Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,671,026 | G→A | 6.5% | E438K (GAG→AAG) | nuoN → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,671,026 | 0 | G | A | 6.5% | 181.4 / 2.8 | 61 | E438K (GAG→AAG) | nuoN | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/29); new base A (2/2); total (30/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 |
CGCTGACCGCCGGCTTCATCGGCAAGTTCTACATCATCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGGAGATGGTTCAGCAAGCGGGCCTGCAA > NC_002947/4670880‑4671172 | cGCTGACCGCCGGCTTCATCGGCAAGTTCTACATCATCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGc > 1:951249/1‑150 (MQ=255) cGCTGACCGCCGGCTTCATCGGCAAGTTCTACATCATCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGc > 1:260593/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGGCATCATCGTCAAGTTCTACATCATCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAAc < 2:242445/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAAGTTCTACATCATCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTCGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCac < 1:1167916/150‑1 (MQ=255) gTTCTACATCATCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGcccc > 2:1186320/1‑150 (MQ=255) cTACATCATCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCt > 2:631835/1‑150 (MQ=255) tACATCATCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTc > 2:1132548/1‑150 (MQ=255) tACATCATCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATCAGTACCTGGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTc < 1:1124368/150‑1 (MQ=255) catcatCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCaa > 1:905585/1‑150 (MQ=255) atcatcGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACCACGTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAAACGGTCTCGCGTCGTTATAACGCCCCGCTCAAg > 1:866818/1‑150 (MQ=255) gcatcGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCaa > 2:841482/2‑148 (MQ=255) ccatcGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCaa < 1:841482/147‑1 (MQ=255) cGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCacga > 2:222557/1‑132 (MQ=255) cGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCacga < 1:222557/132‑1 (MQ=255) cGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGCTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAg < 1:445729/148‑1 (MQ=255) cGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGCTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAg > 2:445729/1‑148 (MQ=255) gCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGgtgt > 1:135455/1‑150 (MQ=255) cACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTc > 2:1110974/1‑150 (MQ=255) cTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCAtg < 1:412243/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCAAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAAGAGCGCACCTGCGGTGTCAtgg > 2:529848/1‑149 (MQ=255) tgtgGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCAAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCCGTGTCAtgc > 2:529891/1‑150 (MQ=255) gtggtgGTTGGTCGGTGCGCTTGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGGGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCAtgct < 1:572591/150‑1 (MQ=255) gtggtTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATgctgct < 1:631835/150‑1 (MQ=255) tCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCg > 2:469558/1‑150 (MQ=255) cTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATtctc > 2:224508/1‑150 (MQ=255) gTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTAc < 1:224508/150‑1 (MQ=255) aGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTTCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACTACGCCCCGCTCAAGTGTGAACAGCGTACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTg < 1:267355/150‑1 (MQ=255) gcgcCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTTCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTgg < 1:1035033/150‑1 (MQ=255) gcgcCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCTCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTgg < 1:462601/150‑1 (MQ=255) gcgcCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTgg < 2:4880/150‑1 (MQ=255) gcgcCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTgg > 1:4880/1‑150 (MQ=255) gcCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCAtgc > 1:513271/1‑115 (MQ=255) gcCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCAtgc < 2:513271/115‑1 (MQ=255) gcCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGgt < 1:168061/150‑1 (MQ=255) cATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGgtgt < 1:1132548/150‑1 (MQ=255) cATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGgtgt < 1:469558/150‑1 (MQ=255) aTCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGgt < 1:1191014/105‑1 (MQ=255) aTCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGgt > 2:1191014/1‑105 (MQ=255) aTCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGgtgtg > 2:191744/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGc > 1:624875/1‑124 (MQ=255) tCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGc < 2:624875/124‑1 (MQ=255) ggCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCAAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTAc < 1:529891/150‑1 (MQ=255) ggCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCAAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGATCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTAc < 1:529848/150‑1 (MQ=255) tactactacCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAg > 1:1208049/1‑150 (MQ=255) actacCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGcccc > 2:214143/1‑150 (MQ=255) ctacCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTg > 2:829666/1‑130 (MQ=255) ctacCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTg < 1:829666/130‑1 (MQ=255) cTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCctgctg < 2:951249/150‑1 (MQ=255) gcgcGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGc > 2:514802/1‑140 (MQ=255) gcgcGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGc < 1:514802/140‑1 (MQ=255) gcgcGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGga < 2:841531/150‑1 (MQ=255) gcgTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGgaga > 1:714236/1‑150 (MQ=255) tCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGGAGATgg < 2:788861/150‑1 (MQ=255) ggTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGGAGATGGTTCa > 2:594240/1‑150 (MQ=255) ggTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGGAGATGGTTCa < 1:1186320/150‑1 (MQ=255) gTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGGAGATGGTTCAg > 1:175236/1‑150 (MQ=255) ttACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGGAGATGGTTCAGc > 2:1191825/1‑150 (MQ=255) tACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTgg > 2:1079849/1‑86 (MQ=255) tACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTgg < 1:1079849/86‑1 (MQ=255) ccTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGGAGATGGTTCAGCAAGc < 1:214143/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGGAGATGGTTCAGCAAGCGGGCCTGCaa < 2:905585/150‑1 (MQ=255) gAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGgag < 1:701996/123‑1 (MQ=255) gAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGgag > 2:701996/1‑123 (MQ=255) | CGCTGACCGCCGGCTTCATCGGCAAGTTCTACATCATCGCTACCGGTGTCGAATCGCACCTGTGGTGGTTGGTCGGTGCGCTGGTGATCGGTAGCGCCATCGGCGTGTACTACTACCTGCGCGTCATGGTTACCCTGTACCTGGTCGAGCCGAACCTGCGTCGTCACGACGCCCCGCTCAAGTGGGAACAGCGCACCGGCGGTGTCATGCTGCTGGCTATCGCCATTCTCGCTTTCGTACTGGGTGTGTACCCGCAGCCCCTGCTGGAGATGGTTCAGCAAGCGGGCCTGCAA > NC_002947/4670880‑4671172 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |