Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,171,838 | C→A | 7.3% | A174S (GCA→TCA) | glmS ← | L‑glutamine/D‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,171,838 | 0 | C | A | 7.3% | 203.5 / 3.6 | 64 | A174S (GCA→TCA) | glmS | L‑glutamine/D‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/29); new base A (2/3); total (32/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GATAGAGACCTGATCACGGCGGATTTCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCG > NC_002947/6171689‑6171986 | gATAGAGACCTGATCACGGCGGATTTCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGtgc < 1:1062318/150‑1 (MQ=255) gaCCTGATCACGGCGGATTTCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGccac > 2:1049533/1‑150 (MQ=255) gaCCTGATCACGGCGGATTTCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGccac < 1:971499/150‑1 (MQ=255) cTGATCACGGCGGATTTCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAg > 1:1141017/1‑150 (MQ=255) cTGATCACGGCGGATTTCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAg < 2:781236/150‑1 (MQ=255) gcggATTTCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGATGCCACCAGGCGGTCCgg > 2:904412/1‑150 (MQ=255) gcggATTTCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGATGCCACCAGGCGGTCCgg > 2:904559/1‑150 (MQ=255) aTTTCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGgctgc < 1:481880/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCtt < 2:690737/150‑1 (MQ=255) cAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTgg < 1:193492/150‑1 (MQ=255) cttcttCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGAAGCCAGGAAAATCTCGCCAAATCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAgcg > 2:1136616/1‑150 (MQ=255) gTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTa > 1:964337/1‑150 (MQ=255) tACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTaa > 1:746487/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGTCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGcc > 2:1034851/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGcc > 1:759348/1‑150 (MQ=255) tCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAgg > 1:258956/1‑150 (MQ=255) tCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAgg > 1:507423/1‑150 (MQ=255) aCCGGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTc < 2:459248/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCAccgccg > 2:539846/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAgg < 1:911958/150‑1 (MQ=255) tCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCg > 1:382131/1‑150 (MQ=255) cGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCgg > 2:962244/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCa > 1:48759/1‑150 (MQ=255) cGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCAccgcc < 1:933075/130‑1 (MQ=255) cGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCAccgcc > 2:933075/1‑130 (MQ=255) cGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAg < 2:964337/150‑1 (MQ=255) gCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAgg < 1:244972/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAg > 1:165036/1‑147 (MQ=255) cAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAg < 2:165036/147‑1 (MQ=255) aaGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCGCCTGTTGGTCCTGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCCGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCCGGTCTGGa < 2:455684/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGtgaagc > 1:953947/1‑137 (MQ=255) ttCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGtgaagc < 2:953947/142‑6 (MQ=255) ttCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGACGCCCTTAAg < 1:1167103/129‑1 (MQ=255) ttCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGACGCCCTTAAg > 2:1167103/1‑129 (MQ=255) tcGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGctc < 2:420249/150‑1 (MQ=255) ccGCCAAGGCCCAGGGCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGctc < 1:372761/149‑1 (MQ=255) gCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGATCTGGAATGCTCtt > 2:6247/1‑150 (MQ=255) aagtcccAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAg < 1:1034851/146‑1 (MQ=255) aaGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAg > 2:298070/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAg < 2:382131/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGgt > 1:614126/1‑150 (MQ=255) ggCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggt < 2:507423/150‑1 (MQ=255) gCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggtg > 1:581535/1‑150 (MQ=255) gCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGATGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggtg < 1:904412/150‑1 (MQ=255) gCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGATGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggtg < 1:904559/150‑1 (MQ=255) ccGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGtggtgg < 2:1141017/150‑1 (MQ=255) cGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGa < 2:746487/150‑1 (MQ=255) gATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGAt > 1:391898/1‑150 (MQ=255) aTAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATc < 1:962244/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAgg < 1:55581/134‑1 (MQ=255) ccAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAgg > 2:55581/1‑134 (MQ=255) aGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTgg > 2:592980/1‑150 (MQ=255) gCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGa < 2:759348/150‑1 (MQ=255) cGGGCTACCACTGCGTGATGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGAc < 2:141623/150‑1 (MQ=255) cTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAggg < 1:387362/97‑1 (MQ=255) cTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAggg > 2:387362/1‑97 (MQ=255) ccACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACt > 2:773867/1‑150 (MQ=255) ccACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACt > 2:951304/1‑150 (MQ=255) aCTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAg < 2:570059/69‑1 (MQ=255) aCTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAg > 1:570059/1‑69 (MQ=255) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCg > 2:781052/1‑150 (MQ=255) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCg < 1:592980/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCg < 1:1136616/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGtgtg > 1:407459/1‑121 (MQ=255) gTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGtgtg < 2:407459/121‑1 (MQ=255) gctgcCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCg < 2:391898/150‑1 (MQ=255) | GATAGAGACCTGATCACGGCGGATTTCAGCGATGTCGCCTTCTTCCAGGTACATGAAGCGGTCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCAGGCGCTTCACCGCCG‑CCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCG > NC_002947/6171689‑6171986 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |