Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 997,221 | C→T | 6.7% | L126L (CTG→CTA) | PP_0860 ← | sulfite reductase flavoprotein subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 997,221 | 0 | C | T | 6.7% | 210.0 / 3.1 | 70 | L126L (CTG→CTA) | PP_0860 | sulfite reductase flavoprotein subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/31); new base T (3/2); total (37/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGCCCAGTCGAAGGTCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGCGTTGCCTTCGCGGACATCGA > NC_002947/997073‑997369 | tGGCCCAGTCGAAGGTCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCa < 2:729937/150‑1 (MQ=255) ccAGTCGAAGGTCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCtt < 2:303378/150‑1 (MQ=255) gTCGAAGGTCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGTAGCTTGAg > 1:818453/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGc < 1:905807/150‑1 (MQ=255) cGAAGGTCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCa > 2:480463/1‑150 (MQ=255) gAAGGTCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCAt > 2:1006754/1‑150 (MQ=255) gAAGGTCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCAGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCAt > 1:1115461/1‑150 (MQ=255) aGGTCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGa < 1:186361/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGt > 2:478151/1‑150 (MQ=255) cAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGtt < 1:1117220/150‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGaagaag < 1:998925/150‑1 (MQ=255) tGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGc < 1:469947/150‑1 (MQ=255) gcCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCtt > 1:1134984/1‑150 (MQ=255) ccAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTg > 1:278444/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCgg < 2:685778/150‑1 (MQ=255) tttGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGtt > 2:623375/1‑126 (MQ=255) tttGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGtt < 1:623375/126‑1 (MQ=255) tGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCAc < 2:278444/150‑1 (MQ=255) gcgcGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCAcc < 1:1012633/150‑1 (MQ=255) cgcagCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCt < 2:1115461/146‑1 (MQ=255) aGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGccc < 1:617903/150‑1 (MQ=255) aGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCAGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGccc > 2:231267/1‑150 (MQ=255) gTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCttt < 1:433196/138‑1 (MQ=255) gTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCttt > 2:433196/1‑138 (MQ=255) gCCGGACTGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACgg > 1:501978/1‑150 (MQ=255) tgACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCATCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCAGAGTGACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTc < 1:635363/149‑1 (MQ=255) aCAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCATCTTGAGCATGAGGTTGGGGAAGCCGTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCga > 2:635363/1‑149 (MQ=255) gCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGtt < 1:682575/128‑1 (MQ=255) gCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGtt > 2:682575/1‑128 (MQ=255) gCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTAGGCATa > 1:851444/1‑150 (MQ=255) gCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTACCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATa > 2:718293/1‑150 (MQ=255) cAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGTAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAg < 2:818453/150‑1 (MQ=255) agaagaACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGTAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAgc > 2:944594/1‑150 (MQ=255) agaagaACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCAAGTATCGCACCCGAAGAGGAAACGGCATTGCAGGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAgc > 1:1052418/1‑150 (MQ=255) cacCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTc > 2:843658/1‑150 (MQ=255) acCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCCTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCg < 1:351776/150‑1 (MQ=255) ccAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCAc < 1:695854/108‑1 (MQ=255) ccAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCAc > 2:695854/1‑108 (MQ=255) cAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGGGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGTTCGGCATAGCGCAGCTCGcc > 2:109324/1‑150 (MQ=255) cAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGcc > 1:392895/1‑150 (MQ=255) cAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGcc > 1:372911/1‑150 (MQ=255) ggTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGTAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTc < 1:944594/150‑1 (MQ=255) gTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCCCgggcgaac < 2:1052418/150‑7 (MQ=255) ggCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGGGTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCCTTGAGTTCGCCCGGGTACGGATCGGCATAACGCAGCTCGACACGGCGGTCGCACgg > 2:64276/1‑150 (MQ=255) tCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGATCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGgggc > 1:861220/1‑150 (MQ=255) cGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGt > 2:153662/1‑137 (MQ=255) cGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGt < 1:153662/137‑1 (MQ=255) cGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGgggcgg < 2:1063374/150‑1 (MQ=255) agTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGTTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGgggcggg > 2:830829/2‑150 (MQ=255) ccGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATgaagaa < 1:1199446/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGc < 1:155798/35‑1 (MQ=255) ggCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGc > 2:155798/1‑35 (MQ=255) ggCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAagaaga < 1:718293/150‑1 (MQ=255) gTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGt < 1:480463/150‑1 (MQ=255) tCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGACTTCGGCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCa > 1:85777/1‑150 (MQ=255) gCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGc < 2:596957/150‑1 (MQ=255) cATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGCGtt < 1:583707/150‑1 (MQ=255) aTGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGt < 2:396939/141‑1 (MQ=255) aTGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGt > 1:396939/1‑141 (MQ=255) tGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGTGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGCGTTGc < 1:231267/150‑1 (MQ=255) gAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGc > 2:829607/1‑91 (MQ=255) gAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGc < 1:829607/91‑1 (MQ=255) gAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGCGTTGCCTTcgcg > 1:806689/1‑150 (MQ=255) aaCGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGCGTTGCCTTCGCGGa > 2:701056/1‑150 (MQ=255) aaCGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGCGTTGCCTTCGCGGa > 1:1006091/1‑150 (MQ=255) aCGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGCGTTGCCTTCGCGGAc > 2:431023/1‑150 (MQ=255) aCGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGCGTTGCCTTCGCGGAc > 2:431003/1‑150 (MQ=255) ggTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGgggcgg > 2:593819/1‑111 (MQ=255) ggTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGgggcgg < 1:593819/111‑1 (MQ=255) gCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGCGTTGCCTTCGCGGACATCGa > 1:1184179/1‑150 (MQ=255) | TGGCCCAGTCGAAGGTCAGCCAGGTGCGCCAGTCCAGCGCTTTGCGCGGCCAGCGCAGGTACAGGCCGGACAGGCAGAAGAACACCAGCATCAGGGTGCAGGCTCCGGTGATTTGCCGGCCAGTATCGCCCATGGCGAGGAAACGGTGCAGCTTGAGCATGAGGTTGAAGAAGCCTTGCCCGGCCGCTTCACCTTTGAGTTCGCCCGTGTACGGGTCGGCATAGCGCAGCTCGCCACGGCGTTCGCCCGGGGCGGGCATGAAGAAGACCCGTGCAGCGTTGCCTTCGCGGACATCGA > NC_002947/997073‑997369 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |