| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,931,339 | C→G | 6.1% | V263L (GTT→CTT) | ubiH ← | 2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenyl hydroxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,931,339 | 0 | C | G | 6.1% | 260.7 / 6.1 | 81 | V263L (GTT→CTT) | ubiH | 2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenyl hydroxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/43); new base G (3/2); total (36/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
CAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCGGCAACGGCAGCAAGGC > NC_002947/5931190‑5931486 | cAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAAc > 1:355345/1‑150 (MQ=255) ggCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTg < 2:275520/150‑1 (MQ=255) cTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGgcg < 1:168542/150‑1 (MQ=255) gCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCa < 1:193221/150‑1 (MQ=255) gCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGCTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGgcgcc > 2:875903/1‑149 (MQ=255) cacaTCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAAGTTGGCGCac < 1:316219/150‑2 (MQ=255) acaTCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAgc > 1:733616/1‑150 (MQ=255) aTCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAgcgc < 2:864001/150‑1 (MQ=255) aCGCAACGACAGATTTTTACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGAT‑CACCGGGCGTCTCGGTGTCGGCCGCACCTGGTCTTGTGCCTAAATCAAGGAAAGCGGTTAGAGTTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGcc < 1:875903/150‑1 (MQ=255) aaCGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTCCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAgg < 2:337118/150‑1 (MQ=255) cAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTa < 1:705428/150‑1 (MQ=255) cAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTa < 2:2804/150‑1 (MQ=255) aTTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGcc > 1:856281/1‑150 (MQ=255) aTTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGcc > 1:464438/1‑150 (MQ=255) aaaCCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAgc > 1:426848/1‑129 (MQ=255) aaaCCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAgc < 2:426848/129‑1 (MQ=255) aaaCCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAac < 2:725399/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTGGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGc > 1:478441/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGc > 2:375859/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGcc > 1:982227/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGcc < 2:14640/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTg > 2:979014/1‑150 (MQ=255) cccGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGc < 1:462283/130‑1 (MQ=255) cccGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGc > 2:462283/1‑130 (MQ=255) cccGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGc < 2:464438/150‑1 (MQ=255) ccGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCCGCa > 1:382677/1‑150 (MQ=255) tGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTcgc < 2:733616/150‑1 (MQ=255) gggTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CCGCCTCACCTTCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCgcgc < 2:424960/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAgg > 2:935552/1‑150 (MQ=255) tgctgcGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCGCAGGCGGTAGCCGAACACGccc > 2:808510/1‑124 (MQ=255) tgctgcGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGccc < 1:808510/124‑1 (MQ=255) ctgcGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTAc < 2:815753/144‑1 (MQ=255) ctgcGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTAc > 1:815753/1‑144 (MQ=255) tgcGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCtcgtc < 2:982227/150‑1 (MQ=255) tgcGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGACTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCtcgtc < 1:434913/150‑1 (MQ=255) gTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGAt < 1:935552/150‑1 (MQ=255) ttGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATg > 1:165539/1‑150 (MQ=255) ccAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCgg > 2:13506/1‑150 (MQ=255) gCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCa > 1:540143/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGgc > 1:500135/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGgc > 1:1138142/1‑150 (MQ=255) caccaGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGgcg > 2:75441/1‑150 (MQ=255) caGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGcgccg > 1:1006016/1‑150 (MQ=255) tG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCa < 2:500135/150‑1 (MQ=255) gCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCa < 1:592805/150‑1 (MQ=255) ccGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCAt < 2:1138142/150‑1 (MQ=255) gCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGc < 1:375859/150‑1 (MQ=255) cACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGcc < 2:462427/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGccc < 1:501576/150‑1 (MQ=255) cTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTg < 2:355345/150‑1 (MQ=255) tGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGAt < 1:1011556/119‑1 (MQ=255) tGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGAt > 2:1011556/1‑119 (MQ=255) gtCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGcgccgc > 2:484441/2‑133 (MQ=255) gtCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGcgccgc < 1:484441/132‑1 (MQ=255) ccTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCg > 1:645628/1‑119 (MQ=255) ccTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCg < 2:645628/119‑1 (MQ=255) cTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGt > 2:1063904/1‑150 (MQ=255) tGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTc < 2:540143/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTc < 1:1031260/150‑1 (MQ=255) cGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCa < 2:1006016/150‑1 (MQ=255) aaGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTgcg > 1:877151/1‑150 (MQ=255) cAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCg < 2:478441/150‑1 (MQ=255) gCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGt < 2:653606/150‑1 (MQ=255) gTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTc > 2:793789/1‑150 (MQ=255) agagGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCACTGGCGTTCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATTCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCg < 1:979014/150‑1 (MQ=255) agGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCca < 2:469220/125‑1 (MQ=255) agGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCca > 1:469220/1‑125 (MQ=255) agGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCGGc > 1:674657/1‑150 (MQ=255) agGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCGGc < 1:75441/150‑1 (MQ=255) agGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCAGCCAGTCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCGGc > 1:318290/1‑150 (MQ=255) gTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCg < 1:451713/88‑1 (MQ=255) gTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCg > 2:451713/1‑88 (MQ=255) tGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGGTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCGGCAAc < 1:381196/150‑1 (MQ=255) cGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCGGCAACGgc < 1:1063904/150‑1 (MQ=255) ctGCGCCAAGTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCGGCAACGgca > 1:846519/2‑150 (MQ=255) tGCGCCAAGTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATg > 2:630531/1‑79 (MQ=255) tGCGCCAAGTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATg < 1:630531/79‑1 (MQ=255) gcCAAGTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCGGCAACGGCAGCaa > 2:305823/1‑150 (MQ=255) gcCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCt > 1:147669/1‑104 (MQ=255) gcCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCt < 2:147669/104‑1 (MQ=255) gcCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGG‑TTTCCGGCAACGGCCGCAAg > 2:265784/1‑150 (MQ=255) aaCTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCCGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCGGCAACGGCAGCAAGGc < 2:382677/150‑1 (MQ=255) | CAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTG‑CGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGCCCTGCAGTTCGCGCAGGAAGCTACGCTCGTCGATGTCGGCCAGGCGCCGCGCATCCATGCCCTGACGGGTCCACACCAGTGCGCAGCGGTTTTCCGGCAACGGCAGCAAGGC > NC_002947/5931190‑5931486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |