| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 1,138,858 | C→T | G265S (GGT→AGT) | arcB ← | ornithine carbamoyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,138,858 | 0 | C | T | 99.1% | 1141.4 / ‑2.2 | 321 | G265S (GGT→AGT) | arcB | ornithine carbamoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/3); new base T (137/179); total (137/184) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
CGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTATTGTTCGGCGATCTGCTTGCCTACCTTGGTTTCGGAGTTGTGGAATGCCGGCAGGCAGTGCATGAACTTGGTCCGTGGGTTACCGGTGGACTTCATCAGTTCGGCATTCACCTGATAAGGCTTGAGCTGCTTGATGCGCTCACCCCAGGCTTCGATCGGCTCGCCCATCGATACCCACACGTCGGTATGCACAAAGTCGACACCCTTGACCGCGGCTTTCGGGTCTTCGGT > NC_002947/1138711‑1139005 | cGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTATTGTTCGGCGATCTGCTTGCCTACCTTGGTTTCGGAGTTGTGGAATGCCGGCAGGCAGTGCATGAACTTGGTCCGTGGGTTACTgg > 2:1695052/1‑150 (MQ=255) gCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTATTGTTCGGCGATCTGCTTGCCTACCTTGGTTTCGGAGTTGTGGAATGCCGGCAGGCAGTGCATGAACTTGGTCCGTGGGTTACTGGTGGa < 1:1583434/150‑1 (MQ=255) gCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTATTGTTCGGCGATCTGCTTGCCTACCTTGGTTTCGGAGTTGTGGAATGCCGGCAGGCAGTGCATGAACTTGGTCCGTGGGTTACTGGTGGa < 2:4969876/150‑1 (MQ=255) cGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTATTGTTCGGCGATCTGCTTGCCTACCTTGGTTTCGGAGTTGTGGAATGCCGGCAGGCAGTGCATGAACTTGGTCCGTGGGTTACTGGTGGACtt < 1:3711782/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTATTGTTCGGCGATCTGCTTGCCTACCTTGGTTTCGGAGTTGTGGAATGCCGGTAGGCAGTGCATGAACTTGGTCCGTGGGTTACTGGTGGACTtc < 1:2539398/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTATTGTTCGGCGATCTGCTTGCCTACCTTGGTTTCGGAGTTGTGGAATGCCGGCAGGCAGTGCATGAACTTGGTCCGTGGGTTACTGGTGGACTtc < 2:6745948/150‑1 (MQ=255) gACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTATTGTTCGGCGATCTGCTTGCCTACCTTGGTTTCGGAGTTGTGGAATGCCGGCAGGCAGTGCATGAACTTGGTCCGTGGGTTACTGGTGGACTTCATCAGt > 1:2741834/1‑150 (MQ=255) tCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTATTGTTCGGCGATCTGCTTGCCTACCTTGGTTTCGGAGTTGTGGAATGCCGGCAGGCAGTGCATGAACTTGGTCCGTGGGTTACTGGTGGACTTCATCAGTTCg > 1:354865/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |