Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,503,183 | C→A | 7.9% | L29M (CTG→ATG) ‡ | oprC → | copper receptor OprC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,503,183 | 0 | C | A | 7.9% | 194.3 / 2.7 | 61 | L29M (CTG→ATG) ‡ | oprC | copper receptor OprC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/28); new base A (3/2); total (31/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AACATTTTGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACGGCGC > NC_002947/5503036‑5503331 | aacaTTTTGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTg > 2:796975/1‑150 (MQ=255) ttttGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGgccg > 1:943016/1‑150 (MQ=255) ttttGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGgccg > 1:709808/1‑150 (MQ=255) ttGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGgccgcc < 1:1044579/150‑1 (MQ=255) gcACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGccc > 2:537503/1‑138 (MQ=255) gcACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGccc < 1:537503/138‑1 (MQ=255) aaGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGc < 2:1191204/150‑1 (MQ=255) aaGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGc < 1:796975/150‑1 (MQ=255) ccAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCAt > 1:744557/1‑150 (MQ=255) aggaggCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCAGGGCCGGCGGCCAGGGCCATgg < 1:7859/150‑2 (MQ=255) aggaggCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCAGGGCCGGCGGCCAGGGCCATgg < 1:703953/150‑2 (MQ=255) aggCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGa < 2:194313/150‑1 (MQ=255) aggCTTCCCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGa < 2:194469/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGAcc > 2:793412/1‑150 (MQ=255) ttCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCGTGAGGAccgt < 2:744557/150‑3 (MQ=255) ttCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCAt > 1:546394/1‑150 (MQ=255) cTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGa < 1:987863/150‑1 (MQ=255) tGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGccc > 2:630511/1‑103 (MQ=255) tGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGccc < 1:630511/103‑1 (MQ=255) tGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAg > 2:563008/1‑150 (MQ=255) cGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGa > 1:1005956/1‑150 (MQ=255) cTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGcc < 2:497743/150‑1 (MQ=255) tGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGccc < 2:646091/150‑1 (MQ=255) gAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTTGCCGCCGGCCCTGGCCATGAGGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGa > 1:917950/1‑150 (MQ=255) aaTCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGAc > 1:180557/1‑150 (MQ=255) aTTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTg < 2:1106208/150‑1 (MQ=255) ttATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGa > 1:457913/1‑150 (MQ=255) gTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATc > 1:78737/1‑148 (MQ=255) gTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATc < 2:78737/148‑1 (MQ=255) tCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCGTTGTCTATGCGTGGGACCATCGCCGCCATGTGCGGCTCGCTGTTCGCGCGCATGGCTCTGGCAGACGGCCCTGGCCATGAATACCATGTGAAGGACGGAGACGAGTTGAGGGCGTAGGTGATCaaa > 2:467070/1‑148 (MQ=255) cACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGc < 1:563008/150‑1 (MQ=255) cccTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGcccc > 1:690252/1‑150 (MQ=255) cTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCGGCTGGAGATCACACTGCTGAACTCCAGCACGGCTCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGa > 1:1047543/1‑150 (MQ=255) cTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGa < 2:690252/150‑1 (MQ=255) tGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTcgcc > 2:230225/1‑150 (MQ=255) ccTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTcgccgc > 2:923574/1‑150 (MQ=255) ttGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGCGTTCGCCGCTg > 2:219369/1‑150 (MQ=255) ccTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACtgt > 2:981682/1‑150 (MQ=255) cGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTc < 1:793412/150‑1 (MQ=255) gTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCa < 2:180557/150‑1 (MQ=255) tGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCAc < 1:260171/150‑1 (MQ=255) tGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCAc < 2:709808/150‑1 (MQ=255) aTCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTgg > 1:1064937/1‑139 (MQ=255) aTCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTgg < 2:1064937/139‑1 (MQ=255) tCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACt < 2:82913/134‑1 (MQ=255) tCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACt > 1:82913/1‑134 (MQ=255) tCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGa > 1:842130/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGAAGGCGTGTTTATCCCGACGGTGATCACCGCGGTGGGCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGGCACCAACCCGa > 1:811605/1‑150 (MQ=255) ccTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGAccc < 2:1005956/150‑1 (MQ=255) tgtgCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACtgtg < 1:507747/128‑1 (MQ=255) tgtgCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACtgtg > 2:507747/1‑128 (MQ=255) gctgctCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCa < 2:740047/61‑1 (MQ=255) gctgctCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCa > 1:740047/1‑61 (MQ=255) gctgctCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGt < 2:273865/120‑1 (MQ=255) gctgctCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGt > 1:273865/1‑120 (MQ=255) cgcgCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGc < 2:943016/150‑1 (MQ=255) tcttcATGGCCAGGGCCGGCGGCCAGGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCa > 1:89760/5‑150 (MQ=255) cgcCCATGGCCCTGGACGCCCGACCTGGCCAAGAAGCTCATGCGCACTTCGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAGCCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCa < 2:917950/150‑1 (MQ=255) ccATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGCTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCg > 2:780812/1‑150 (MQ=255) cATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGaaa > 1:753714/1‑121 (MQ=255) cATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGaaa < 2:753714/121‑1 (MQ=255) cATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGa < 2:759318/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGGGCCGGCGGCCAGGGCCATGGAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACg > 2:195263/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGGGCCGGCGGCCAGGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTgg > 2:1143090/1‑81 (MQ=37) gCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACGgc < 2:1047543/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACGgcgc < 1:923574/150‑1 (MQ=255) | AACATTTTGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACGGCGC > NC_002947/5503036‑5503331 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |