| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 821,682 | G→C | 10.8% | M350I (ATG→ATC) | PP_0707 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 821,682 | 0 | G | C | 10.8% | 224.0 / 15.9 | 75 | M350I (ATG→ATC) | PP_0707 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/31); new base C (4/4); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
GTGGTGTTCAGTGCCTTCATCACAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAGCATGACCTGGAGCG > NC_002947/821536‑821831 | gtggtgTTCAGTGCCTTCATCACAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCatgatg > 2:773966/1‑150 (MQ=255) tCAGTGCCTTCATCACAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATCATGACCAtca < 1:699216/150‑3 (MQ=255) aGTGCCTTCATCACAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAg < 1:213512/150‑1 (MQ=255) ccTTCATCACAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCa < 2:1031533/150‑1 (MQ=255) cTTCATCACAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAgc < 1:536622/146‑1 (MQ=255) cTTCATCACAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAgc > 2:536622/1‑146 (MQ=255) ttCATCACAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGGTCGACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATg > 2:106041/1‑150 (MQ=255) ttCATCACAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATg > 2:1025597/1‑150 (MQ=255) tcaCAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACa > 2:677471/1‑150 (MQ=255) acaGGCGTGGGCCGCGGCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGTCGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATTATGACCATGGAGCGCATGAACAGc < 2:440986/150‑1 (MQ=255) acaGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGc > 2:507848/1‑150 (MQ=255) ggCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCGGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCAAGGATCGCGTGAACAGtgtggttctt > 2:561286/1‑144 (MQ=255) ccGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGc > 1:1018874/1‑150 (MQ=255) gcCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGc > 2:231298/1‑150 (MQ=255) atgctgatgctgCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGATGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTg > 1:243427/1‑150 (MQ=255) gctgatgctgCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGgc < 1:657606/150‑1 (MQ=255) gatgctgCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCt > 1:512738/1‑150 (MQ=255) gatgctgCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCt < 1:424537/150‑1 (MQ=255) ctgcAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACg > 1:430021/1‑150 (MQ=255) gcAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGt < 1:561286/150‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCTCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTgg < 1:812763/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAATAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACg > 1:703191/1‑150 (MQ=255) cTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACgg > 2:411805/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACTATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACggg < 2:292633/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACggg < 1:150577/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCt > 1:509938/1‑150 (MQ=255) cGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCgcgc < 2:512738/150‑1 (MQ=255) ggCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCt > 2:448065/1‑150 (MQ=255) gATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCtggt > 1:399019/1‑150 (MQ=255) gATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCtggt > 1:1200080/1‑150 (MQ=255) cACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCtggtggtg > 1:9233/1‑150 (MQ=255) acgacgAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCAt > 2:536080/1‑73 (MQ=255) acgacgAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCAt < 1:536080/73‑1 (MQ=255) acgacgAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCtggtggtgg < 2:681577/150‑1 (MQ=255) gactaAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGgcg > 2:903301/1‑150 (MQ=255) acgaAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGgcgc < 2:430021/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCt < 2:509938/150‑1 (MQ=255) ccAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACa < 1:747154/75‑1 (MQ=255) ccAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACa > 2:747154/1‑75 (MQ=255) aGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCa < 2:159998/150‑1 (MQ=255) gTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAg < 1:773966/150‑1 (MQ=255) cgcTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGgcg < 2:703191/150‑1 (MQ=255) gctgggctggTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGgcgc < 1:411805/150‑1 (MQ=255) tgggctggTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCGGTGCAGgcgcgc < 2:1200080/150‑1 (MQ=255) gggctggTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCgct > 1:1088318/1‑150 (MQ=255) ctggTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGTCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCgctgct < 1:903301/150‑1 (MQ=255) ggTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGACACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCtgt > 2:195517/1‑150 (MQ=255) gTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCtgtg > 2:39590/1‑150 (MQ=255) ttCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTgtgt > 1:538178/1‑150 (MQ=255) cGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGtt < 2:851683/147‑1 (MQ=255) cGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGtt > 1:851683/1‑147 (MQ=255) gTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAAc < 2:760908/90‑1 (MQ=255) gTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAAc > 1:760908/1‑90 (MQ=255) cTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCAcc < 2:1018874/150‑1 (MQ=255) tGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCtgt > 2:224604/1‑135 (MQ=255) tGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCtgt < 1:224604/135‑1 (MQ=255) ggCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGc > 1:449138/1‑120 (MQ=255) ggCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGc < 2:449138/120‑1 (MQ=255) aTTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTgcg > 2:654211/1‑150 (MQ=255) gCACTGATGGTCATGATGACCATGGGGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCAGCACCCTGCGCAAg > 1:56950/1‑150 (MQ=255) gCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAg > 2:63771/1‑150 (MQ=255) gCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAg < 2:9233/150‑1 (MQ=255) gctccaTGGTCATCATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCtgt > 2:580598/6‑126 (MQ=255) gctccaTGGTCATCATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCtgt < 1:580598/121‑1 (MQ=255) gctccaTGGTCATCATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAGc > 2:158318/6‑150 (MQ=255) aCTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCtggtggtg > 1:873201/1‑97 (MQ=255) aCTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCtggtggtg < 2:873201/97‑1 (MQ=255) aCTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAGCa > 1:1106201/1‑150 (MQ=255) tccaTGGTCATCATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACggg > 2:215255/4‑78 (MQ=255) tccaTGGTCATCATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACggg < 1:215255/75‑1 (MQ=255) cTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAGCAt < 1:507848/150‑1 (MQ=255) aTGGTCATCATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAg > 2:1187263/1‑109 (MQ=255) aTGGTCATCATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAg < 1:1187263/109‑1 (MQ=255) gTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCTGCGTTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTAACGCCGCACCCTGCGCAAGCATGACCTg > 1:866825/1‑150 (MQ=255) gTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAGCATGACCTg < 1:106041/150‑1 (MQ=255) cATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCCAAGGGCGGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAGCATGACCTGGa < 1:677471/150‑1 (MQ=255) gatgaCCATGTAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGAGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAGCATGACCTGGAgcg > 2:868417/1‑150 (MQ=255) gatgaCCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAGCATGACCTGGAgcg > 1:976255/1‑150 (MQ=255) | GTGGTGTTCAGTGCCTTCATCACAGGCCTGGGCCGCGCCATGCTGATGCTGCAGCGTCCGTCCTGGCGGTTGCCGGCGATCCACGACGAAGTCGCCAGTGCGCTGGGCTGGTTCCCGAAGGTGCTGGCATTGGCACTGATGGTCATGATGACCATGGAGCGCATGAACAGCGTGATCGGTGCCAGCCTGGCGCTGACGGTGGCCGTCAACGGGCTGACCGCGCTGGTGGTGGCGCTCACCTTTGCAGGCGCGCTGCTGTGTTACCGCCGCACCCTGCGCAAGCATGACCTGGAGCG > NC_002947/821536‑821831 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |