| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 74,984 | A→C | 6.8% | I409S (ATT→AGT) | trkA ← | TrK potassium transporter NAD‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 74,984 | 0 | A | C | 6.8% | 142.9 / 2.1 | 51 | I409S (ATT→AGT) | trkA | TrK potassium transporter NAD‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/18); new base C (2/2); total (31/20) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
CCTAGAAGAAACTCAAGCCGACGTGGAACAGCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGC > NC_002947/74835‑75133 | ccTAGAAGAAACTCAAGCCGACGTGGAACAGCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCaa < 1:1043401/150‑1 (MQ=255) cTAGAAGAAACGCAAGCCGACGTGGAACAGCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTCTCGTCGTGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAAt > 1:174299/1‑150 (MQ=255) gaaACTCAAGCCGACGTGGAACAGCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAgtggt > 1:1009674/1‑150 (MQ=255) cTCAAGCCGACGTGGAACAGCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCACTATTGGTGcga < 1:507877/150‑3 (MQ=255) tCAAGCCGACGTGGAACAGCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCAGCGCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCg > 1:63247/1‑150 (MQ=255) tCAAGCCGACGTGGAACAGCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCACTATTGGTGcga < 1:5556/149‑3 (MQ=255) tCAAGCCGACGTGGAACAGCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCACTATTGGTGcga > 2:5556/1‑147 (MQ=255) aaGCCGACGTGGAACAGCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGt > 1:636751/1‑150 (MQ=255) gCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCt < 2:576947/150‑1 (MQ=255) cTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCATGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTtctc > 1:1200314/1‑150 (MQ=255) gcgAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTc > 1:921307/1‑138 (MQ=255) gcgAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTc < 2:921307/138‑1 (MQ=255) tttttATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTg > 2:883426/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) cccTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTc < 1:224781/150‑1 (MQ=255) cTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGa > 1:588675/1‑150 (MQ=255) cTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGa > 1:500012/1‑150 (MQ=255) cTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGa < 2:63247/150‑1 (MQ=255) aTCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCg > 2:417113/1‑150 (MQ=255) tCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGCTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCCTGTGCCACCGCCTCGACCGCTTCgg > 2:28534/1‑150 (MQ=255) cATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGc < 1:883426/150‑1 (MQ=255) tgtCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCAc > 1:216477/1‑150 (MQ=255) cctGGGCCATCATCACTTCTTCCTCACGGATCATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACGTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCgcggc < 2:216477/148‑1 (MQ=255) tGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGgcgc > 2:392182/1‑150 (MQ=255) tcatcaCTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGt > 2:91190/1‑150 (MQ=255) tcaCTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATc < 1:806685/119‑1 (MQ=255) tcaCTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCAGGTGCCACCGCCTCGATc > 2:806685/1‑119 (MQ=255) ttcttcGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACt > 1:592367/1‑150 (MQ=255) ttcttcGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACt > 1:519779/1‑150 (MQ=255) ttcGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGAc < 2:588675/150‑1 (MQ=255) cGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGa < 1:168959/150‑1 (MQ=255) cGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCg > 2:186560/1‑150 (MQ=255) tgatCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCac < 1:392182/150‑1 (MQ=255) gatCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCacg > 2:936111/1‑150 (MQ=255) ccgggCACCACTATTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCacg > 2:1198262/5‑150 (MQ=255) atCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCacga > 2:588230/1‑150 (MQ=255) atCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCacga < 1:710730/150‑1 (MQ=255) cACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACgacgga > 2:605776/1‑150 (MQ=255) aCCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGcaca > 2:789973/1‑127 (MQ=255) aCCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGcaca < 1:789973/127‑1 (MQ=255) aCCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACgacggac < 1:130664/150‑1 (MQ=255) aaTAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCg > 1:1145147/1‑97 (MQ=255) aaTAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCg < 2:1145147/97‑1 (MQ=255) aTAGTGGTGCCAGGTGGACGCGTGATGTCATCAATTCTCTTTCCTTCCACCTTGCTCTACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTgc < 2:734966/150‑1 (MQ=255) | CCTAGAAGAAACTCAAGCCGACGTGGAACAGCTTCTCCACATCGCGAATATGCTTTTTATCCACAACGAAGAGGATCACATGGTCCCCTGATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGC > NC_002947/74835‑75133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |