Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,964,155 | Δ1 bp | coding (1248/1476 nt) | fleQ ← | transcriptional regulator FleQ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,964,154 | 0 | G | . | 99.3% | 1341.4 / 0.8 | 278 | coding (1249/1476 nt) | fleQ | transcriptional regulator FleQ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base . (141/135); total (142/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
ATACGCAAACGTTCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGTGGCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGACCCCGTACGGGTGCATGATCGCCATGCGCTCGACC > NC_002947/4964006‑4964299 | tACGCAAACGTTCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGtgtgtg < 1:6192670/148‑1 (MQ=255) gCAAACGTTCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCAtt > 2:4049660/1‑150 (MQ=255) gCAAACGTTCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCAtt > 2:3589023/1‑150 (MQ=255) gCAAACGTTCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCAtt > 1:4861331/1‑150 (MQ=255) aaaCGTTCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGa > 2:1529377/1‑150 (MQ=255) aaaCGTTCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGa < 2:874948/150‑1 (MQ=255) aaCGTTCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGAt < 2:5102145/150‑1 (MQ=255) ttCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGcc > 2:1700289/1‑150 (MQ=255) tCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCa < 1:2558050/150‑1 (MQ=255) gCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCAcgc < 1:4935264/150‑1 (MQ=255) gcAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCa < 2:6416697/150‑1 (MQ=255) gcAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCa < 2:1036179/150‑1 (MQ=255) gcAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCa < 2:4894833/150‑1 (MQ=255) cAACGATACCGTTGGCATCATCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAg < 2:2229807/150‑1 (MQ=255) aCGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGt < 1:4778951/150‑1 (MQ=255) gATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCg > 1:2822737/1‑150 (MQ=255) ccGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTgc < 2:5609009/150‑1 (MQ=255) ggtGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTgcgc < 2:5965548/148‑1 (MQ=255) tGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAg < 1:1849949/150‑1 (MQ=255) ggCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAgg < 1:5054320/150‑1 (MQ=255) ggCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAgg < 1:3404121/150‑1 (MQ=255) aTCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTc < 1:3818894/131‑1 (MQ=255) tCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGt > 1:398654/1‑150 (MQ=255) cGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTc < 2:1324029/150‑1 (MQ=255) cGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTc < 1:4287458/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGAcc > 2:4220744/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGAcc > 2:6037206/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGAcc > 2:3007810/1‑150 (MQ=255) gctgGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTc < 2:3644474/150‑1 (MQ=255) cctgGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTc > 1:2711866/2‑150 (MQ=255) ctgGAGCAGGGCCTGATCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCg > 1:2626345/1‑150 (MQ=255) tgGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGt > 1:19771/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCt > 2:1583854/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTc > 1:2385744/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTc > 1:780056/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTc < 2:518489/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCAGGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTc < 2:5780639/150‑1 (MQ=255) ggCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTc < 2:2583876/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCa < 1:1407557/150‑1 (MQ=255) cccTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCAt < 2:297138/150‑1 (MQ=255) ccTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATc > 1:1586027/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATc > 1:3867582/1‑150 (MQ=255) ccTGATCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGGGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATc > 2:4976114/1‑150 (MQ=255) cTGCTCCAGGCTACCAAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCg < 1:3163450/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTc > 1:6038378/1‑139 (MQ=255) ccAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATa > 2:6061935/1‑150 (MQ=255) cAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAg < 1:1519681/150‑1 (MQ=255) cAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAg < 1:98256/150‑1 (MQ=255) 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tCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCa > 1:2220819/1‑150 (MQ=255) cTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGt > 1:251391/1‑150 (MQ=255) cTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGt > 2:2519736/1‑150 (MQ=255) cTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGt > 2:2396268/1‑150 (MQ=255) cTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGt < 1:481556/150‑1 (MQ=255) 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1:6298554/102‑1 (MQ=255) gCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCa > 2:6182701/1‑150 (MQ=255) tgagcGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCaa > 2:6269380/5‑150 (MQ=255) cTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATttcttc < 1:4692995/130‑1 (MQ=255) cTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATttcttc < 1:4314854/130‑1 (MQ=255) cTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATttcttc > 2:4694005/1‑130 (MQ=255) cTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAAt > 2:4821408/1‑150 (MQ=255) tCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGa < 1:6469326/150‑1 (MQ=255) gggCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGAcc < 1:4156758/150‑1 (MQ=255) gcggcAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGAcccc > 1:5968186/1‑150 (MQ=255) cagcaTGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGACCCCGTAc > 2:4668591/1‑150 (MQ=255) 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tGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGa > 2:5528617/1‑69 (MQ=255) tGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGa < 1:5528617/69‑1 (MQ=255) tGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGACCCCGTACGGGTGCATGa < 1:1185205/150‑1 (MQ=255) ggTTGCTGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGACCCCGTACGGGTGCATGAt < 1:410048/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATttct > 2:3773587/1‑101 (MQ=255) tGAAGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGACCCCGTACGGGTGCATGATCGCCAt > 1:5364661/1‑150 (MQ=255) 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tGAAGTTTGGATTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGACCCCGTACGGGTGCATGATCGCCAt > 1:2352216/1‑150 (MQ=255) aaGTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGACCCCGTACGGGTGCATGATCGCCATgc < 1:4649083/150‑1 (MQ=255) gTTTGGTGTGT‑GCCATTGATCGCCACGCGCTCTACAAGGTAGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGATCGTCTTCGTCAACGACATAGCGGAATTACTTCGGCAGTTCAGACACGCCAATGACACCGTACCGGAGCATGATCGCCATgcgc > 2:5676637/1‑150 (MQ=255) | ATACGCAAACGTTCAGCCGCGCGCGCAACGATACCGTTGGCATCGTCCAGCGCCTGCTGGATCAGGCCCTGCTCCAGGCTACCCAGGTAGTCCTTGAGGTCCAGGCCTTCGGGCGGCAGCATGGCGTGGTTGCTGAAGTTTGGTGTGTGGCCATTGATCGCCACGCGCTCTTCCAGGTCGCTGCGCAGGCTGTCGACCATCTGCTCGTCTTCGTCATCGACATAGCGGAATTTCTTCGGCAGTTCCGACACGCCAATGACCCCGTACGGGTGCATGATCGCCATGCGCTCGACC > NC_002947/4964006‑4964299 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |