New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2076632 = | 29 (1.030) | 4 (0.150) | 4/232 | NT | 12.8% | coding (570/750 nt) | PP_1852 | enoyl‑ACP reductase |
? | NC_002947 | 2076675 = | 27 (1.020) | coding (527/750 nt) | PP_1852 | enoyl‑ACP reductase |
CACGAAGCTGGCAATCTCCTCCGGCTCGCCATATCGCCCAATGGCCATCAGCGGAATCAGGCTCTCGGCAAACTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTTGATGATACGACCGCCCTGGCCCATATAGCGTGCCGCGGC > NC_002947/2076527‑2076820 | cattggcagcaccaacgccgagcgcatgccgtttgccggtggtgcaccgtacgccatgagcaagtcggcactggttggtctgacccgcggcatggcacgcgacctCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAg > 2:506078‑M1/106‑150 (MQ=255) cACGAAGCTGGCAATCTCCTCCGGCTCGCCATATCGCCCAATGGCCATCAGCGGAATCAGGCTCTCGGCAAACTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAg > 1:350711/1‑150 (MQ=255) gCAATCTCCTCCGGCTCGCCATATCGCCCAATGGCCATCAGCGGAATCAGGCTCTCGGCAAACTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGcc > 1:297000/1‑150 (MQ=255) cctccGGCTCGCCATATCGCCCAATGGCCATCAGCGGAGTCAGGCTCTCGGCAAACTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCcgc < 1:132573/150‑1 (MQ=255) cGCCCAATGGCCATCAGCGGAATCAGGCTCTCGGCAAACTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGt < 1:672887/150‑1 (MQ=255) tCAGCGGAATCAGGCTCTCGGCAAACTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCACCCAGTGCCGACTTGCTcc > 2:631556/1‑149 (MQ=255) aGCGGAATCAGGCTCTCGGCAAACTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATg > 1:284018/1‑150 (MQ=255) aGGCTCTCGGCAAACTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGt > 1:120098/1‑150 (MQ=255) gCTCTCGGCAAACTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGc > 1:166673/1‑150 (MQ=255) cTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCaaa < 2:641340/150‑1 (MQ=255) gCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCcgc > 2:322054/1‑92 (MQ=255) gCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCcgc < 1:322054/92‑1 (MQ=255) gCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACgg > 1:251337/1‑150 (MQ=255) tctgacccgcggcatggcacgcgacctCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAgg > 1:638357‑M1/28‑73 (MQ=255) tctgacccgcggcatggcacgcgacctCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAgg < 2:638357‑M1/46‑1 (MQ=255) aCTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGGCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCAt > 2:633480/1‑150 (MQ=255) ccGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCa > 1:269042/1‑144 (MQ=255) ccGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCa < 2:269042/144‑1 (MQ=255) tCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCTCGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACAACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCgg > 2:432805/1‑149 (MQ=255) tCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGt > 2:432169/1‑150 (MQ=255) aTGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATg > 1:390845/1‑72 (MQ=255) aTGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATg < 2:390845/72‑1 (MQ=255) aTGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTg < 2:238925/150‑1 (MQ=255) cctcgggccgcagggcattaccgtgaacaacgtgcagcccggcccgAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGa > 1:638357‑M2/47‑73 (MQ=255) cctcgggccgcagggcattaccgtgaacaacgtgcagcccggcccgAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGa < 2:638357‑M2/27‑1 (MQ=255) ctcgggccgcagggcattaccgtgaacaacgtgcagcccggcccgAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATg > 2:506078‑M2/46‑150 (MQ=255) ggccgcagggcattaccgtgaacaacgtgcagcccggcccgAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTtga < 1:506078‑M2/109‑1 (MQ=255) GCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTtgat < 1:286948‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTTgatgat > 2:284018‑M1/1‑150 (MQ=255) gcTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGGCCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGCTGCACCACCGGCGAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTTGATGATAc < 1:432805/150‑1 (MQ=255) gcTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTTGATGATAc < 1:432169/150‑1 (MQ=255) tGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTTGATGATACGa < 1:582600/150‑1 (MQ=255) tGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTTGATGATACGa < 2:297000/150‑1 (MQ=255) aCGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTTGATGATACGACCg > 2:521615/1‑150 (MQ=255) tCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGAACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGAGTTGGTGCTGCCAATGTTGATGATACGACCGCCCTGGc < 2:434696/150‑1 (MQ=255) cACGGTAATGTCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGCCATGCGCTCGGCGTTGGTCCTGCCAATGTTGATGATACGACCGCCCTGGcc < 2:350711/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGTCAATGTTGATGATACGACCGCCCTGGCCCATATAGc < 2:166673/150‑1 (MQ=255) cccgAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTTGATGATACGACCGCCCTGGCCCATATAGCGTGCCGCGGc < 1:671737‑M2/146‑1 (MQ=255) | CACGAAGCTGGCAATCTCCTCCGGCTCGCCATATCGCCCAATGGCCATCAGCGGAATCAGGCTCTCGGCAAACTCGCCACTGGCCGGGTTCATGTCGGTGTCCACCGGGCCGGGCTGCACGTTGTTCACGGTAATGCCCTGCGGCCCGAGGTCGCGTGCCATGCCGCGGGTCAGACCAACCAGTGCCGACTTGCTCATGGCGTACGGTGCACCACCGGCAAACGGCATGCGCTCGGCGTTGGTGCTGCCAATGTTGATGATACGACCGCCCTGGCCCATATAGCGTGCCGCGGC > NC_002947/2076527‑2076820 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |