Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,628,430 | G→T | 15.1% | G17C (GGC→TGC) | clpP → | ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,628,430 | 0 | G | T | 15.1% | 174.6 / 19.0 | 67 | G17C (GGC→TGC) | clpP | ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/24); new base T (5/5); total (37/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.38e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.44e-01 |
AGTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAACTGCTGTTC > NC_002947/2628286‑2628579 | aGTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAggcggc < 2:712344/150‑1 (MQ=255) aCGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCGCAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCt < 1:1156481/148‑1 (MQ=255) aCGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCt > 2:1156481/1‑148 (MQ=255) ctctcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATg < 2:402674/150‑1 (MQ=255) tcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGtt > 1:312518/1‑150 (MQ=255) ccTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAg > 1:464587/1‑120 (MQ=255) ccTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAg < 2:464587/120‑1 (MQ=255) acaAGACAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGAGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCACGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGAAATCCAGGCCGCAGGCGACCTGGTCCCGATGGATATAGAGCAGTCCGca > 2:40169/1‑149 (MQ=255) cagccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTggat > 2:15012/1‑118 (MQ=255) cagccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTggat < 1:15012/120‑3 (MQ=255) cagccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGc > 1:184866/1‑150 (MQ=255) agccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCt > 2:864268/1‑115 (MQ=255) agccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCt < 1:864268/115‑1 (MQ=255) agccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATgg < 1:288813/126‑1 (MQ=255) agccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATgg > 2:288813/1‑126 (MQ=255) agccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCg > 2:1076044/1‑150 (MQ=255) cTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAAc < 2:738619/150‑1 (MQ=255) cTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAAc > 2:97150/1‑150 (MQ=255) tGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCACGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTAc < 1:40169/150‑1 (MQ=255) ttGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACa > 1:765374/1‑150 (MQ=255) cGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTg > 1:630055/1‑96 (MQ=255) cGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTg < 2:630055/96‑1 (MQ=255) aTTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTcg > 1:381075/1‑150 (MQ=255) cAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCgcgc < 2:765374/150‑1 (MQ=255) aGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCt > 1:94273/1‑150 (MQ=255) cATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTgga > 1:1198516/1‑86 (MQ=255) cATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTgga < 2:1198516/87‑2 (MQ=255) cATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGtt > 2:58807/1‑150 (MQ=255) aTGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTggat > 1:301842/1‑85 (MQ=255) aTGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTggat < 2:301842/87‑3 (MQ=255) aTGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTAAGCAGAGCTGTTACATCCAGGAAGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCTCGTGGCGAACGAGCTTACGAAATCTACTCGTGTttgttg > 2:469824/1‑150 (MQ=255) tGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGAc > 1:403253/1‑131 (MQ=255) tGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGAc < 2:403253/131‑1 (MQ=255) gACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGaa < 2:1051826/150‑1 (MQ=255) tttGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGc > 2:397324/1‑150 (MQ=255) aGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGa < 1:667978/150‑1 (MQ=255) gTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGAt < 2:381075/150‑1 (MQ=255) aGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTgg > 1:582418/1‑150 (MQ=255) ggACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATc < 1:629573/142‑1 (MQ=255) ggACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATc > 2:629573/1‑142 (MQ=255) gACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGtt < 2:94273/150‑1 (MQ=255) tCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCg < 1:1076044/150‑1 (MQ=255) cGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCtt < 2:827137/94‑1 (MQ=255) cGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCtt > 1:827137/1‑94 (MQ=255) cGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTa > 2:294630/1‑150 (MQ=255) gCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTag > 2:784437/1‑150 (MQ=255) gCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTag > 2:1154577/1‑150 (MQ=255) aaTTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTc > 2:163783/1‑104 (MQ=255) aaTTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTc < 1:163783/104‑1 (MQ=255) ttCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGa < 2:312518/150‑1 (MQ=255) ttATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCAGGAagagcacac > 1:78841/1‑145 (MQ=255) tataTTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCgg > 2:1187542/1‑139 (MQ=255) tataTTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCgg < 1:1187542/139‑1 (MQ=255) tataTTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTAc < 2:727520/150‑1 (MQ=255) atatTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACa < 1:97150/150‑1 (MQ=255) tatTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGATTAGTTTGTTAATGGTGAAGGGGCTTCCGAGATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACAt < 2:298790/150‑1 (MQ=255) cagAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAAc > 2:797637/1‑150 (MQ=255) tctGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCtcgtc > 1:178755/1‑150 (MQ=255) tGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGaa > 1:1134873/1‑93 (MQ=255) tGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGaa < 2:1134873/93‑1 (MQ=255) cATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTgc < 2:582418/150‑1 (MQ=255) aTCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTgcg > 1:38148/1‑150 (MQ=255) accAGGCCGCCTGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTagag > 1:294652/2‑122 (MQ=255) accAGGCCGCCTGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTagag < 2:294652/121‑1 (MQ=255) cAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGCTGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCaa > 2:623345/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCaa > 2:795270/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCaa > 1:1087816/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCtcgtc < 2:1166234/140‑1 (MQ=255) aGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCtcgtc > 1:1166234/1‑140 (MQ=255) cAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAACTGCTGt < 1:259038/150‑1 (MQ=255) ggcggcCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCCCCCTCGTCGTTGCGCAACTGCTGTTc < 2:1149393/150‑1 (MQ=255) | AGTAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCAGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGCAACTGCTGTTC > NC_002947/2628286‑2628579 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |