Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,553,312 | A→T | 11.2% | L553Q (CTG→CAG) | PP_4041 ← | glycoside hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,553,312 | 0 | A | T | 11.2% | 204.4 / 15.5 | 71 | L553Q (CTG→CAG) | PP_4041 | glycoside hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/32); new base T (5/3); total (36/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.10e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.93e-01 |
ATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAGGCCGTCGCTGCAG > NC_002947/4553168‑4553458 | aTTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATAATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAgg > 2:268691/1‑150 (MQ=255) cTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGaa < 2:85546/150‑2 (MQ=255) cTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAg < 2:526760/150‑1 (MQ=255) tACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAgg < 2:310803/150‑1 (MQ=255) cccACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGCGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTc < 1:703665/150‑1 (MQ=255) acagtgcCCGG‑CGCGCGACCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGc > 2:99246/6‑150 (MQ=255) acagtgcCCGG‑CGCGCGACCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGGCGttcg > 1:1108948/6‑148 (MQ=255) ccgcgCCCGGTCGCCCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGca < 1:199402/149‑1 (MQ=255) cGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTg < 1:481893/150‑1 (MQ=255) ctcgcgGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGACGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAgcgc < 1:932935/148‑1 (MQ=255) gcgGTGCAGATTCAGCGCGGCGTTGATGATGCCTGTCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAGGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGCTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGGGGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCtaa > 2:932935/1‑148 (MQ=255) gCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCtt < 2:628553/150‑1 (MQ=255) aGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTg < 1:437397/150‑1 (MQ=255) aTTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGc > 1:513751/1‑150 (MQ=255) gcgcGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTctggcctggc > 2:402883/1‑150 (MQ=255) gcgGTGTTGATAATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGgcgc < 1:268691/150‑1 (MQ=255) gaggTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGgcgc > 2:481758/3‑150 (MQ=255) gtgtTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGcccc < 1:24263/150‑1 (MQ=255) ttGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCTGCTGGCCgcaca > 2:237287/1‑87 (MQ=255) ttGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCTGCTGGCCGaaca < 1:237287/91‑4 (MQ=255) ttGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGt > 1:628990/1‑150 (MQ=255) gCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGc < 1:423783/89‑1 (MQ=255) gCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGc > 2:423783/1‑89 (MQ=255) gCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATa > 2:630274/1‑150 (MQ=255) tATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAAc < 2:377468/150‑1 (MQ=255) tCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTAAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCttt < 2:1137675/121‑1 (MQ=255) tCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTAAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCttt > 1:1137675/1‑121 (MQ=255) cTGGCTGAAAGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTc < 1:121722/150‑1 (MQ=255) tGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTca < 1:481758/150‑1 (MQ=255) cTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGc < 1:588378/67‑1 (MQ=255) cTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGc > 2:588378/1‑67 (MQ=255) tGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAgg < 2:1010374/71‑1 (MQ=255) tGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAgg > 1:1010374/1‑71 (MQ=255) tGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGcac < 1:653129/80‑1 (MQ=255) tGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGcac > 2:653129/1‑80 (MQ=255) tGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTcagcca > 1:190517/1‑150 (MQ=255) gAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTgg < 1:476345/121‑1 (MQ=255) gAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTgg > 2:476345/1‑121 (MQ=255) ggCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTCTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAgccagcca < 1:402883/150‑1 (MQ=255) cTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAgaa > 2:49594/1‑150 (MQ=255) gggggAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCg < 2:598770/77‑1 (MQ=255) gggggAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCg > 1:598770/1‑77 (MQ=255) ggggAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAgaacga > 2:77251/1‑150 (MQ=255) gggAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAgaacgaa < 1:49594/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAg > 2:121171/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAg < 1:413556/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAg > 2:413556/1‑150 (MQ=255) ccGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAgg > 2:159109/1‑150 (MQ=255) gAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGaa > 1:520268/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAacc < 1:173974/107‑2 (MQ=255) gcgcTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAaca > 2:173974/1‑107 (MQ=255) gcgcTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGcc < 2:190517/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGcc < 2:625961/150‑1 (MQ=255) cggccggGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCg > 1:940605/1‑150 (MQ=255) gTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAg > 2:1009884/1‑150 (MQ=255) gTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAg < 2:520268/150‑1 (MQ=255) tACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAg < 2:276163/126‑1 (MQ=255) tACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAg > 1:276163/1‑126 (MQ=255) cgacctCGGCCTGCTGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAGGCCGt > 1:77988/6‑150 (MQ=255) gTTCGGCCAGCAGGCCAAGGTAGTAGCACAGGACGGACAGATGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAGGCCGTCGc > 2:263932/1‑150 (MQ=255) cctCGGCCTGCTGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAgaa > 1:894889/3‑106 (MQ=255) cctCGGCCTGCTGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAgaa < 2:894889/104‑1 (MQ=255) ctCGGCCTGCTGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAGGc > 1:159908/2‑143 (MQ=255) ctCGGCCTGCTGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAGGc < 2:159908/142‑1 (MQ=255) ctCGGCCTGCTGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCAGGCGTCAGGCCGTCGCt > 1:976261/2‑150 (MQ=255) atCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAGCACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAGGCCGTCGCt > 2:826326/2‑150 (MQ=255) gCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAGGCCGTCGCTGCAg < 2:933325/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAg < 1:1203961/136‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAg < 1:1204309/136‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAg > 2:1204309/1‑136 (MQ=255) ccAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAg > 2:1203961/1‑136 (MQ=255) | ATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGCCTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTCTCCCGGCGTCAGGCCGTCGCTGCAG > NC_002947/4553168‑4553458 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |