New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 426144 | 30 (1.550) | 4 (0.220) | 4/246 | NT | 11.7% | coding (1658/2433 nt) | PP_0350 | ferrichrome‑iron receptor |
? | NC_002947 | = 426167 | 32 (1.740) | coding (1635/2433 nt) | PP_0350 | ferrichrome‑iron receptor |
GCTGGAACGACTCGGCATAGGACAGGTACGGCACGAAGCCCGAGTCGAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTAAAACGCGGTCGACCGATCAGGGCGAGTGATCGGCAGCCCGTAGACCGGGTTGTT > NC_002947/426022‑426316 | gCTGGAACGACTCGGCATAGGACAGGTACGGCACGAAGCCCGAGTCGAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGtctt > 2:202058‑M2/1‑146 (MQ=255) ggAACGACTCGGCATAGGACAGGTACGGCACGAAGCCCGAGTCGAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCAc > 2:145422/1‑150 (MQ=255) ggAACGACTCGGCATAGGACAGGTACGGCACGAAGCCCGAGTCGAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCAc < 2:185848/150‑1 (MQ=255) cATAGGACAGGTACGGCACGAAGCCCGAGTCGAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAggg > 1:367008/1‑150 (MQ=255) aTAGGACAGGTACGGCACGAAGCCCGAGTCGAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGt > 1:464453/1‑150 (MQ=255) gTACGGCACGAAGCCCGAGTCGAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCa > 1:340314/1‑150 (MQ=255) aatcccGAGTCGAACACGTAGCTGATGGCTGCCTTTCCGCTGGACTTCTTGTCCCTCTGGGTATTGGTGTGATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGTAGCCAGTCTTCCCGACCGCCCCGGGTCAGGCTCCGGTTACCAAgc < 2:13516/147‑1 (MQ=255) cGAGTCGAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCAt < 2:367008/150‑1 (MQ=255) gAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAgc < 1:210944/139‑1 (MQ=255) gAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAgc > 2:210944/1‑139 (MQ=255) acacGTAGCTGCCGCCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCt < 1:346148/150‑1 (MQ=255) cGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGca < 1:145422/150‑1 (MQ=255) tAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGcaca > 2:111668/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCAt < 2:230823/131‑1 (MQ=255) aTGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCAt > 1:230823/1‑131 (MQ=255) tGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGc < 1:111668/150‑1 (MQ=255) tGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGt > 1:248804/1‑150 (MQ=255) cGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCt > 1:284137/1‑150 (MQ=255) gCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGt > 1:79724/1‑150 (MQ=255) ttcttGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTgg > 1:219100/1‑150 (MQ=255) ttcttGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTgg > 2:347763/1‑150 (MQ=255) tcttGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGt < 2:248804/150‑1 (MQ=255) cttGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGCGCACTCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGtt < 1:5282/150‑1 (MQ=255) gTCACGCTGGGTATTGGTGGGATCGCCCTGGTTTAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTa < 1:378037/150‑1 (MQ=255) tGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTaa > 1:122651/1‑150 (MQ=255) ttGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTAAAAcgcg > 1:366130/1‑150 (MQ=255) gCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCa > 1:341059/1‑71 (MQ=255) gCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCa < 2:341059/71‑1 (MQ=255) tGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGtcttcaaccagggcgatgccaccaatacccagcgggacaagaagttcagcggcaacgcagccatcagctacgtgttcgactcggg > 2:173243‑M2/1‑33 (MQ=255) tGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGtcttcaaccagggcgatgccaccaatacccagcgggacaagaagttcagcggcaacgcagccatcagctacgtgttcgactcggg < 1:173243‑M2/118‑86 (MQ=255) gTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTGCTGTTTGTAGTCGTAAAACGCGGTCGACCGATCAGGGCg > 1:150802/1‑150 (MQ=255) ttGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGtcttcaaccagggcgatgccaccaatacccagcgggacaagaagttcagcggcaacgcagccatcagctacgtgttcgactcg < 2:248268‑M2/113‑84 (MQ=255) ttGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGtcttcaaccagggcgatgccaccaatacccagcgggacaagaagttcagcggcaacgcagccatcagctacgtgttcgactcg > 1:248268‑M2/1‑30 (MQ=255) aagaaCTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTAAAACGCGGTCGACCGATCAGGGCGAGTg < 2:150802/150‑1 (MQ=255) gaaCTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTAAAACGCGGTCGACCGATCAGGGCGAGTGAt > 2:405977/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTAAAACGCGGTCGACCGATCAGGGCGAGTGATCGGCAGccc < 2:464453/150‑1 (MQ=255) gtgtGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTAAAACGCGGTCGACCGATCAGGGCGAGTGATCGGCAGCCCGTAg > 1:395595/1‑150 (MQ=255) tgCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTAAAACGCGGTCGACCGATCAGGGCGAGTGATCGGCAGCCCGTAGAcc < 1:347763/150‑1 (MQ=255) tgCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTAAAACGCGGTCGACCGATCAGGGCGAGTGATCGGCAGCCCGTAGAcc < 2:395595/150‑1 (MQ=255) gTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTAAAACGCGGTCGACCGATCAGGGCGAGTGATCGGCAGCCCGTAGACCGGgttgtt < 2:340314/150‑1 (MQ=255) | GCTGGAACGACTCGGCATAGGACAGGTACGGCACGAAGCCCGAGTCGAACACGTAGCTGATGGCTGCGTTGCCGCTGAACTTCTTGTCCCGCTGGGTATTGGTGGCATCGCCCTGGTTGAAGAACTTGGTGCCGGTGTGCACCCAGTCTTCACGACCGCCCAGGGTCAGGCGCCAGTTACCAAGCGCCATCTGGTCCTGCACATACAGGCCGGTCTGACGGGTTTTCTGGTTGTAGTCGTAAAACGCGGTCGACCGATCAGGGCGAGTGATCGGCAGCCCGTAGACCGGGTTGTT > NC_002947/426022‑426316 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |