New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 310303 | 39 (1.380) | 4 (0.150) | 3/238 | NT | 9.2% | coding (2075/2346 nt) | PP_0256 | putative oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 310360 | 41 (1.500) | coding (2018/2346 nt) | PP_0256 | putative oxidoreductase |
TGTTCATCCCCCCACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGAAGTTGGCGCGGCCGGTGCTGGTCGCCCATTCGCGGC > NC_002947/310219‑310504 | tGTTCAGCCCCCCACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTAc > 2:404839/1‑150 (MQ=255) ttCATCCCCCCACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTg > 2:438601/1‑150 (MQ=255) tCATCCCCCCACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCTGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGa < 1:730123/150‑1 (MQ=255) aTCCCCCCACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATc > 1:575513/1‑150 (MQ=255) ccccccACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGTCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGCTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGt < 1:609683/150‑1 (MQ=255) ccccACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGc > 2:677721/1‑150 (MQ=255) ccccACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGc > 2:666326/1‑150 (MQ=255) ccccACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGc < 1:404839/150‑1 (MQ=255) cccACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCg > 1:208265/1‑150 (MQ=255) ccACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGa < 2:134673/150‑1 (MQ=255) cGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCAt < 1:74982/150‑1 (MQ=255) gAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATc > 2:738097/1‑150 (MQ=255) aaaCGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCg > 1:360272/1‑150 (MQ=255) cGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCCAtt < 2:575513/150‑1 (MQ=255) gCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTg < 1:52081/150‑1 (MQ=255) ccccGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTgg < 1:677721/150‑1 (MQ=255) ccccGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGACAGCCCATCGATTGCATGATCAAGTCTgg < 1:477273/150‑1 (MQ=255) gCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTc < 2:15929/142‑1 (MQ=255) gCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTc > 1:15929/1‑142 (MQ=255) gAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAACACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGcc > 2:345603/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTgg > 2:416357/1‑150 (MQ=255) ggATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTa < 1:659756/150‑1 (MQ=255) tgatgTCGGCTTCGTTGGCGAACAACACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTAcgc < 1:345603/150‑1 (MQ=255) cGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGACGCGTACGCGTTCGTCAagca < 1:438601/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAagcag < 2:360272/150‑1 (MQ=255) gAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTc > 1:579101/1‑150 (MQ=255) gAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTc > 1:412002/1‑150 (MQ=255) aaCAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCgtgttg > 2:317069/1‑148 (MQ=255) cACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGtgttcgccaacgaagccgacatcatccgcctgggcttccagccggggcagaaggtcgacatcgtttcgctgtggggggatgaacatgtgcgccg < 1:744873‑M2/150‑95 (MQ=255) cACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGtgttcgccaacgaagccgacatcatccgcctgggcttccagccggggcagaaggtcgacatcgtttcgctgtggg < 1:143581‑M2/131‑76 (MQ=255) cACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGtgttcgccaacgaagccgacatcatccgcctgggcttccagccggggcagaaggtcgacatcgtttcgctgtggg > 2:143581‑M2/1‑56 (MQ=255) ccctCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGtgttcgccaacgaagccgacatcatccgcctgggcttccagccggggcagaaggtcgacatcgtttcgctgtggggggatgaacatgtgcgccgg > 2:744873‑M2/2‑55 (MQ=255) ccTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGgcagca < 2:412002/150‑1 (MQ=255) tGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGcc < 2:697740/150‑1 (MQ=255) acgcacgcCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGaa > 2:306474/1‑150 (MQ=255) acgcacgcCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCCTGCGCCCGCCTCGATTGCATGGTCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGaa < 1:466281/150‑1 (MQ=255) acgcCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGAGAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGAAGTTg < 2:211474/150‑1 (MQ=255) tcgtcCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGTCCTTGAAGTTGGCGCGGCCGGTGCTg > 2:310577/1‑150 (MQ=255) gtcCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGAAGTTg < 2:532364/133‑1 (MQ=255) gtcCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGAAGTTg > 1:532364/1‑133 (MQ=255) cAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCggg < 2:491517/108‑1 (MQ=255) cAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCggg > 1:491517/1‑108 (MQ=255) cAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGAAGTTGgcgc > 2:60735/1‑134 (MQ=255) cAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGAAGTTGgcgc < 1:60735/134‑1 (MQ=255) gATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGCGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGAAGTGGGCGCGGCCGGTGCTGGTCGCCCATTcgcg < 1:306474/150‑1 (MQ=255) tAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGAAGTTGGCGCGGCCGGTGCTGGTCGCCCATTCGCGGc > 1:740547/1‑150 (MQ=255) | TGTTCATCCCCCCACAGCGAAACGATGTCGACCTTCTGCCCCGGCTGGAAGCCCAGGCGGATGATGTCGGCTTCGTTGGCGAACAGCACCTCGCGCTGGCCACGCACGCCGCGGTAGCGGTCGTCCAGGCCGTAGATAGTGGTGTTGTACTGATCGTGCGAGCGCATCGATTGCATGATCAAGTCTGGCAACTGGCCGCTGGCGCGTACGCGTTCGTCAAGCAGCGTGTCGGGCAGCAGGTTGGCCTTGAAGTTGGCGCGGCCGGTGCTGGTCGCCCATTCGCGGC > NC_002947/310219‑310504 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |