Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,753,542 | C→A | 15.6% | intergenic (+47/‑319) | glnA → / → glnL | glutamine synthetase/two‑component system sensor histidine kinase/phosphatase GlnL/GlnG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,753,542 | 0 | C | A | 15.6% | 165.3 / 17.8 | 63 | intergenic (+47/‑319) | glnA/glnL | glutamine synthetase/two‑component system sensor histidine kinase/phosphatase GlnL/GlnG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/25); new base A (3/7); total (31/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.64e-01 |
CGACGACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCTGA > NC_002947/5753393‑5753690 | cgacgaCTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGTACTGTGATACAG‑‑CTGCGGAGCTGGTTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGcctccctc > 1:625093/1‑150 (MQ=255) gacgacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCg < 2:948713/150‑1 (MQ=255) acgacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCgg < 2:436136/150‑1 (MQ=255) gacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGa < 1:277174/150‑1 (MQ=255) ttCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGc > 2:729592/1‑150 (MQ=255) cATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCg > 2:623120/1‑150 (MQ=255) aTCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGTGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGt < 1:313707/150‑1 (MQ=255) aTCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCCAAACCGCCTCCCTCGGGAGGCCGt > 2:551887/1‑150 (MQ=255) cGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGttt < 2:207871/150‑1 (MQ=255) gATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGtttt < 1:1041820/150‑1 (MQ=255) cTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGttt < 1:167583/150‑1 (MQ=255) gaagaagaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAgc < 1:835882/150‑1 (MQ=255) aagaagaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCt > 2:534372/1‑132 (MQ=255) aagaagaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCt < 1:534372/132‑1 (MQ=255) agaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGcgccgc < 1:106152/150‑1 (MQ=255) gaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCt > 2:882967/1‑150 (MQ=255) aaTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGttt < 1:823439/117‑1 (MQ=255) aaTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGttt > 2:823439/1‑117 (MQ=255) aTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGc < 1:178414/135‑1 (MQ=255) aTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGc > 2:178414/1‑135 (MQ=255) aGGTCCGTGCCTTCCTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTAATACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGCCATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGc < 1:551887/150‑1 (MQ=255) aGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGc < 1:469611/150‑1 (MQ=255) aGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGc > 1:614633/1‑150 (MQ=255) aGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGc < 1:882967/150‑1 (MQ=255) aGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTCGAATACAAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTAATCTGATTGGCGCCTCGCGCCC‑ATGACATGATCAAAACAGCCTCCCTCGGGAGGGCGTTTTAGTCTCTACCCACCTTGCAGAATCGCCACAGATTCGc > 2:469611/1‑150 (MQ=255) aGGTCCGCACCTTCGTACGCCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGGCCTGCTTAGCGG‑‑T‑CATCCTAAATTCGTTTTATATGATCAAAGCCGTCACCCCAGGGAGGCTGTTTTTGGGTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGc < 1:275534/150‑1 (MQ=255) ccTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGc > 1:780628/1‑150 (MQ=255) tACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGaa < 1:554972/120‑1 (MQ=255) tACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGaa > 2:554972/1‑120 (MQ=255) acacCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGttt > 1:861449/1‑96 (MQ=255) acacCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGttt < 2:861449/96‑1 (MQ=255) acCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATAACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTa > 1:1180796/1‑150 (MQ=255) cccGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGAACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTAt > 1:859724/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CCGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATc > 1:293099/1‑150 (MQ=255) gAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCt > 1:323068/1‑139 (MQ=255) gAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTaa > 1:365545/1‑150 (MQ=255) gAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGATTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCt < 2:323068/139‑1 (MQ=255) gCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAAtt < 1:623120/150‑1 (MQ=255) gCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAAtt > 1:943571/1‑150 (MQ=255) gTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTcac > 1:364956/1‑150 (MQ=255) actacAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCacac < 1:628953/150‑1 (MQ=255) ctgctgATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGccc > 1:148965/1‑150 (MQ=255) atctgatTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAAtt > 1:181811/1‑150 (MQ=255) tctgatTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGCCACGCTATGCTCTATCTTGGTGACTTAACACACACCAGGCCCTCAATTg < 1:933715/150‑1 (MQ=255) ctgatTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGc > 2:184221/1‑150 (MQ=255) gatTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTAACTGATGAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTc < 1:30962/150‑1 (MQ=255) atTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTcc > 1:29470/1‑150 (MQ=255) cgcCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAAt < 2:365545/150‑1 (MQ=255) gcCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATc < 2:293099/150‑1 (MQ=255) gcgcCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAg < 1:373789/37‑1 (MQ=255) gcgcCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAg > 2:373789/1‑37 (MQ=255) gcgcCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCACTGATTCGCCTGTCACGCTATg < 2:924575/95‑1 (MQ=255) gcgcCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCACTGATTCGCCTGTCACGCTATg > 1:924575/1‑95 (MQ=255) aTGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGtt < 2:1193932/150‑1 (MQ=255) aTGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGtt > 2:537774/1‑150 (MQ=255) gACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTaa > 2:396941/1‑150 (MQ=255) tGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGt < 1:396941/150‑1 (MQ=255) aaaCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCAcc > 2:245632/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCa > 1:268742/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCa > 1:14034/1‑150 (MQ=255) aCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCaa < 2:181811/150‑1 (MQ=255) aCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAAc < 1:173487/140‑1 (MQ=255) aCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAAc > 2:173487/1‑140 (MQ=255) ggCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATGCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGa < 2:780628/150‑1 (MQ=255) ccctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTc < 2:148965/150‑1 (MQ=255) ccctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTc < 2:943571/150‑1 (MQ=255) cctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAg > 2:298968/1‑37 (MQ=255) cctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAg < 1:298968/37‑1 (MQ=255) tcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCTGa < 1:184221/150‑1 (MQ=255) | CGACGACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAG‑‑CTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCG‑ATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTCTGA > NC_002947/5753393‑5753690 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |