New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2308940 = | 26 (0.920) | 4 (0.150) | 4/238 | NT | 13.5% | coding (173/957 nt) | PP_2031 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2308966 = | 26 (0.950) | coding (147/957 nt) | PP_2031 | hypothetical protein |
AAGATCGGCCGCTCGCGTTCTTCGTGGAACAGCTTGGTGTGCGGCTCCTGGGTACGCGCAGTGACACGCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCTGCGCAGTGGGCATGGGTTCAGGCAA > NC_002947/2308817‑2309112 | aaGATCGGCCGCTCGCGTTCTTCGTGGAACAGCTTGGTGTGCGGCTCCTGGGTACGCGCAGTGACACGCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGaa < 1:516238/150‑1 (MQ=255) gATCGGCCGCTCGCGTTCTTCGTGGAACAGCTTGGTGTGCGGCTCCTGGGTACGCGCAGTGACACGCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATg > 1:30353/1‑150 (MQ=255) gccgaacacggcatccgcattggccttgccgagctgatcgacatgcgccaccgcgtgcgcgaaatccagctgttttccaagcccggccagcgcagcccactggtgggcctgcaccattccacgccgcgcccgcgcagcttggaATGGTGc > 2:688731‑M2/144‑150 (MQ=255) cGCTCGCGTTCTTCGTGGAACAGCTTGGTGTGCGGCTCCTGGGTACGCGCAGTGACACGCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAgg < 2:288205/150‑1 (MQ=255) cacggcatccgcattggccttgccgagctgatcgacatgcgccaccgcgtgcgcgaaatccagctgttttccaagcccggccagcgcagcccactggtgggcctgcaccattccacgccgcgcccgcgcagcttggaATGGTGCAGGccc < 1:688731‑M2/13‑1 (MQ=255) gTTCTTCGTGGACAAGCTTGGTGTGCGGCTCCTGGGTACGCGCAGTGACACGCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCccacca > 2:184454/1‑150 (MQ=255) gTTCTTCGTGGAACAGCTTGGTGTGCGGCTCCTGGGTACGCGCAGTGACACGCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCccacca > 2:376186/1‑150 (MQ=255) tGGAACAGCTTGGTGTGCGGCTCCTGGGTACGGGCATTGACACGCCATTCGATGTTGCGCCCATCATCGCCGGCCCGCCAGTCACAC‑GCTGCACCTAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGACGGCCCAGTAGTGGGCTg > 1:734162/1‑150 (MQ=255) gcAGTGACACGCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTcg > 1:286301/1‑150 (MQ=255) tgcgcgaaatccagctgttttccaagcccggccagcgcagcccactggtgggcctgcaccattccacgccgcgcccgcgcagcttggaATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCt < 1:217633‑M2/29‑1 (MQ=255) tgcgcgaaatccagctgttttccaagcccggccagcgcagcccactggtgggcctgcaccattccacgccgcgcccgcgcagcttggaATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCt > 2:217633‑M2/89‑117 (MQ=255) cacGCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCAcgc < 2:286301/150‑1 (MQ=255) acGCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCAcgcg > 1:554678/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGt > 1:252544/1‑150 (MQ=255) cGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCa < 2:30353/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTc < 1:184454/150‑1 (MQ=255) gcgcACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGAt < 2:734162/150‑1 (MQ=255) gcACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCa > 2:634334/1‑150 (MQ=255) atcatcGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCtt < 1:51825/102‑1 (MQ=255) atcatcGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCtt > 2:51825/1‑102 (MQ=255) tcatcGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCg > 1:40969/1‑150 (MQ=255) tcGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCa > 1:58486/1‑150 (MQ=255) agcgcagcccactggtgggcctgcaccatTCCAAGCTGCGCGGGCGCGGCGTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCa > 2:217633‑M1/30‑117 (MQ=255) agcgcagcccactggtgggcctgcaccatTCCAAGCTGCGCGGGCGCGGCGTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCa < 1:217633‑M1/88‑1 (MQ=255) gCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCaa < 1:321628/145‑1 (MQ=255) gCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCaa > 2:321628/1‑145 (MQ=255) gTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCGGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCg > 2:705434/1‑150 (MQ=255) gggcctgcaccatTCCAAGCTGCGCGGGCGCGGCGTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCgtg < 1:688731‑M1/137‑1 (MQ=255) gcaccatTCCAAGCTGCGCGGGCGCGGCGTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGc > 2:688731‑M1/8‑150 (MQ=255) gTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCTGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGc > 1:266765/1‑150 (MQ=255) gTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGc > 1:573277/1‑150 (MQ=255) aGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCt < 1:576546/150‑1 (MQ=255) TCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCAGGCGGCGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCTgc < 1:357790‑M1/150‑1 (MQ=255) ACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCTGCGCa > 1:376186‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgcgcccgcgcAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTTGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCTGCGCAGTg < 1:288784/150‑1 (MQ=255) cgcgcAGCTTGGAATGGTGCAGGGCTGCCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTTGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCTGCGCAGTGGGCATgg < 2:266765/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTGGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCACGGCCACTGCTGATGCCGTGTTCGGCCAGCTGCGCAGTGGGCATggg > 2:552040/1‑150 (MQ=255) gcAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTTTTCGGCCAGCTGCGCAGTGGGCATGGGtt < 2:554678/150‑1 (MQ=255) gCTTGGAATGGTGCAGGCCCCCCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAGAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCTGCGCAGTGGGCATGGGTTCAg < 2:6135/150‑1 (MQ=255) gCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCTGCGCAGTGGGCATGGGTTCAg < 1:318535/150‑1 (MQ=255) gCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCTGCGCAGTGGGCATGGGTTCAg > 1:71815/1‑150 (MQ=255) ggaATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCTGCGCAGTGGGCATGGGTTCAGGCaa < 2:71815‑M2/147‑1 (MQ=255) | AAGATCGGCCGCTCGCGTTCTTCGTGGAACAGCTTGGTGTGCGGCTCCTGGGTACGCGCAGTGACACGCCAGTCGATGTTGCGCACATCATCGCCGGCCTGGTAAACGCGCACCTG‑GTCGAAGTCCACGCCGCGCCCGCGCAGCTTGGAATGGTGCAGGCCCACCAGTGGGCTGCGCTGGCCGGGCTTGGAAAACAGCTGGATTTCGCGCACGCGGTGGCGCATGTCGATCAGCTCGGCAAGGCCAATGCGGATGCCGTGTTCGGCCAGCTGCGCAGTGGGCATGGGTTCAGGCAA > NC_002947/2308817‑2309112 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |