| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,894,256 | G→A | 7.7% | R160H (CGC→CAC) | PP_4302 → | urea transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,894,256 | 0 | G | A | 7.7% | 215.7 / 5.9 | 78 | R160H (CGC→CAC) | PP_4302 | urea transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/37); new base A (2/4); total (37/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 | |||||||||||
CATCATCACGCACCAGTGGCGCAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCGGCGTGGCGTTGCTCACCGATCAGGC > NC_002947/4894107‑4894403 | catcatCACGCACCAGTGGCGCAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCcg > 1:930982/1‑150 (MQ=255) atcaCGCACCAGTGGCGCAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCgcggc < 2:71300/150‑1 (MQ=255) aCGCACCAGTGGCGCAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTg > 2:612505/1‑150 (MQ=255) aCGCACCAGTGGCGCAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTg > 2:267736/1‑150 (MQ=255) gCACCAGTGGCGCAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCGACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGACCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGCAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGGCCTCGGCGTggg > 1:1150156/1‑150 (MQ=255) cAGTGGCGCAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCACGCCGCGGGCCaa < 2:913364/150‑2 (MQ=255) attGGCGCAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCACGCCGCGGGCCaac < 2:433739/148‑3 (MQ=255) cgcAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTc < 2:436586/150‑1 (MQ=255) cgcAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTc < 1:859207/150‑1 (MQ=255) ggcggcAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGAc < 2:930982/150‑1 (MQ=255) cggcAAGTTGCTGATTGTCTACACCCCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCa < 1:205546/150‑1 (MQ=255) cggcAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCa > 1:828914/1‑150 (MQ=255) aTTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCggg < 1:972614/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCACGCCGCGGGCCaac > 1:693773/1‑119 (MQ=255) aTTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCACGCCGCGGGCCaac < 2:693773/121‑3 (MQ=255) ttGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGt > 1:1115182/1‑150 (MQ=255) ccTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGTCACCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGc > 1:937076/1‑150 (MQ=255) ccTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGc < 1:1010778/150‑1 (MQ=255) ccTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGc > 1:206194/1‑150 (MQ=255) ccTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGc < 1:267736/150‑1 (MQ=255) ccTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGc > 2:1041524/1‑150 (MQ=255) cTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTc < 2:523367/121‑1 (MQ=255) cTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTc > 1:523367/1‑121 (MQ=255) tACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGa > 1:737633/1‑115 (MQ=255) tACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGa < 2:737633/115‑1 (MQ=255) ccccccccTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTCCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGatc < 2:571290/146‑1 (MQ=255) tCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGccc < 2:39418/129‑1 (MQ=255) tCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGccc > 1:39418/1‑129 (MQ=255) tCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCACGCCGCGGGCCaa < 2:85523/108‑2 (MQ=255) tCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGGCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCTACCCGCTGTATGCGTTGGCCCACGCCGCGGGCCaa > 1:85523/1‑107 (MQ=255) ccTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCAtcgtc < 2:694193/150‑1 (MQ=255) tATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGt < 2:1115182/150‑1 (MQ=255) tATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCAGACCCGCTGTATGCGTTGGCACGCGGCGCGGGCGAGATGTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGGTGCTGATCATCGTCGGCATGt > 1:573699/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGtt > 1:522071/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTc > 1:412750/1‑150 (MQ=255) tgggctgggcCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGAtt > 2:1158546/1‑95 (MQ=255) tgggctgggcCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGAtt < 1:1158546/95‑1 (MQ=255) tgggctgggcCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCGCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCg < 1:508740/150‑1 (MQ=255) ggctgggcCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGtg < 2:828914/150‑2 (MQ=255) ccACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCt > 2:207698/1‑150 (MQ=255) ccACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCt > 2:710043/1‑150 (MQ=255) acacTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGATCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTAt < 2:206194/150‑1 (MQ=255) acTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGc > 1:719421/1‑113 (MQ=255) acTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGc < 2:719421/113‑1 (MQ=255) acTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATgc < 1:207698/150‑1 (MQ=255) acTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCAAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGa > 2:602714/1‑116 (MQ=255) acTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCAAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGa < 1:602714/116‑1 (MQ=255) tgGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCtt > 2:1128692/1‑97 (MQ=255) tgGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCtt < 1:1128692/97‑1 (MQ=255) tgGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGa > 2:466768/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGAtgt < 2:115759/150‑1 (MQ=255) ccAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTggg > 1:396585/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTggg < 1:1041524/150‑1 (MQ=255) cAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGTTGTGGGc > 1:987513/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGa > 1:1017355/1‑150 (MQ=255) cTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGAt < 2:1017355/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGAtcgg < 2:522071/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTggg > 1:1105415/1‑137 (MQ=255) cAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTggg < 2:1105415/137‑1 (MQ=255) gTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCAt < 2:835068/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTAGGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCAt > 2:677348/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCAtt < 1:1085669/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCAtt < 1:466768/150‑1 (MQ=255) gtcgAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATtggt > 2:280958/1‑150 (MQ=255) gtcgAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATtggt > 1:778491/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTTATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTggc < 2:700886/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTggc > 2:587404/1‑150 (MQ=255) gACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCggcgtg > 2:851357/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCggcgtgg < 1:851357/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCggcgtgg > 1:1047026/1‑150 (MQ=255) cGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCggcgtggcgt > 1:1041196/1‑150 (MQ=255) tGTATGCGTGGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCGGCGTGGCGTTGc < 2:573699/150‑1 (MQ=255) aTGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATATGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCGGCGTGGCGTTGCTCa < 2:1150156/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGa > 1:864674/1‑36 (MQ=255) gTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGa < 2:864674/36‑1 (MQ=255) ggCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCGGCGTGGCGTTGCTCACCGATCa > 1:376443/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCGGCGTGGCGTTGCTCACCGATCa < 2:987513/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGGCGTGGAGTAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCGGCGTGGCGTTGCTCACCGATCAg < 2:937076/150‑1 (MQ=255) cccGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCGGCGTGGCGTTGCTCACCGATCAgg < 1:911285/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCGGCGTGGCGTTGCTCACCGATCAGgc > 1:161388/1‑150 (MQ=255) | CATCATCACGCACCAGTGGCGCAAGCGTGGCGGCAAGTTGCTGATTGCCTACACCTCCCCTTTCGTATTGCTGGGCTGGGCCACACTGCTGGTCGCCAGCCCCTCGCCCAGCGGGTTCGTCGAAGCCGACCCGCTGTATGCGTTGGCCCGCGGCGTGGGCCAGATTTTCCTGCTCGACCAGCCCTTGGCCGGGTTGCTGATCATCGTCGGCATGTTCATCGTCAATCCCTATGCGGCGATGTGGGCGGTGATCGGCTCGGCCATTGGTGGCGGCGTGGCGTTGCTCACCGATCAGGC > NC_002947/4894107‑4894403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |