| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,918,011 | T→C | 6.1% | V122A (GTC→GCC) | PP_4328 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,918,011 | 0 | T | C | 6.1% | 189.2 / 2.3 | 66 | V122A (GTC→GCC) | PP_4328 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/32); new base C (2/2); total (32/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
GCCAACGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAGCCCGCGCCCGCTGGT > NC_002947/4917869‑4918158 | gCCAACGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCAcc < 2:593278/150‑1 (MQ=255) ccAACGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGACCGGCACCt < 2:95511/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTtgct < 1:703333/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTgcaaggcaag < 1:163798/150‑1 (MQ=255) cccAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCt < 1:400717/129‑1 (MQ=255) cccAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCt > 2:400717/1‑129 (MQ=255) cccAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGa > 1:256177/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGac > 1:734393/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGac > 2:275034/1‑150 (MQ=255) cAGCCACAACACCGTCAGCCAGACCGAAATCAATCGCCTGCCGCTTCTGCAGGTGTTAGACGCCGACGGCCAGCTCGCCACCCTCACCTAGCTAGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGaccaacca < 1:142220/150‑1 (MQ=255) aGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCAc > 2:250912/1‑119 (MQ=255) aGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCAc < 1:250912/119‑1 (MQ=255) ccAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAgct > 1:578373/1‑150 (MQ=255) cACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGa > 2:1005885/1‑134 (MQ=255) cACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGa < 1:1005885/134‑1 (MQ=255) ccGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGccc < 1:66231/150‑1 (MQ=255) ccAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTtgct < 1:932286/108‑1 (MQ=255) ccAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTtgct > 2:932286/1‑108 (MQ=255) ccAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCAcc > 1:631130/1‑150 (MQ=255) cAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCAccc > 1:163531/1‑150 (MQ=255) cGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTtg < 1:594406/100‑1 (MQ=255) cGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTtg > 2:594406/1‑100 (MQ=255) aaGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAAcc > 2:991024/1‑150 (MQ=255) gCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCgg > 2:781716/1‑150 (MQ=255) aaTCGCCTGGCGATCATGCTGCAACGGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGcc < 2:385944/150‑1 (MQ=255) aaTCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGcc > 2:874107/1‑150 (MQ=255) aaTCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGcc < 1:781716/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTAc > 2:866798/1‑150 (MQ=255) aTGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTg < 1:1045410/150‑1 (MQ=255) tgcAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCa > 1:1122287/1‑150 (MQ=255) gcAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCGGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCACTGGTCAg > 1:12694/1‑150 (MQ=255) cAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGc < 2:1013876/150‑1 (MQ=255) aCAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCt < 2:163531/150‑1 (MQ=255) gccagcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAgctgc > 2:755901/1‑97 (MQ=255) gccagcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAgctgc < 1:755901/97‑1 (MQ=255) gccagcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCCATGGTTCCATGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTc < 1:991214/150‑1 (MQ=255) cagcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACAGCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGcc > 2:698771/1‑100 (MQ=255) cagcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGcc < 1:698771/100‑1 (MQ=255) cagcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGgc < 1:368936/132‑1 (MQ=255) cagcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGgc > 2:368936/1‑132 (MQ=255) gcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCCGCAACCTATTGTCGAACAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACa < 1:275034/150‑1 (MQ=255) ccagccagGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGc < 2:47448/115‑1 (MQ=255) ccagccagGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGc > 1:47448/1‑115 (MQ=255) cagGTCGCCACCCTCACCCAGCGGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAg < 1:922274/150‑1 (MQ=255) gCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGt < 1:455308/150‑1 (MQ=255) tCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCacac > 1:993889/1‑150 (MQ=255) tCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCacac > 1:147923/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGCCCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTg > 2:167851/1‑150 (MQ=255) cccAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGa < 2:505546/150‑1 (MQ=255) cccACCTGGAACCCGCCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAGCCAGCTGCTGGCCCACGCCAACGGCCAACCGGCCGTGTCCCGGGCGCTGGTCAGTTTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGa < 1:991024/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAAc < 1:1029590/130‑1 (MQ=255) ccAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAAc > 2:1029590/1‑130 (MQ=255) cTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCTCTTGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATc < 1:866798/150‑1 (MQ=255) cTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTTAGCATc < 2:265775/150‑1 (MQ=255) ggACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGa < 2:335260/150‑1 (MQ=255) cttgcAGCAAGGTGCCGACCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGc > 2:26242/5‑127 (MQ=255) cttgcAGCAAGGTGCCGACCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGc < 1:26242/123‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCAAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAg > 1:1180171/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCAt < 2:1135358/141‑1 (MQ=255) cAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCAt > 1:1135358/1‑141 (MQ=255) cAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAgccc > 1:37413/1‑150 (MQ=255) gCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCgg > 2:361262/1‑78 (MQ=255) gCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCgg < 1:361262/78‑1 (MQ=255) cAAGGTGCCGACCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAgcccgcg > 2:584774/1‑150 (MQ=255) cGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAGCCCGCGCCCGCTgg > 2:1174047/1‑150 (MQ=255) ggTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAGCCCGCGCCCGCTGGt < 2:147923/150‑1 (MQ=255) tCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGt < 1:828582/113‑1 (MQ=255) tCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGt > 2:828582/1‑113 (MQ=255) | GCCAACGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAGCCCGCGCCCGCTGGT > NC_002947/4917869‑4918158 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |