New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4577865 | 16 (0.570) | 4 (0.150) | 4/236 | NT | 15.9% | intergenic (+30/+79) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
? | NC_002947 | = 4577907 | 27 (1.000) | intergenic (+72/+37) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
TGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGC > NC_002947/4577717‑4578014 | tggtggCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGATCTGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:519002/150‑1 (MQ=255) gttgttCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgcggt < 1:51446/150‑1 (MQ=255) ccGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAAc < 1:617925‑M2/150‑2 (MQ=255) ccGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGGTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCGCCGCCGGGTGTGGTGCCTGCGTAGGAAc < 1:377777‑M2/150‑2 (MQ=255) agcagTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTcc > 1:325351/1‑150 (MQ=255) agcagTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTcc > 1:326231/1‑150 (MQ=255) gATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGaa > 2:96145/1‑150 (MQ=255) gtgGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAgg > 2:493214/1‑150 (MQ=255) gtgGATGACAATGACCTGAACGAGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAgg < 1:207345/150‑1 (MQ=255) aTGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGCTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGCCTCCCGCGAAAAGGCCa > 2:76283/1‑150 (MQ=255) aaTGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACa > 2:537907/1‑150 (MQ=255) cTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAAcggg < 1:18179‑M2/121‑5 (MQ=255) cTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAAcggg > 2:18179‑M2/1‑117 (MQ=255) gTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtaggagcggg > 2:136877‑M1/1‑67 (MQ=255) gTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtaggagcggg < 1:136877‑M1/113‑47 (MQ=255) gTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAgg > 2:192690/1‑150 (MQ=255) ttGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtag > 1:93111‑M1/1‑62 (MQ=255) ttGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtag < 2:93111‑M1/101‑40 (MQ=255) aGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCAt < 1:537907/150‑1 (MQ=255) ttGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATc < 2:325351/150‑1 (MQ=255) ggTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAaca > 2:453915/1‑150 (MQ=255) gCAGGGACGGCCCCTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACAGGGGTCACCCACGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGGTCAACACCCCCAACGGCGGCAGGtt > 2:217608/1‑150 (MQ=255) ggccggccCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAgg < 2:617925/150‑1 (MQ=255) ccggccCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGc < 2:711432/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGAt > 2:611659/1‑150 (MQ=255) cccGttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtaggagcgggtttacccgcgaaggggccggccctgcctaccaccgcatccgcaccccaaggctgccaatcaacccgttcag > 2:18179‑M1/1‑4 (MQ=255) cccGttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtaggagcgggtttacccgcgaaggggccggccctgcctaccaccgcatccgcaccccaaggctgccaatcaacccgttcag < 1:18179‑M1/121‑118 (MQ=255) cccGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAAcgggtttacccgcgaaggggccggccctgcctaccaccgcatccgcaccccaaggctgccaatcaac < 1:136877‑M2/113‑68 (MQ=255) cccGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAAcgggtttacccgcgaaggggccggccctgcctaccaccgcatccgcaccccaaggctgccaatcaac > 2:136877‑M2/1‑46 (MQ=255) ccGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGtg > 1:675067/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGtgg > 1:496954/1‑150 (MQ=255) gttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtaggagcgggtttacccgcgaaggggccggccctgcctaccaccgcatccgcaccccaaggctgccaatcaacccgttcaggtcattgtcatccacatcactgctgtaatcgg < 1:617925‑M1/150‑150 (MQ=255) gttcctacgcaggcaccacacccggcggcgacccgtgtaggagcgggtttacccgcgaaggggccggccctgcctaccaccgcatccgcaccccaaggctgccaatcaccccgttcaggtcattgtcatccacatcactgctgtaatcgg < 1:377777‑M1/150‑150 (MQ=255) | TGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTTGGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCGTGGC > NC_002947/4577717‑4578014 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |