New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 100443 = | 33 (1.500) | 3 (0.160) | 3/222 | NT | 10.6% | intergenic (‑35/+87) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 100525 = | 22 (1.150) | intergenic (‑117/+5) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
GAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAG > NC_002947/100379‑100668 | gcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCg > 1:208174‑M1/65‑150 (MQ=255) gAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGGATGTACAGGGTTCCACTTAAATGCTGCTTGGCCTTCTTCGCGGTCATGCCCGCTCCCACATGTAAAACGTAGGCCTTGAAGTTGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCg < 1:524903/150‑1 (MQ=255) agGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAgg < 1:263887/150‑1 (MQ=255) gATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCGCAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGtt > 2:101961/1‑150 (MQ=255) gATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGtt < 1:52084/150‑1 (MQ=255) gTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCGTTCTTCGCGGGTATGGCAGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCtt > 2:251204/1‑150 (MQ=255) aTGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGc > 1:470220/1‑150 (MQ=255) aCAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAgg > 2:350109/1‑150 (MQ=255) ggTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCt > 1:46810/1‑150 (MQ=255) gTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTg > 2:79764/1‑150 (MQ=255) gTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTg < 1:223256/150‑1 (MQ=255) ttCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGGGCAGGCCTTGAGGGTGCCACTCCACCTGGGGTGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTgg > 1:183358/1‑150 (MQ=255) tGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGa < 2:470220/150‑1 (MQ=255) tgctgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCtt > 1:307817/1‑125 (MQ=255) tgctgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCtt < 2:307817/125‑1 (MQ=255) cttcttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGc < 1:79764/150‑1 (MQ=255) cgcattcgcgggcatgcccgcccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGc > 1:208174‑M2/87‑150 (MQ=255) CGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGgcgc < 1:202990‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGt > 2:493174‑M1/1‑150 (MQ=255) ggcatgcccgcccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTa < 2:208174‑M2/74‑1 (MQ=255) GGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCATGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTa > 1:532742‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTa > 1:366425‑M1/1‑150 (MQ=255) GCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAg < 1:167384‑M1/150‑1 (MQ=255) atgcccgcccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGga > 2:84010‑M2/74‑150 (MQ=255) CCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCgg > 2:331285‑M1/1‑137 (MQ=255) CCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCgg < 1:331285‑M1/137‑1 (MQ=255) ccACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATgcg > 1:457123/1‑150 (MQ=255) cacaGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATgcgc > 1:219753/1‑150 (MQ=255) aaGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTg < 2:202990/150‑1 (MQ=255) gcAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTCAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGt < 1:323753/150‑1 (MQ=255) aGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTAGGCCAGGTGCTGGTCCTAGGGGCTGGCGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTc > 1:317787/1‑150 (MQ=255) aGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCgg < 2:46810/150‑1 (MQ=255) gggCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGc < 1:443862/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCGGGGGCGGTGAGGGCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCAc < 2:147064/150‑1 (MQ=255) gggggCGGGCATGCCCGGGAATGCGGTCAGTCAGGTTGATCGTAGGCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCGCCTTGTAGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTg < 2:72619/150‑1 (MQ=255) cgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCAt < 1:101961‑M2/134‑1 (MQ=255) tgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAg < 2:167384‑M2/140‑1 (MQ=255) tgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAg < 2:457123‑M2/140‑1 (MQ=255) tgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAg < 1:251204‑M2/140‑1 (MQ=255) cgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCAAGCAGCCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAg > 1:34789‑M2/7‑150 (MQ=255) | GAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAG > NC_002947/100379‑100668 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |