New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6080223 | 24 (1.240) | 4 (0.220) | 4/246 | NT | 14.6% | coding (111/897 nt) | PP_5332 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 6080255 | 24 (1.300) | coding (143/897 nt) | PP_5332 | hypothetical protein |
TCCAAGGCCCACTGGCAATCAATGAGAAGAACGCAATGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCATGGTTTGGCAACCTGCAGCGCAACCCTCAGGCCGTCCAGGCCATGTACCA > NC_002947/6080078‑6080372 | tCCAAGGCCCACTGGCAATCAATGAGAAGAACGCAATGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTAcc > 1:238512/1‑150 (MQ=255) ccACTGGCAATCAATGAGAAGAACGCAATGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTa < 1:37838/150‑1 (MQ=255) cTGGCAATCAATGAGAAGAACGCAATGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGc < 1:293514/150‑1 (MQ=255) aatGAGAAGAACGCAATGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAAccgccg > 2:153244/1‑150 (MQ=255) atGAGAAGAACGCAATGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACcgccgc > 1:106395/1‑150 (MQ=255) agaagaACGCAAGGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAAATCTGCAGGTGGTGTATCAGCAATGAGCTTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGTTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCgctgc < 2:67425/150‑1 (MQ=255) aaCGCAATGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGTCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCcacagcagcggcggttcgcctacctgctggtag > 1:490387‑M1/1‑117 (MQ=255) aCGCAATGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGTCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCcacagcagcggcggttcgcctacctgctggtagc < 2:490387‑M1/150‑35 (MQ=255) cAATGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGgctga > 2:192664‑M2/1‑145 (MQ=255) aaTGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCcacagcagcggcggttcgcctacctgctggtagctgc > 2:348542‑M1/1‑112 (MQ=255) aaTGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCcacagcagcggcggttcgcctacctgctggtagctga < 1:348542‑M1/149‑38 (MQ=255) ccGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAgg > 1:257813/1‑150 (MQ=255) cATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCg > 1:71875/1‑150 (MQ=255) tGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGt > 1:6503/1‑150 (MQ=255) gAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAACAGGTAGGCGAACCGCCgctg < 1:333756/102‑1 (MQ=255) gAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAACAGGTAGGCGAACCGCCgctg > 2:333756/1‑102 (MQ=255) tCAACCGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTCCCCAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTTCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCATGACATCTACCGCCAGGGCAAGTCAGTACGCGCCg > 2:352304/1‑150 (MQ=255) tgGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGc > 1:316956/1‑126 (MQ=255) tgGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGc < 2:316956/126‑1 (MQ=255) gCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATc > 1:102961/1‑112 (MQ=255) gCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATc < 2:102961/112‑1 (MQ=255) gTGACCGTGCCGAACTCCTGACCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCAt < 1:157092/150‑1 (MQ=255) tcccGCACTCCTGATCGCCCCGCAGGGCGCACAGGTCCTCACCTACCCGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGGGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGTCAAGTCCGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCATGGTTTgg < 1:352304/148‑1 (MQ=255) tGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCATGGTTTgg > 1:383310/1‑150 (MQ=255) tGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCATGGTTTGGCAACCTGCAgc > 1:27876/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCATGGTTTGGCAACCTGCAGCGCAAccc > 1:292191/1‑150 (MQ=255) atcaGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCATGGTTTGGCAACCTGCAGCGCAACCCTCAGGCCGTcc < 2:145249/148‑1 (MQ=255) acaGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCATGGTTTGGCAACCTGCAGCGCAACCCTCAGGCCGTCCa < 2:257813/150‑1 (MQ=255) ggTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCATGGTTTGGCAACCTGCAGCGCAACCCTCAGGCCGTCCAGGc < 1:153244/150‑1 (MQ=255) ccTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCATGGTTTGGCAACCTGCAGCGCAACCCTCAGGCCGTCCAGGCCAt > 1:482348/1‑150 (MQ=255) tCAGCcacagcagcggcggttcgcctacctgctggtagctgaggacctgtgcgccctgctgggcgatcaggagttcggcacggtcactgctgatacgccagcagttgagttcgccatgttgctcggttacgacctgaaaggtagccattg > 2:192664‑M1/1‑5 (MQ=255) tCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGgctgaggacctgtgcgccctgctgggcgatcaggagttcggcacggtcactgctgatacgccagcagttgagttcgccatgttgctcggttacgacctgaaaggtagccatt < 1:348542‑M2/149‑113 (MQ=255) gcaGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGgctgaggacctgtgcgccctgctgggcgatcaggagttcggcacggtcactgctgatacgccagcagttgagttcgccatgttgctcggttacgacctgaaaggtagccatt > 2:348542‑M2/2‑37 (MQ=255) gCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGgctgaggacctgtgcgccctgctgggcgatcaggagttcggcacggtcactgctgatacgccagcagttgagttcgacatgttgctcggttacgacctgaaaggtagccattgcgt < 2:490387‑M2/150‑117 (MQ=255) cTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGgctgaggacctgtgcgccctgctgggcgatcaggagttcggcacggtcactgctgatacgccagcagttgagttcgacatgttgctcggttacgacctgaaaggtagccattgcgtt > 1:490387‑M2/1‑33 (MQ=255) | TCCAAGGCCCACTGGCAATCAATGAGAAGAACGCAATGGCTACCTTTCAGGTCGTAACCGAGCAACATGGCGAACTCAACTGCTGGCGTATCAGCAGTGACCGTGCCGAACTCCTGATCGCCCAGCAGGGCGCACAGGTCCTCAGCTACCAGCAGGTAGGCGAACCGCCGCTGCTGTGGCTGAGCGACCAGGCCATCTTCCGCCAGGGCAAGTCGGTACGCGCCGGGGTACCGGTGTGCTGGCCATGGTTTGGCAACCTGCAGCGCAACCCTCAGGCCGTCCAGGCCATGTACCA > NC_002947/6080078‑6080372 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |