| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 991,560 | T→C | 8.1% | I60T (ATC→ACC) | der → | GTPase Der |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 991,560 | 0 | T | C | 8.1% | 168.8 / 4.0 | 61 | I60T (ATC→ACC) | der | GTPase Der |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/29); new base C (2/3); total (29/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 | |||||||||||
GAACGTCGGCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCACCTGCGCAAGCGGA > NC_002947/991414‑991709 | gAACGTCGGCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCCGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCAc < 2:534012/150‑1 (MQ=255) aCGTCGGCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCAcca < 2:97972/150‑2 (MQ=255) cGGCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGa < 1:207512/150‑1 (MQ=255) ggCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGTCACCGGTGATACCACCGGTgtc < 2:874216/150‑3 (MQ=255) ggCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGTCACCGGTGATACCACCGGTgtc < 1:239508/150‑3 (MQ=255) cAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGa > 2:963370/1‑150 (MQ=255) accaTGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGc > 2:1008717/1‑150 (MQ=255) aTGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATg < 1:963370/150‑1 (MQ=255) ttCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTTACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGAc < 1:12480/150‑1 (MQ=255) ttCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGAc > 2:12480/1‑150 (MQ=255) cccGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTTTGCTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGaaa < 1:981062/149‑1 (MQ=255) gCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCgg < 2:995925/124‑1 (MQ=255) gCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCgg > 1:995925/1‑124 (MQ=255) ccTGACCAAGCCCCGCGAGGCCACCGTCGTAGACCTTTCTGTCCTGACCCGTTACTGCCAGTATGGTGATGCCAGCTTGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGTTGTCGAATTGGACATGGACTAAAAAAt < 2:133045/150‑1 (MQ=255) cAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGa > 1:246505/1‑150 (MQ=255) ccccGCCACGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAg < 2:633333/149‑1 (MQ=255) cccGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGt < 2:1134692/150‑1 (MQ=255) gcgATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTg < 2:287138/111‑1 (MQ=255) gcgATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTg > 1:287138/1‑111 (MQ=255) gcgATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGc < 1:348325/150‑1 (MQ=255) gCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGAAAAAAAAAAAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATg < 2:1034549/150‑1 (MQ=255) ccATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATgg > 2:1084289/1‑150 (MQ=255) gtcgGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCAtt > 1:963541/1‑150 (MQ=255) tcgGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCg < 1:1033482/96‑1 (MQ=255) tcgGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCg > 2:1033482/1‑96 (MQ=255) ggTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTgaa > 1:527583/1‑150 (MQ=255) tCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGAc > 1:842952/1‑150 (MQ=255) ggCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAt < 2:570132/150‑1 (MQ=255) cTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTAtgtg < 1:1084289/150‑1 (MQ=255) aCCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTg > 1:566435/1‑150 (MQ=255) ccGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGa > 2:24354/1‑108 (MQ=255) ccGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGa < 1:24354/108‑1 (MQ=255) ccGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGtt > 1:459256/1‑150 (MQ=255) cAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGAt > 2:907973/1‑150 (MQ=255) gTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGc < 2:459256/150‑1 (MQ=255) tATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTACCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGcc > 2:1483/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTACCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTAt < 1:1483/150‑1 (MQ=255) aGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGTTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTACTgg > 1:1152381/1‑130 (MQ=255) aGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTgg < 2:1152381/130‑1 (MQ=255) aGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATg > 2:246488/1‑150 (MQ=255) gCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGa < 2:842952/150‑1 (MQ=255) tGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCggg > 2:660242/1‑143 (MQ=255) tGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCggg < 1:660242/143‑1 (MQ=255) gTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGAcc > 2:775903/1‑150 (MQ=255) tCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAg < 2:963541/150‑1 (MQ=255) ccTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAga < 1:480294/150‑1 (MQ=255) cTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCCTCGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAgat > 2:639630/1‑150 (MQ=255) cTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACGATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCACGTGCGGGTACCCCTGCTGCATACCAcat > 2:1162900/1‑150 (MQ=255) ttCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGt < 2:713510/113‑1 (MQ=255) ttCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGt > 1:713510/1‑113 (MQ=255) ttCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAgatg > 1:1158323/1‑150 (MQ=255) tCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGa < 1:162300/142‑1 (MQ=255) tCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGa > 2:162300/1‑142 (MQ=255) tGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTgaagaa > 2:1098458/1‑83 (MQ=255) tGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTgaagaa < 1:1098458/83‑1 (MQ=255) tGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCg < 2:566435/150‑1 (MQ=255) aTCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGa > 2:966720/1‑124 (MQ=255) aTCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGa < 1:966720/124‑1 (MQ=255) tcacCGGTGATACCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCAcc > 1:701465/2‑150 (MQ=255) acacCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCAcc > 1:624832/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGTATCACCGGTGATGAAGTTGGCAGGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGGAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAACACCTgc < 1:1008717/150‑1 (MQ=255) tCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCACCTGCGCAAGCGGa > 2:1102878/1‑150 (MQ=255) | GAACGTCGGCAAATCCACCATGTTCAACCGCCTGACCAAGACCCGCGATGCCATCGTCGGTGACCTGTCGGGCCTGACCCGTGACCGCCAGTATGGTGATGCCAGCTGGCAGGGTCGTTCCTTCATCCTGATCGACACCGGTGGTATCACCGGTGACGAAGTGGGCATGGACGAAAAAATGGCCGAGCAGTCGCTCATGGCCATTGAAGAAGCCGACTATGTGCTGTTCCTGGTTGATGCCCGTGCGGGTATGACTGCGGCAGACCAGATGATCGCCGAGCACCTGCGCAAGCGGA > NC_002947/991414‑991709 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |