Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,610,696 | G→C | 5.2% | S20S (TCG→TCC) | emrE → | small multidrug resistance protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,610,696 | 0 | G | C | 5.2% | 250.8 / 3.5 | 77 | S20S (TCG→TCC) | emrE | small multidrug resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/36); new base C (2/2); total (39/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 |
ATCAACCTATCTCCCATATCGATAGGTAATGACTTTACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGC > NC_002947/5610549‑5610844 | aTCAACCTATCTCCCATATCGATAGGTAATGACTTTACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGAt < 2:20604/150‑1 (MQ=255) tctcCCATATCGATAGGTAATGACTTTACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAaggcggt > 1:807004‑M2/1‑143 (MQ=255) atatCGATAGGTAATGACTTTACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAgg > 2:210879/1‑150 (MQ=255) tatCGATAGGTCATGACTTGACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTCA‑GAAGGCGCAGGCGCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCCTTGACATATGCGTCGACGGCGTCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGc < 1:875989/150‑1 (MQ=255) gTAATGACTTTACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACg > 1:28987/1‑150 (MQ=255) tGACTTTACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGt < 1:125716/150‑1 (MQ=255) gACTTTACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATTCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGaaa > 1:1009075/1‑133 (MQ=255) gACTTTACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATTCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGaaa < 2:1009075/133‑1 (MQ=255) cccATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCTCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGCTGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCActgc > 1:1118963/1‑150 (MQ=255) cAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCAGCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCActgctgcggg > 1:260579/1‑147 (MQ=255) ggCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGAtg < 1:363095/150‑1 (MQ=255) gCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGAtgg < 1:1077729/150‑1 (MQ=255) gTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGtt > 2:242001/1‑150 (MQ=255) tCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTg > 1:492457/1‑150 (MQ=255) cTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTgg > 1:803298/1‑150 (MQ=255) cTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTgg < 2:128543/150‑1 (MQ=255) aTGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGCAAAACCTAAGCACACCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATg < 2:1137217/150‑1 (MQ=255) aTGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATCAAGGCGGTGAAAGGCCt < 2:617627/109‑1 (MQ=255) aTGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATAAAGGCGGTGAAAGGCCt > 1:617627/1‑109 (MQ=255) ccGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATCAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAGGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGTCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGcct > 1:794102/1‑148 (MQ=255) cGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAg < 2:885537/100‑1 (MQ=255) cGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAg > 1:885537/1‑100 (MQ=255) tAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGCCTATGGCATTGCGTTCt < 2:1142073/150‑1 (MQ=255) tAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCACCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCt < 2:1118963/150‑1 (MQ=255) aCGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGa < 2:605245/97‑1 (MQ=255) aCGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGa > 1:605245/1‑97 (MQ=255) aCGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTg < 1:291613/108‑1 (MQ=255) aCGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTg > 2:291613/1‑108 (MQ=255) gaTCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTg > 1:1057070/1‑150 (MQ=255) cTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGGGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCAGCTGATGGTGGTTTGGTATGGCTTTGCGTTCTGGATGCTGACGc > 1:984451/1‑150 (MQ=255) tGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGCTGCTGACGCt > 2:456306/1‑150 (MQ=255) c‑cATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCtgg < 1:1105883/150‑1 (MQ=255) cATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGTCGGtgtt > 2:991121/1‑148 (MQ=255) cATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCtggt < 2:1057070/150‑1 (MQ=255) cATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGAATCAGCTCCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCttgt < 1:991121/150‑1 (MQ=255) aTGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGt > 1:159543/1‑91 (MQ=255) aTGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGt < 2:159543/91‑1 (MQ=255) aTGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCtggtg < 2:803298/150‑1 (MQ=255) tGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACg < 2:552849/143‑1 (MQ=255) tGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACg > 1:552849/1‑143 (MQ=255) aTGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGc > 1:972008/1‑141 (MQ=255) aTGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGc < 2:972008/141‑1 (MQ=255) aTGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTcc > 2:235321/1‑150 (MQ=255) ccTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCgca < 1:235321/150‑1 (MQ=255) ccTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCgca < 1:242001/150‑1 (MQ=255) cTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTTCATCGaggcggtggc < 1:443885‑M2/66‑11 (MQ=255) cTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTTCATCGaggcggtggc > 2:443885‑M2/1‑56 (MQ=255) cTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATgg > 1:516543/1‑114 (MQ=255) cTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATgg < 2:516543/114‑1 (MQ=255) cTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCgcag > 2:707452/1‑150 (MQ=255) acctacctCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCAtt > 2:20524/1‑150 (MQ=255) ctaccgCGCCGTTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGGGAAACGCCTGAGGACGCCGTTGCTACTGCGGCGGATGGTGGTTGGCTCTGGCATTGCGTTCTCGATGCTGACGTTGGGGGTCTTGAGCATTcc > 2:504128/1‑150 (MQ=255) cctCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTTCATCGaggcggtggcga < 1:1037805‑M2/59‑13 (MQ=255) cctCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTTCATCGaggcggtggcga > 2:1037805‑M2/1‑47 (MQ=255) cctCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGt > 1:431573/1‑150 (MQ=255) ctCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTg > 1:108395/1‑150 (MQ=255) ctCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTg > 2:691775/1‑150 (MQ=255) ctCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTg < 1:66000/150‑1 (MQ=255) tCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGa > 1:976954/1‑123 (MQ=255) tCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGa < 2:976954/123‑1 (MQ=255) gCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTgggg > 1:779895/1‑150 (MQ=255) tGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGc < 2:492457/150‑1 (MQ=255) ggCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGc < 2:151078/149‑1 (MQ=255) ggCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGc < 2:141815/149‑1 (MQ=255) cATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTa < 1:210879/150‑1 (MQ=255) gcCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATc > 2:1089717/1‑150 (MQ=255) ccGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCt > 2:900350/1‑150 (MQ=255) cGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTg > 1:235076/1‑150 (MQ=255) tCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGc > 2:78910/1‑150 (MQ=255) ccACCGCCTCGATGAaggcggtggcgatgacttcggcgcagatggcaatggcgaggta > 2:868978‑M2/1‑15 (MQ=255) ccACCGCCTCGATGAaggcggtggcgatgacttcggcgcagatggcaatggcgaggta < 1:868978‑M2/58‑44 (MQ=255) ccACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTgg < 2:431573/150‑1 (MQ=255) cACCGCCTCGATGAaggcggtggcgatgacttcggcgcagatggcaatggcgaggtaggtataggcattcatggcaggatcctccgttactgagcgggcattctagacgttgcctggatggggtaaagtcattacctatcgatatgggag < 1:750219‑M2/150‑137 (MQ=255) ccGCCTCGATGAaggcggtggcgatgacttcggcgcagatggcaatggcgaggtaggtataggcattcatggcag > 1:1185426‑M2/1‑12 (MQ=255) ccGCCTCGATGAaggcggtggcgatgacttcggcgcagatggcaatggcgaggtaggtataggcattcatggcag < 2:1185426‑M2/75‑64 (MQ=255) ccTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGATGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATtg < 2:175457/150‑1 (MQ=255) cGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGc < 2:361415/150‑1 (MQ=255) | ATCAACCTATCTCCCATATCGATAGGTAATGACTTTACCCCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGC‑CATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGC > NC_002947/5610549‑5610844 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |