New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5210282 | 15 (0.930) | 3 (0.210) | 3/224 | NT | 14.6% | intergenic (‑100/+78) | rnd/PP_4592 | ribonuclease D/metal dependent hydrolase |
? | NC_002947 | = 5210341 | 22 (1.550) | intergenic (‑159/+19) | rnd/PP_4592 | ribonuclease D/metal dependent hydrolase |
ACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCAT > NC_002947/5210194‑5210487 | aCTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgc < 2:366941‑M2/150‑3 (MQ=255) gcgcgcAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGTGTTCGCGGGCGTgcccgctcccac > 1:60908‑M2/1‑138 (MQ=255) tatataCGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTc > 2:283643/1‑150 (MQ=255) aCGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAgcgt < 2:306377/150‑2 (MQ=255) gggTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGCCCGCCAGCCaaa > 1:409199/1‑149 (MQ=255) tGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGcc < 1:283643/150‑1 (MQ=255) tCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaaccg < 2:388265/150‑1 (MQ=255) tCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaaccggcaa > 2:54394/1‑135 (MQ=255) tCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaaccggcaa < 1:54394/135‑1 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACTGTGTATGGCCCTGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCACGCCCCCACAGGCCTTCAGCGCTTGGCCTCCAGCCAACGCCGCCAACCGGCAAACATCTCCAGCGACTGCTgg > 2:412694/1‑150 (MQ=255) tgtgGCGGCGAGCGCGCGCGCGAATGAAGGAAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTa < 1:412694/150‑1 (MQ=255) gggCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGt > 2:417188/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCAGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCAGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTa > 2:320921/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgcccgctcccacagggtggactgcccccgaaaagcgggacagtttcacccgcagtgcccgcgccgtatatactgcgcgccaatgttagt < 2:393502‑M2/150‑90 (MQ=255) gcCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgcccgctcccacagggtggactgcccccgaaaagcgggacagtttcacccgcagtgcccgcgccgtatatactgcgcgccaatgttagtggga > 1:393502‑M2/1‑57 (MQ=255) cccGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTgcccgctcccacagggtggactgcccccgaaaagcgggacagtttcacccgcagtgcccgcgccgtatatactgcgcgccaatgttagtgggag < 1:405328‑M2/150‑95 (MQ=255) ccGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCt < 1:302345/150‑1 (MQ=255) cgcgAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTg > 1:188571/1‑150 (MQ=255) gAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCGCGCCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCaa > 1:228577/1‑150 (MQ=255) ggTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGa > 2:350672/1‑150 (MQ=255) tATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTgg > 1:41340/1‑150 (MQ=255) gCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACa < 2:188571/150‑1 (MQ=255) tttGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCg < 2:156811/106‑1 (MQ=255) tttGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCg > 1:156811/1‑106 (MQ=255) cccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTgg > 1:412468/1‑150 (MQ=255) cccGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTgg < 2:41340/150‑1 (MQ=255) gcgGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCggg < 2:122034/150‑1 (MQ=255) gcgGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCggg < 1:350672/150‑1 (MQ=255) gCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCAt < 2:334898/150‑1 (MQ=255) | ACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCAT > NC_002947/5210194‑5210487 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |