New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6022690 | 19 (0.980) | 4 (0.220) | 4/246 | NT | 16.3% | coding (842/1293 nt) | PP_5273 | oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 6022719 | 23 (1.250) | coding (871/1293 nt) | PP_5273 | oxidoreductase |
ACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCTTGCCGACGTGCGCATCGACTACCAGTGGGGT > NC_002947/6022573‑6022868 | acaACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGACAGCTACATCATCGCGACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGAACAACGCGTGGCGCGTGCCTACTacc < 2:79389‑M2/150‑4 (MQ=255) cTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGTCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTcc > 1:396749/1‑150 (MQ=255) tCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTg > 2:467130/1‑146 (MQ=255) tCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTg < 1:467130/146‑1 (MQ=255) gAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGAGAAGAACGCGCACGCACCTGGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGaccac > 1:59719/1‑150 (MQ=255) gctgcCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCgg > 2:467006/1‑150 (MQ=255) ggccggcAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCCCCTGCTGTTTAGCGGtgcctg > 2:10358/1‑150 (MQ=255) gCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGAc < 1:272987/150‑1 (MQ=255) cACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGAccc > 2:236096/1‑150 (MQ=255) aCCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCg > 1:89916/1‑150 (MQ=255) cGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGaa < 2:248471/150‑1 (MQ=255) gAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAg > 2:94913/1‑150 (MQ=255) cgcacgcaCATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCg < 1:94913/150‑1 (MQ=255) gcacATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGa > 2:231032/1‑150 (MQ=255) ccGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAg < 1:483378/150‑1 (MQ=255) gCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGgt > 2:278420/1‑150 (MQ=255) cAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGgtg > 1:74279/1‑150 (MQ=255) tatGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgcccagctcgcgattgag > 2:457666‑M2/1‑38 (MQ=255) tatGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgcccagctcgcgattgag < 1:457666‑M2/148‑111 (MQ=255) tatGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTccc > 1:468517/1‑150 (MQ=255) gCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgcccagctcgcgattgaggtcgtt < 1:428694‑M2/150‑117 (MQ=255) gCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTaccgccatattctgcggcagcaatgtgcgtgcgcgttcttcgcccagcggctcggtggcgatgatgtagctgccggccggcagcaccttgccgcccagctcgcgattgaggtcgtt > 2:428694‑M2/1‑34 (MQ=255) gtgtgtGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCtt < 1:231032/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTc < 2:38685/75‑1 (MQ=255) ccAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTc > 1:38685/1‑75 (MQ=255) aGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCTTGCCGACGTgc < 1:467006/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCa < 1:72812/135‑1 (MQ=255) gcgcGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCa > 2:72812/1‑135 (MQ=255) gcTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCTTGCTGACGTGCGCATCGACTa < 2:89916/150‑1 (MQ=255) gcTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCTTGCCGACGTGCGCATCGACTa > 2:33408/1‑150 (MQ=255) tGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCTTGCCGACGTGCGCATCGACTAcc > 1:280417/1‑150 (MQ=255) ctactaCCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCTTGCCGACGTGCGCATCGACTACCAGTg > 1:404943/1‑150 (MQ=255) tacCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCTTGCCGACGTGCGCATCGACTACCAGTGGGGt > 1:80821/1‑150 (MQ=255) | ACAACGACCTCAATCGCGAGCTGGGCGGCAAGGTGCTGCCGGCCGGCAGCTACATCATCGCCACCGAGCCGCTGGGCGAAGAACGCGCACGCACATTGCTGCCGCAGAATATGGCGGTGTGTGACCAGCGCGTGGCGCTGGACTACTACCGCCTGTCCGCCGACCACCGCCTGCTGTTTGGCGGTGCCTGCCACTATTCAGGCCGCGACCCGAAGGACATCGCCGCCTACATGCGGCCGAAGATGCTCAAGGTGTTCCCGCAGCTTGCCGACGTGCGCATCGACTACCAGTGGGGT > NC_002947/6022573‑6022868 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |