New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2295818 = | 40 (1.300) | 9 (0.360) | 7/222 | 2.1 | 23.4% | intergenic (+21/+112) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | 2295903 = | 26 (1.030) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
CAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > NC_002947/2295758‑2296047 | cAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGAc < 2:233663/150‑1 (MQ=255) aaTTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGAcc < 2:402734/150‑1 (MQ=255) cGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGc < 2:31038/150‑1 (MQ=255) gCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGccc < 1:679795/150‑1 (MQ=255) ccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGa > 1:328787/1‑150 (MQ=255) tGAGTGGCAACCCCCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGCCCTTGTGGGAGCGAACCTGCCCGCGAACACCAGCATCGCCGGTGCCATGCACCTCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGGATGCTCTCTACGACCCGCTCCCGTGTGCAGCCCGagg > 2:195010/1‑148 (MQ=255) tGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGTGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTa > 2:578390/1‑150 (MQ=255) tGGAAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTa < 2:49259/150‑1 (MQ=255) accaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGtt > 1:48863/1‑140 (MQ=255) accaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGtt < 2:48863/140‑1 (MQ=255) ggCTTGTGTGAGGTCCTTGTGTGAGCGGGCATGCCCGCGCACCCCGGCAGAGTCGATGCTACCTGCCGCGGTGCCCGA‑TTCGCGGGAATGCCCGCTCCCACACTAACCGATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCtt < 1:578390/150‑1 (MQ=255) gCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCGCGCACACGGGCCCATGTGCAGCGGGATGTTTGATCAGCGGACCATGATTGCCtta > 2:344856/1‑149 (MQ=37) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg < 2:608750/111‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg > 1:608750/1‑111 (MQ=255) tgtgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCt > 2:620818/1‑143 (MQ=255) tgtgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCt < 1:620818/143‑1 (MQ=255) tCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa > 1:22188/1‑150 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagc > 1:459422/1‑150 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagc < 2:459422/150‑1 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGAGGTGCACGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagc > 1:28255/1‑150 (MQ=255) tgtgGGAGAGGGCATGCTCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGAAGCGCTAGCGTTCG‑GTGTAGGCCTGGTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCTGCTGTCCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagcca < 1:170875/150‑1 (MQ=255) TGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagcca < 1:556169‑M1/150‑1 (MQ=255) TGGGAGCGGGCAGGCCTGCGAACACGGGCAGAGCCGGTGCCATCCTCCGCGGTGCCCGC‑TTCGCCGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagccagc > 2:608040‑M1/1‑150 (MQ=255) ctggagccggcacgcccgcaaagcgtgcacctcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagccagc < 2:724921‑M2/67‑1 (MQ=255) GGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGa < 2:113168‑M1/131‑1 (MQ=255) GGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGa > 1:113168‑M1/1‑131 (MQ=255) gagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagccagccag > 1:724921‑M2/81‑149 (MQ=255) gggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaAAGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAACACCGAAACCAGCCaccccc > 2:267478‑M2/77‑149 (MQ=255) GCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCTATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGACTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTcc < 1:95814‑M1/150‑1 (MQ=255) tgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTACTCAGCGGACCATGATTGCCTTCAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagc > 1:372186‑M2/72‑150 (MQ=255) GCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagcc > 1:536612‑M1/1‑150 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGttt < 1:717249‑M1/93‑1 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGttt > 2:717249‑M1/1‑93 (MQ=255) ccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCt > 1:117567‑M2/69‑115 (MQ=255) ccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCt < 2:117567‑M2/47‑1 (MQ=255) ccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagccag > 2:296165‑M2/69‑150 (MQ=255) ccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagccag > 2:139040‑M2/69‑150 (MQ=255) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGcac > 2:410113/1‑150 (MQ=255) gCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAcgc < 2:22188/150‑1 (MQ=255) agagCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCgg > 2:519571/1‑150 (MQ=255) aCCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATACCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCg > 2:274919/1‑150 (MQ=255) ctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAAc < 1:139040‑M2/115‑1 (MQ=255) c‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGtt < 2:28255/150‑1 (MQ=255) ttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTc < 1:350138‑M2/126‑1 (MQ=255) cgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGa < 1:296165‑M2/128‑1 (MQ=255) ggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAcccc > 2:115609‑M2/19‑150 (MQ=255) cgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAAACACTCCGGTTCGGCACCggcaaccc > 2:56396‑M2/11‑147 (MQ=255) ctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTgg < 1:274919‑M2/142‑1 (MQ=255) tcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGgc > 1:249764‑M2/8‑150 (MQ=255) ccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGc > 2:405694‑M2/6‑60 (MQ=255) ccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGc < 1:405694‑M2/55‑1 (MQ=255) ccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGgcgc > 1:481957‑M2/6‑150 (MQ=255) | CAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > NC_002947/2295758‑2296047 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |