccggttgcatgccACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAAccc > 1:704975‑M2/59‑150 (MQ=255) gggCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAAccc > 1:926501/1‑150 (MQ=255) GGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCAc < 2:711396‑M1/59‑1 (MQ=255) GGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCAc > 1:711396‑M1/1‑59 (MQ=255) atgcaccggtacgccagcggagctgaggtcataatagccgaccggttgcatgccACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAg > 2:407309‑M2/55‑150 (MQ=255) ccGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCTGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTgcgc < 1:751477/150‑1 (MQ=255) tacgccagcggagctgaggtcataatagccgaccggttgcatgccACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAg < 1:407309‑M2/105‑1 (MQ=255) ggCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACaa > 2:732052/1‑131 (MQ=255) ggCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACaa < 1:732052/131‑1 (MQ=255) cTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGc > 1:645597/1‑82 (MQ=255) cTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGc < 2:645597/82‑1 (MQ=255) tattatGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGca > 2:707949/1‑150 (MQ=255) ttatGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGcaca > 2:876544/1‑150 (MQ=255) ttatGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGcaca > 1:1098547/1‑150 (MQ=255) tGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGCACagag < 2:273224/150‑1 (MQ=255) cTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTgg > 2:908466/1‑139 (MQ=255) cTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTgg < 1:908466/139‑1 (MQ=255) cTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGCACAGAGCATc > 1:48468/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGCACAGAGCATCCTGGCCaa < 1:322631/150‑1 (MQ=255) tGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTgc > 1:910979/1‑119 (MQ=255) tGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTgc < 2:910979/119‑1 (MQ=255) tACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGGCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGCACAGAGCATCCTGGCCAAGCGCCAGa > 1:336552/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAAt > 2:199597/1‑40 (MQ=255) ccGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAAt < 1:199597/40‑1 (MQ=255) ccGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGCACAGAGCATCCTGGCCAAGCGCCAGATc < 2:380673/150‑1 (MQ=255) cGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGa > 2:554849/1‑88 (MQ=255) cGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGa < 1:554849/88‑1 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGCACAGAGCATCCTGGCCAAGCGCCAGATCTTCACCTc > 1:600697/1‑150 (MQ=255) | AAATCGAGCGCCTGGACCAGGAACGTCACGGCGCCATCCGCGTCGGCACCGCCGAAGAACTGGCCACCATCGCCCGCCTGTTCGCCGTCATGGGCATGCAACCGGTCGGCTATTATGACCTCAGCTCCGCTGGCGTACCGGTGCATTCCACTGCCTTTCGCGCGGTGCACGAGCAATCGCTGCATGTCAGCCCGTTCCGTGTGTTCACCTCGCTGCTGCGCCTGGAGCTGATCGACAACCCGCAGTTGCGCGAGCTGGCACAGAGCATCCTGGCCAAGCGCCAGATCTTCACCTC > NC_002947/6005375‑6005669 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |