New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 964991 = | 27 (1.670) | 3 (0.190) | 3/250 | NT | 10.3% | coding (794/828 nt) | phnE | phosphonate ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 965023 = | 26 (1.650) | coding (826/828 nt) coding (2/768 nt) |
phnE ptxC |
phosphonate ABC transporter permease phosphonate transport system permease PtxC |
TTTGTCGGTGCTGGCGGGCTGGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGCTGGGGCAGATGGGCGAGTACGCCGGGCGCTTCCTGCA > NC_002947/964876‑965167 | tttGTCGGTGCTGGCGGGCTGGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGa > 2:433516/1‑150 (MQ=255) tGTCGGTGCTGGCGGGCTGGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAAc < 2:286725/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGCTGGCGGGCTGGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAGcc > 2:147210/1‑150 (MQ=255) cagcccgccattgccgaccagtgcgtgcaggtccagctgcagatacgcgaacgaggccaccgccgctgccacgatggcgcccagcaacacccagttgatcacccggttcaTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCgg > 2:300986‑M1/111‑150 (MQ=255) ggTGCTGGCGGGCTGGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCggg > 2:392942/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGCGGGCTGGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCgggg > 2:388815/1‑149 (MQ=255) gcgggcggGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGGGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCaa > 2:351920/1‑150 (MQ=255) gggCTGGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGTGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGCGGATGGCATCAACCGGGTGCACAACt > 1:425430/1‑150 (MQ=255) gCTGGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTgg < 1:290548/150‑1 (MQ=255) cTGGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTggg < 1:220628/150‑1 (MQ=255) gATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGATCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGgc < 1:106793/150‑1 (MQ=255) gcaggtccagctgcagatacgcgaacgaggccaccgccgctgccacgatggcgcccagcaacacccagttgatcacccggttcaTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGt < 1:409831‑M1/42‑1 (MQ=255) gcaggtccagctgcagatacgcgaacgaggccaccgccgctgccacgatggcgcccagcaacacccagttgatcacccggttcaTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGt > 2:409831‑M1/85‑126 (MQ=255) tCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTgg > 1:287269/1‑150 (MQ=255) tGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGt < 1:325843/150‑1 (MQ=255) tGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGt > 2:315871/1‑150 (MQ=255) tGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTATTGTAGTGGGGTATCCTTGCCTACCTGCTCAGCCCTCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGt < 1:433516/150‑1 (MQ=255) gcAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGGTGCTAGGGATCCTGGCCGACCTTCTCAGCCGCCTGCTGCGCTTGATGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGGTGGGCGGTATCGTGGCAGTGGCGGTGGCGTCGTTcgcg < 2:425430/150‑1 (MQ=255) aGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAGCCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTAt < 1:147210/150‑1 (MQ=255) gAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATCGGCAATGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGACATCATAGATCTGGCGTCGGGTCCGTTCGCGTATCTGCAg > 1:342718/1‑150 (MQ=255) tGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGa < 1:392942/150‑1 (MQ=255) gTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGgtgt < 1:351389/85‑1 (MQ=255) gTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGgtgt > 2:351389/1‑85 (MQ=255) tGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTc > 1:91418/1‑145 (MQ=255) tGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTc < 2:91418/145‑1 (MQ=255) cTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGc > 1:116362/1‑150 (MQ=255) acccggttcatgccagcctccagcgcagcaggcggctgagcaTGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTgc < 1:409831‑M2/84‑1 (MQ=255) acccggttcatgccagcctccagcgcagcaggcggctgagcaTGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTgc > 2:409831‑M2/43‑126 (MQ=255) ccggttcatgccagcctccagcgcagcaggcggctgagcaTGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGCTg > 2:300986‑M2/41‑150 (MQ=255) gCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGCTgg < 1:387645/150‑1 (MQ=255) ccGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTc < 2:172051/96‑1 (MQ=255) ccGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTc > 1:172051/1‑96 (MQ=255) ccGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGCTggg < 1:294335/150‑1 (MQ=255) CTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGCTGGGGCAGATgg > 2:342718‑M1/1‑150 (MQ=255) CTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGCTGGGGCAGATgg < 1:321134‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGGGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGCTGGGGCAGATGGGGGAGTag > 1:438593/1‑149 (MQ=255) tGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGAGCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGCTGGGGCAGATGGGCGAGTACGCCGGGCGCTTCCTGCa > 1:253617/1‑150 (MQ=255) tGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGCTGGGGCAGATGGGCGAGTACGCCGGGCGCTTCCTGCa > 2:363173/1‑150 (MQ=255) | TTTGTCGGTGCTGGCGGGCTGGGTCAGCAGATCGACCTGTCGATGCGCATGTTTGCGGGTGCGCAAGTGGCGAGCATGCTGTTGACGTTCTTGTTGCTGGTGATCCTGGCCGACCTGCTCAGCCGCCTGCTGCGCTGGAGGCTGGCATGAACCGGGTGATCAACTGGGTGTTGCTGGGCGCCATCGTGGCAGCGGCGGTGGCCTCGTTCGCGTATCTGCAGCTGGACCTGCACGCACTGGTCGGCAATGGCGGGCTGGGGCAGATGGGCGAGTACGCCGGGCGCTTCCTGCA > NC_002947/964876‑965167 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |