Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 614,492 | A→T | 7.0% | L253Q (CTG→CAG) | ispA ← | farnesyl diphosphate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 614,492 | 0 | A | T | 7.0% | 222.4 / 5.5 | 72 | L253Q (CTG→CAG) | ispA | farnesyl diphosphate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/34); new base T (2/3); total (35/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
GGGATAGGTGAAGCTGTTTAGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATC > NC_002947/614345‑614637 | gggATAGGTGAAGCTGGTTAGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCGGGACGCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCcagc > 1:420519/1‑150 (MQ=255) ggctAGGTGAACCTGTTTACTTAGGGCGTTAGCGCATATAAGGCGCCAAGGGTCGCAGCGCCGCGGCCGTTTCGCCGAACCCTGGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCGTTGGCGGCTTCCAGGCCcagca > 2:12391/4‑150 (MQ=255) ggATAGGTGAAGCTGTTTAGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCcagca > 2:185621/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTTTAGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCgg < 1:402211/148‑1 (MQ=255) aaGCTGTTTAGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCgg > 2:402211/1‑148 (MQ=255) aGCTGTTTAGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCTGCTGGGcctggaa < 1:6581/150‑6 (MQ=255) tGTTTAGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGt < 1:506695/150‑1 (MQ=255) gTTTAGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTc < 2:325577/150‑1 (MQ=255) tttAGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCg > 2:702628/1‑150 (MQ=255) aGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGtt < 1:931603/150‑1 (MQ=255) aGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGtt < 1:987466/150‑1 (MQ=255) aGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCACAGCAGGGCCgg > 1:280676/1‑139 (MQ=255) aGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCACAGCAGGGCCgg < 2:280676/139‑1 (MQ=255) gTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGttt > 1:735322/1‑150 (MQ=255) tACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGt < 1:554518/150‑1 (MQ=255) ttCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGt > 2:69203/1‑139 (MQ=255) ttCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGt < 1:69203/139‑1 (MQ=255) gACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTAt > 2:312842/1‑150 (MQ=255) gACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTAt > 1:1159698/1‑150 (MQ=255) aaTATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTc < 2:1960/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCAcgc > 2:204967/1‑136 (MQ=255) aCGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCAcgc < 1:204967/136‑1 (MQ=255) gcgcCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCGGAACCCGTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGGCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTCGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTCGGTCGGATTGTCACGCGCTATGTCTGCACCtt > 2:269892/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGttt < 1:702628/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGcc > 1:329860/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGt < 1:686660/110‑1 (MQ=255) cTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGt > 2:686660/1‑110 (MQ=255) ggCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAgt > 2:732789/1‑150 (MQ=255) gCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTCTGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAgtg > 1:142571/1‑150 (MQ=255) tttCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGc < 1:185621/150‑1 (MQ=255) tCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCGTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCtt < 1:877514/150‑1 (MQ=255) ccGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTcc > 2:957966/1‑150 (MQ=255) cTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCgg > 2:234653/1‑76 (MQ=255) cTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCgg < 1:234653/76‑1 (MQ=255) ttGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGGTTTGAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAg < 1:12391/150‑1 (MQ=255) ttGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTc < 2:950798/102‑1 (MQ=255) ttGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTc > 1:950798/1‑102 (MQ=255) ttGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAg > 1:340238/1‑150 (MQ=255) aGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCCGTTCGATTGCATTGGCTTTGGCGTCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATg < 2:735322/150‑1 (MQ=255) tGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATgtc > 1:1116216/1‑150 (MQ=255) cgcCTGGTCGCGCAGTTGGATTGCATAGGCTTTGGCGTCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCAc < 2:498214/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTg < 2:142571/150‑1 (MQ=255) tGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTACGAGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTgg < 1:317156/150‑1 (MQ=255) gcgcAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGc < 1:732789/150‑1 (MQ=255) gcAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCa > 1:704203/1‑150 (MQ=255) aTTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTc > 2:441913/1‑113 (MQ=255) aTTGCATAGGCTTGGGCGGCTGCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTc < 1:441913/113‑1 (MQ=255) ttGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATgg < 1:312842/150‑1 (MQ=255) cATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCt < 1:957966/150‑1 (MQ=255) aTAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCg > 2:332444/1‑97 (MQ=255) aTAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCg < 1:332444/97‑1 (MQ=255) aTAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCAcc > 2:769471/1‑127 (MQ=255) aTAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCAcc < 1:769471/127‑1 (MQ=255) aGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCtgtg > 1:518176/1‑150 (MQ=255) tttGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATa < 2:420519/150‑1 (MQ=255) gcggcTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGc < 2:293793/64‑1 (MQ=255) gcggcTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGc > 1:293793/1‑64 (MQ=255) ctacccggCCCTGCTGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCtgt < 2:872865/131‑1 (MQ=255) ctacccggCCCTGCTGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCtgt > 1:872865/7‑137 (MQ=255) ttCCAGGCCCGGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAg > 1:573835/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAg > 2:710535/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCa > 2:993447/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCa > 2:989236/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCa < 2:704203/150‑1 (MQ=255) ggCCCTGCTGGGCCTGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCa > 1:821174/1‑71 (MQ=255) ggCCCTGCTGGGCCTGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCa < 2:821174/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCt < 2:133204/107‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCt > 1:133204/1‑107 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa < 2:378217/143‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa > 1:378217/1‑143 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAgg < 2:49035/145‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAgg > 1:49035/1‑145 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGc < 2:163451/147‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGc > 1:163451/1‑147 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATc > 2:324336/1‑150 (MQ=255) | GGGATAGGTGAAGCTGTTTAGTTACGGCGTTCGACAATATAACGCGCCAAGGCCCGCAGCGGCTCGGCCTTTTCGCCGAACCCTTGCAGTGCGGCCAGCGCCTGGTCGCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATC > NC_002947/614345‑614637 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |