Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 672,370 | T→G | 5.7% | G474G (GGT→GGG) | PP_0573 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 672,370 | 0 | T | G | 5.7% | 231.3 / 4.3 | 80 | G474G (GGT→GGG) | PP_0573 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/36); new base G (2/3); total (41/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.87e-01 |
GACTTCCTGCGCTTGCGGCTTTCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATACCGCTCAGGCCTGGCATAACCGGGGACCGGTGGAG > NC_002947/672221‑672517 | gACTTCCTGCGCTTGCGGCTTTCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGt > 1:1183557/1‑150 (MQ=255) cgcTTGCGGCTTTCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCcgcgc < 2:211898/150‑1 (MQ=255) gcTTGCGGCTTTCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGGTAACcgcgcc < 1:50348/150‑2 (MQ=255) cTTGCGGCTTTCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGa > 1:814195/1‑150 (MQ=255) ttGCGGCTTTCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGGTGAGCGCTTGCCCGACAGGGAGCGTGCGGGGTTGGGCGGGCAGAAGTTCGGGCACGGTTACCCGCGCGAt > 1:1044191/1‑150 (MQ=255) gCGGCTTTCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCa > 1:1094562/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGGTAACcgcgcccgaaa < 1:988669/150‑7 (MQ=255) ggCTTTCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAgg < 2:1094562/150‑1 (MQ=255) ttCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGa < 2:1183557/150‑1 (MQ=255) tCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGAc > 1:784241/1‑150 (MQ=255) tCCGGTTTGCAGAGAGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTAGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGAc > 2:1200031/1‑150 (MQ=255) gagCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAggg < 1:1137849/150‑1 (MQ=255) gACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTgg < 2:784241/150‑1 (MQ=255) acacGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTggg > 2:363437/1‑150 (MQ=255) acacGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTAGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTggg < 1:1200031/150‑1 (MQ=255) cacGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTgggg > 2:658083/1‑150 (MQ=255) tgctgGATAACTTGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGGTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGAAGAATTTCGGGCGCGGTTATGCGCGCGGTCAGGCGGACGGTGCGCGTGTCTGGGGTGTgg > 1:548612/1‑150 (MQ=255) tgctgGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAgg < 1:703047/138‑1 (MQ=255) tgctgGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAgg > 2:703047/1‑138 (MQ=255) tgctgGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGTGCTGGGGTGTgg > 1:548629/1‑150 (MQ=255) tgGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCtt > 2:387996/1‑150 (MQ=255) tgGATAACTGGAAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTggg < 2:1034975/141‑1 (MQ=255) tgGATAACTGGAAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTggg > 1:1034975/1‑141 (MQ=255) ggATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTa < 1:532302/150‑1 (MQ=255) tAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGa < 1:387996/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGAAAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCt > 1:577639/1‑150 (MQ=255) aGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACt > 2:852139/1‑150 (MQ=255) aGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTAATGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGGGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTg > 2:164088/1‑127 (MQ=255) aGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTAATGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTg < 1:164088/127‑1 (MQ=255) ggtggtGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGAGCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCaagatcgg > 1:1168167/1‑144 (MQ=255) gtggtgTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGc < 2:193964/150‑1 (MQ=255) gtggtgTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGc < 1:957551/150‑1 (MQ=255) gtgtTCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATAGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGGTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTg < 1:553662/150‑1 (MQ=255) gtgtCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCCTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTg > 1:305208/1‑150 (MQ=255) ccGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGATTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATTAGTAACGTGTAGATAGGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGGGCa > 2:31108/1‑150 (MQ=255) gggCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTa < 2:1114698/150‑1 (MQ=255) tACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCtt < 1:363437/150‑1 (MQ=255) tGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTggg < 2:134172/103‑1 (MQ=255) tGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTggg > 1:134172/1‑103 (MQ=255) tGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGgt < 1:778812/105‑1 (MQ=255) tGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGgt > 2:778812/1‑105 (MQ=255) gAGTGCTGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGACAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACCAGGGCTGGTGTGTGGCTTACGAGCTCAGCTACAGCGTTCGCAGTAGATGGCCTGCGCa > 2:162576/1‑150 (MQ=255) gAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTAccc < 2:397517/69‑1 (MQ=255) gAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTAccc > 1:397517/1‑69 (MQ=255) ggTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAg < 2:348253/149‑1 (MQ=255) tgatCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCa > 1:313854/1‑150 (MQ=255) tgacCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCCGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGAGCGCAGTAGATGGCCTCCGCGGGATCa > 2:66650/1‑150 (MQ=255) atCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAAc > 2:918400/1‑150 (MQ=255) tCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAAcc < 1:918400/150‑1 (MQ=255) gCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGCGACGAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCt > 1:293292/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTAt > 2:418865/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCggtggt < 2:814195/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCggtggt < 1:66650/150‑1 (MQ=255) agcgagcgTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGgtggtg > 1:471208/1‑150 (MQ=255) agcgagcgTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGCGACGAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGgtggtg < 2:293292/150‑1 (MQ=255) gagcgTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGAt > 2:867680/1‑150 (MQ=255) gagccTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGAt < 2:305208/150‑1 (MQ=255) agcgTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATa < 2:471208/150‑1 (MQ=255) ggggTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGGAGGGTTACCCGCGCGATCCGGCGGACGGTTACAAGGGCTGGGGTGTGGTTTGCGAGCTCGACTACAGCGCGCGCCGTAGTTGGCTTGCGCCGGTTCAACCCTATGCCGTGGTGGGTCCCGCGCa < 2:1044191/150‑1 (MQ=255) ggggTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGAt > 2:285605/1‑107 (MQ=255) ggggTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGAt < 1:285605/107‑1 (MQ=255) gggTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATACCGCTCAg < 1:900932/150‑1 (MQ=255) tttGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGTTTACGAGCTCAACTACAGCGTGGGCAGTAGATGGCTTGCGAAGGTTCAACCCTATGCGGT‑GTGGATACCGCTCAGGCCt < 1:852139/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGAGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATTCGGTGGTGGATACCGCTCAGGCCTg < 1:162576/150‑1 (MQ=255) cGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCCAGTCATTGGTGGATACCGCTCAGGCCTGGCa < 1:31108/150‑1 (MQ=255) gCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATgg < 2:986717/97‑1 (MQ=255) gCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATgg > 1:986717/1‑97 (MQ=255) cAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATACCGCTCAGGCCTGGCATAAc > 1:536485/1‑150 (MQ=255) aGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATACCGCTCAGGCCTg > 2:577388/1‑142 (MQ=255) aGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATACCGCTCAGGCCTg < 1:577388/142‑1 (MQ=255) gAATTTCGGGGGGCGTTATCCGCGCAGTCAGGGGGATGGTGGAAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATACCGCTCAGGCCTGGCATAACCg < 2:577639/150‑1 (MQ=255) tttCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGAAGGTGATCCGGGGTGACGACTGACTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGTATACTGCTCAGGCCTGGCATAACCgggg > 1:510797/1‑150 (MQ=255) tgatcgcgcGGGTAACCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATACCGCTCAGGCCTGGCATAACCGGGGa > 2:510593/6‑150 (MQ=255) 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ggTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATACCGCTCAGGc > 2:309986/1‑125 (MQ=255) ggTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATACCGCTCAGGCCTGGCATAACCGGGGACCGGTggag > 1:772835/1‑150 (MQ=255) | GACTTCCTGCGCTTGCGGCTTTCCGGTTTGCAGAGCGACACGCTGCTGGATAACTGGCAGGGGGTGGTGTCCGGGGCGTTGTACTGGAGTGATGATCGCTTGCCCGACAGCGAGCGTGCGGGGTTTGGCGGGCAGAATTTCGGGCGCGGTTACCCGCGCGATCAGGCGGACGGTGACAAGGGCTGGGGTGTGGCTTACGAGCTCAACTACAGCGTGCGCAGTAGATGGCTTGCGCAGGTTCAACCCTATGCGGTGGTGGATACCGCTCAGGCCTGGCATAACCGGGGACCGGTGGAG > NC_002947/672221‑672517 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |