| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,906,205 | T→C | 8.8% | T218A (ACC→GCC) ‡ | spuF ← | spermidine/putrescine ABC transporter ATP binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,906,205 | 0 | T | C | 8.8% | 189.8 / 7.3 | 68 | T218A (ACC→GCC) ‡ | spuF | spermidine/putrescine ABC transporter ATP binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/34); new base C (3/3); total (31/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.70e-01 | |||||||||||
TCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGTTTAGGGCGCTTGG > NC_002947/5906060‑5906354 | tcgtcgACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATg < 1:629169/150‑1 (MQ=255) gtcgACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGc < 2:372123/150‑1 (MQ=255) gACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGcccc < 2:17870/150‑3 (MQ=255) gACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCctc > 1:1107925/1‑150 (MQ=255) gACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGACCATGGccca < 1:112182/150‑3 (MQ=255) aCCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCctct > 1:427303/1‑150 (MQ=255) cACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTTGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTc > 2:82678/1‑150 (MQ=255) cACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTc > 1:467376/1‑150 (MQ=255) ccatCACCTTCGATCAGGTTGACGTTACCGATGAGCTCGCACACCAGGCCGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGCCGAGCGGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGAGGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTcc < 2:405239/147‑1 (MQ=255) aCCTTCGAACAGTTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTc > 2:300726/1‑150 (MQ=255) cTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGt > 1:824811/1‑150 (MQ=255) cTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGt > 1:181205/1‑150 (MQ=255) cTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGACCATGGccca < 2:548650/139‑3 (MQ=255) cTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGACCATGGccca > 1:548650/1‑137 (MQ=255) ttCGAACAGGTTGACGTTACCGATGACCTCGCACACCAGTCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCCATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTg < 2:697771/150‑1 (MQ=255) tCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTTGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTgg < 1:82678/150‑1 (MQ=255) tCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTgg < 2:555873/150‑1 (MQ=255) tCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTgg < 2:887935/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTc < 1:704372/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTc < 1:457659/150‑1 (MQ=255) aGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCAcc < 2:743827/150‑1 (MQ=255) ggTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCa < 2:423318/150‑1 (MQ=255) ttACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAg < 1:721357/150‑1 (MQ=255) ttACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAg < 1:778394/150‑1 (MQ=255) tACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAgg < 1:300726/150‑1 (MQ=255) cGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTa > 2:6730/1‑150 (MQ=255) gATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTac > 1:1083212/1‑150 (MQ=255) aaCTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACAccc > 1:1004305/1‑150 (MQ=255) cTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCAc < 2:1107925/150‑1 (MQ=255) acCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCg > 1:1071797/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCgat < 2:603085/150‑1 (MQ=255) tGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGa < 2:1004305/150‑1 (MQ=255) tGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGa > 1:240961/1‑150 (MQ=255) ggTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGAc < 2:1083212/150‑1 (MQ=255) gCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGc > 1:879067/1‑85 (MQ=255) gCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGc < 2:879067/85‑1 (MQ=255) tAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGc > 2:682704/1‑150 (MQ=255) atctCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATc < 1:698622/147‑1 (MQ=255) gTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGt < 1:842423/105‑1 (MQ=255) gTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGt > 2:842423/1‑105 (MQ=255) tCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGc < 1:428702/150‑1 (MQ=255) tCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGc > 2:428702/1‑150 (MQ=255) cACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGa > 1:629821/1‑150 (MQ=255) cACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCACGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCAAGCGCTCTAGGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCtagat > 2:698622/1‑146 (MQ=255) aCTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGAtctc < 2:332153/125‑1 (MQ=255) aCTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGAtctc > 1:332153/1‑125 (MQ=255) gCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGttt < 2:777326/150‑1 (MQ=255) gATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCtt < 1:6730/150‑1 (MQ=255) ggCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAg > 1:122034/1‑150 (MQ=255) ggCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAg < 2:629821/150‑1 (MQ=255) gcctggtgTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCa > 1:761892/8‑150 (MQ=255) cccAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGTGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCAtt < 2:181205/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTg > 2:179404/1‑150 (MQ=255) gTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCTATGATCTCg > 1:265790/1‑94 (MQ=255) gTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCg < 2:265790/94‑1 (MQ=255) cATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCtcgtc < 2:467376/150‑1 (MQ=255) cATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCtcgtc < 2:240961/150‑1 (MQ=255) tgatgGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGa < 2:122034/150‑1 (MQ=255) atgGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGagc < 2:761892/150‑1 (MQ=255) cGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGagcagca > 2:1185555/1‑150 (MQ=255) gATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCACCAACCAGGTTACACACACGCGCTCGAAAATCTCGTCCAGCTAAAACTGCATAAAAGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTAGTCGagcagcag > 2:286271/1‑150 (MQ=255) gaagaggCCATGACCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCtt < 2:1174042/108‑1 (MQ=255) gaagaggCCATGACCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCtt > 1:1174042/6‑113 (MQ=255) gcTGGGCCATGGTCATTGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGtt > 2:137570/1‑150 (MQ=255) gaggCCATGACCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGTTTa > 2:611894/3‑150 (MQ=255) ggCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGTTTAgg < 1:179404/150‑1 (MQ=255) ccATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGTTTAGGgc > 2:215972/1‑150 (MQ=255) tGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGTTTAGGGCGCt > 1:537146/1‑150 (MQ=255) tCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATGACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGTTTAGGGCGCTTgg > 1:342844/1‑150 (MQ=255) | TCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGCTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGTTTAGGGCGCTTGG > NC_002947/5906060‑5906354 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |