Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 727,935 | C→A | 5.8% | E145* (GAG→TAG) | bamD ← | outer membrane protein assembly factor BamD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 727,935 | 0 | C | A | 5.8% | 217.9 / 3.0 | 69 | E145* (GAG→TAG) | bamD | outer membrane protein assembly factor BamD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/34); new base A (2/2); total (33/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.97e-01 |
GGCAGCCGCTACATAAGCCTGGCGGCTCAGGTAGTAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCGACGTTCGGGTGCTGCGGGTGCAGG > NC_002947/727786‑728080 | ggCAGCCGCTACATAAGCCTGGCGGCTCAGGTAGTAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTc < 2:1052889/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCTACATAAGCCTGGCGGCTCAGGTAGTAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGt > 1:1195925/1‑150 (MQ=255) cTACATAAGCCTGGCGGCTCAGGTAGTAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACg > 1:388800/1‑150 (MQ=255) tACATAAGCCTGGCGGCTCAGGTAGTAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTGGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTGGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTAAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGa > 2:58262/1‑150 (MQ=255) tACATAAGCCTGGCGGCTCAGGTAGTAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGAGCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGa > 2:58183/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGCGGCTCAGGTAGTAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTcgcg < 2:24893/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGCTCAGGTAGTAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCgcgggc < 2:479034/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGCTCAGGTAGTAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCgcgggc > 2:697984/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCTCAGGTAATAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCgcgggcg < 1:339343/150‑1 (MQ=255) gcggcTCAGGTAGTAGTCGGCCACACGATCCACGTACGAAGCCAGCAGGTTGAGCAGGTAGATAATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGATGGGGAAGCGGCTGGGCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGggcggc > 1:31900/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGCCGCCCgcgac < 2:552850/143‑5 (MQ=255) tCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGCCGCCCgcgac > 1:552850/1‑139 (MQ=255) cACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGa > 1:90522/1‑117 (MQ=255) cACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGa < 2:90522/117‑1 (MQ=255) cACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCAt < 1:38872/150‑1 (MQ=255) cACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCAt > 1:911697/1‑150 (MQ=255) cACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCAt < 2:388800/150‑1 (MQ=255) ttCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCgg < 1:637387/150‑1 (MQ=255) tCGTACGAATCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGAGCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTGGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGc < 1:1153004/150‑1 (MQ=255) ggAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGaa < 1:107880/149‑1 (MQ=255) aaGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCgcgggc > 2:80724/1‑109 (MQ=255) aaGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCgcgggc < 1:80724/109‑1 (MQ=255) gCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAgcgc < 2:1116553/150‑1 (MQ=255) cagcagGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAgcgcgc > 1:913732/1‑150 (MQ=255) agcagGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTAGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCAt > 1:60491/1‑128 (MQ=255) agcagGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTAGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCAt < 2:60491/128‑1 (MQ=255) cagGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCcag < 2:1195925/150‑1 (MQ=255) gcAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGTGGCAGTAGGGGTAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCAc > 1:210479/1‑150 (MQ=255) aGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTAc < 2:294644/81‑1 (MQ=255) aGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTAc > 1:294644/1‑81 (MQ=255) aGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACgg < 2:913732/150‑1 (MQ=255) gTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTc > 2:157589/1‑150 (MQ=255) gctgctTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACg > 2:563783/1‑150 (MQ=255) tgctTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGt > 2:407059/1‑88 (MQ=255) tgctTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGt < 1:407059/88‑1 (MQ=255) tgctTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAg < 2:911697/150‑1 (MQ=255) cGTCTGGCGCATAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGTTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTg > 1:1149747/1‑89 (MQ=255) cGTCTGGCGCATAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTg < 2:1149747/89‑1 (MQ=255) gtGGCCCGTAGCGGCTGTTGGGTAAGCGGCTGGTCAGCGGGGTGAACTCGGTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCTCGGGTCACGCTTGGTCGTGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCACGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCt < 2:61699/149‑1 (MQ=255) cgcgTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCCTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAAGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAg < 1:697984/150‑1 (MQ=255) gcgTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAg < 1:231635/149‑1 (MQ=255) gcgTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAg > 2:231635/1‑149 (MQ=255) gCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGgtagta < 2:762352/150‑1 (MQ=255) gCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGgtagta > 1:90168/1‑150 (MQ=255) gCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGgtagta > 1:806031/1‑150 (MQ=255) cGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGTCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGACCACCGCTAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGtagtag < 1:633590/150‑1 (MQ=255) cGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGAAGGCAGCGCGCAACCAGCACAAGATGCTCGGCTAACAAGGTCATGCCCTTGAGGtagtag > 2:132403/1‑150 (MQ=255) ggtggtGGGGAAGGGCCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCAAGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGc < 1:58262/145‑1 (MQ=255) gCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTcc > 1:852071/1‑115 (MQ=255) gCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTcc < 2:852071/115‑1 (MQ=255) gCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGc < 1:58183/150‑1 (MQ=255) tGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCAt > 2:208681/1‑76 (MQ=255) tGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCAt < 1:208681/76‑1 (MQ=255) tGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCgg > 1:505598/1‑149 (MQ=255) gggAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGTGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAGGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGAATGAGGCGTAATCg > 1:548273/1‑150 (MQ=255) gggAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCg > 2:341930/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGTTCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCGAc > 1:1181721/1‑150 (MQ=255) ttGGTCAGCGGGCCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGTGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCGACGTTCggg < 2:548273/149‑1 (MQ=255) cTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCGACGTTCggg > 1:856931/1‑150 (MQ=255) cTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCGACGTTCcgg < 2:806031/150‑1 (MQ=255) tGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCGACGTTCGGGt < 2:210479/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGAACTAGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAg < 1:88238/119‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGAACTAGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAg > 2:88238/1‑119 (MQ=255) aGCTGGGCGAACTAGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAg > 2:87904/1‑119 (MQ=255) aGCTGGGCGAACTAGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAg < 1:87904/119‑1 (MQ=255) cTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGGAGTAGGTGTAATCGACGCTCGGGTGCTGCgg > 2:152400/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTACCACATGGTAATGTCCAGGGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCGACGTTCGGGTGCTGCgg < 2:31900/150‑1 (MQ=255) tGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCGACGTTCGGGTGCTGCggg > 2:102634/1‑150 (MQ=255) gggCGAACTCGTTGTCCGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTGACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCGACGTTCGGGTGCTGCGGGt < 2:89926/150‑1 (MQ=255) taCTCGTTGTCCGAGTCGCGGGCGGTGCACGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGTCCCTTGGGGTAGTAGGCGTAATCGACGTTCGGGTGCTGCGGGTGCAgg < 2:505598/149‑1 (MQ=255) | GGCAGCCGCTACATAAGCCTGGCGGCTCAGGTAGTAGTCGGCCACGTGGATTTCGTACGAAGCCAGCAGGTTGCGCAGGTAGATCATGCGCTGCTTGGCGTCTGGCGCGTAGCGGCTGTTGGGGAAGCGGCTGGTCAGCTGGGCGAACTCGTTGTACGAGTCGCGGGCGGCGCCCGGGTCACGCTTGGTCATGTCCAGCGGCAGGAAGCGCGCCAGCAGGCCACGGTCCTGGTCGAACGAGGTCAGGCCCTTGAGGTAGTAGGCGTAATCGACGTTCGGGTGCTGCGGGTGCAGG > NC_002947/727786‑728080 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |