| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 295,247 | G→A | 7.2% | G217E (GGG→GAG) | ssuB → | aliphatic sulfonates ABC transporter ATP‑binding protein SsuB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 295,247 | 0 | G | A | 7.2% | 204.8 / 4.9 | 69 | G217E (GGG→GAG) | ssuB | aliphatic sulfonates ABC transporter ATP‑binding protein SsuB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/30); new base A (2/3); total (36/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
CTGGATGCGTTGACCCGTATCGAGATGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCGGGCACTGCGCCCGAGCCGGATCCTGTAGCCCCTCTGCCCACGCAACTGC > NC_002947/295099‑295396 | cTGGTTGCGTTGACCGGTTTCGAGATGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTCGTCACCCGCGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGTCCGGGTGATCCTGATCGATGACGGCGAGGTCggg < 2:28446/150‑1 (MQ=255) tGGATGCGTTGACCCGTATCGAGATGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGAGc < 2:709197/150‑1 (MQ=255) ggATGCGTTGACCCGTATCGAGATGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCt > 1:869534/1‑150 (MQ=255) cccGTATCGAGATGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTg < 2:1106964/150‑1 (MQ=255) ccGTATCGAGATGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGt > 1:435890/1‑150 (MQ=255) ccGTATCGAGATGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGt > 2:415589/1‑150 (MQ=255) ccGTATCGAGATGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGAAGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGt > 1:1051058/1‑150 (MQ=255) gagaTGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCAATAATGACCTg > 1:653923/1‑150 (MQ=255) agaTGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCCGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTgg > 2:41137/1‑150 (MQ=255) agaTGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGAGCCCGACCTcgc < 1:649939/139‑3 (MQ=255) agaTGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGAGCCCGACCTcgc > 2:649939/1‑137 (MQ=255) gcagcaACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACg > 2:1050059/1‑150 (MQ=255) gcaACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGcc > 1:599144/1‑150 (MQ=255) caACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGTTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGccc > 2:428932/1‑150 (MQ=255) caACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCAGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACATGGCACGGccc < 2:273511/150‑1 (MQ=255) aCTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCgg < 2:628281/117‑1 (MQ=255) aCTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCgg > 1:628281/1‑117 (MQ=255) tCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGtcgc > 2:440875/1‑150 (MQ=255) gAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGgcgc > 2:930814/1‑148 (MQ=255) gAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGgcgc < 1:930814/148‑1 (MQ=255) aaCGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTg < 2:599144/150‑1 (MQ=255) tgtgGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTc > 1:357575/1‑107 (MQ=255) tgtgGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTc < 2:357575/107‑1 (MQ=255) gtgGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCa < 1:414819/127‑1 (MQ=255) gtgGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCa > 2:414819/1‑127 (MQ=255) gTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCCAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTc < 2:869534/150‑1 (MQ=255) aGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTgg < 1:1050059/150‑1 (MQ=255) gCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGc > 1:1000563/1‑150 (MQ=255) cACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGt < 1:1047872/135‑1 (MQ=255) cACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGt > 2:1047872/1‑135 (MQ=255) ggCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCcgcg > 2:1171637/1‑150 (MQ=255) ttCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCAcc < 1:121304/136‑1 (MQ=255) ttCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCAcc > 2:121304/1‑136 (MQ=255) tACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGAc > 1:1107301/1‑86 (MQ=255) tACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGAc < 2:1107301/86‑1 (MQ=255) tACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCg > 1:583568/1‑150 (MQ=255) aCTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGa > 1:1076188/1‑150 (MQ=255) tgctgGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTc > 2:179133/1‑80 (MQ=255) tgctgGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTc < 1:179133/80‑1 (MQ=255) tgctgGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAg > 2:990596/1‑150 (MQ=255) gctgGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGt < 2:1051058/150‑1 (MQ=255) tgGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTgg < 1:832551/115‑1 (MQ=255) tgGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTgg > 2:832551/1‑115 (MQ=255) tCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCt > 2:139100/1‑133 (MQ=255) tCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCt < 1:139100/133‑1 (MQ=255) ccACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTg > 2:472819/1‑107 (MQ=255) ccACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTg < 1:472819/107‑1 (MQ=255) ccACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCa < 2:962217/114‑1 (MQ=255) ccACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCa > 1:962217/1‑114 (MQ=255) ccACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTg < 1:1010595/121‑1 (MQ=255) ccACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTg > 2:1010595/1‑121 (MQ=255) cACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCgt > 2:248655/1‑150 (MQ=255) cACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCgt > 2:738031/1‑150 (MQ=255) cACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCgt < 2:243070/150‑1 (MQ=255) acgacgTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCgtg > 1:1117358/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTg < 1:1191142/150‑1 (MQ=255) ggCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCAcccc < 1:415589/150‑1 (MQ=255) cGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCgg < 1:41137/150‑1 (MQ=255) cGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCgg < 2:583568/150‑1 (MQ=255) tGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCGGGCACTGCGCCCGa > 1:1147750/1‑150 (MQ=255) ggTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGgc < 1:548976/66‑1 (MQ=255) ggTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGgc > 2:548976/1‑66 (MQ=255) tCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCGGGCACTGCGCCCGAGCCGGATCCTg < 2:480031/150‑1 (MQ=255) aTCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGaa < 1:720710/93‑1 (MQ=255) aTCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGaa > 2:720710/1‑93 (MQ=255) aGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCGGGCACTGCGCCCGAGCCGGATCCTGTAGCCCctc < 2:1076188/150‑1 (MQ=255) aCGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCGGGCACTGCGCCCGAGCCGGATCCTGTAGCCCCTCTGc < 1:428932/150‑1 (MQ=255) cGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCGGGCAc < 2:788778/117‑1 (MQ=255) cGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCGGGCAc > 1:788778/1‑117 (MQ=255) tgAGGTCGAGCCCGACCTCGCTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGaaa < 1:181213/76‑1 (MQ=38) tgAGGTCGAGCCCGACCTCGCTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGaaa > 2:181213/2‑77 (MQ=38) ggAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCCCGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCGGGCACTGCGCCCGAGCCGGATCCTGTAGCCCCTCTGCCCAc < 1:440875/149‑1 (MQ=255) ggCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCGGGCACTGCGCCCGAGCCGGATCCTGTAGCCCCTCTGCCCACGCAACTgc > 1:1040354/1‑150 (MQ=255) | CTGGATGCGTTGACCCGTATCGAGATGCAGCAACTGATCGAACGCCTGTGGCGTCAGCACGGCTTCACTGTACTGCTGGTCACCCACGACGTCAGCGAGGCGGTTGCCGTGGCTGACCGGGTGATCCTGATCGAGGACGGCGAGGTCGGGCTCGACCTCACTGTTGACCTGGCACGGCCCCGGGCGCGTGGTTCGCACCGTCTGGCCGCGCTGGAAAGCGAAGTGCTCAACCGTGTTCTGTCCACCCCGGGCACTGCGCCCGAGCCGGATCCTGTAGCCCCTCTGCCCACGCAACTGC > NC_002947/295099‑295396 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |