| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_002947 | 1,851,242 | G→T | E96* (GAG→TAG) | relA → | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,851,242 | 0 | G | T | 98.3% | 1043.4 / 3.2 | 297 | E96* (GAG→TAG) | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/2); new base T (136/156); total (139/158) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.68e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
GTAGAGAAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCGAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGTA > NC_002947/1851095‑1851385 | gTAGAGAAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAg > 2:4609491/1‑150 (MQ=255)gTAGAGAAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAg < 1:6342719/150‑1 (MQ=255)gTAGAGAAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAg > 1:4830756/1‑150 (MQ=255) 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cGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTgg < 1:5172203/150‑1 (MQ=255) cGGTCATCCACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTgg < 2:1511096/150‑1 (MQ=255) ggTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTggg > 2:2306951/1‑150 (MQ=255) cATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTc < 2:3613247/150‑1 (MQ=255) aTCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcg > 2:627305/1‑150 (MQ=255) aTCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcg > 1:6004022/1‑150 (MQ=255) tCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCggt > 2:862053/1‑64 (MQ=255) tCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcgc > 2:3922410/1‑150 (MQ=255) aCCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcgcagg < 2:4794408/150‑1 (MQ=255) aCCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcgcagg > 1:2940772/1‑150 (MQ=255) cGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcgcaggcg > 2:684245/1‑150 (MQ=255) gCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcgcaggcgc > 1:1211512/1‑150 (MQ=255) cTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcgcaggcgca < 2:961069/150‑1 (MQ=255) cGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcgcaggcgcagg < 2:6124134/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGt < 1:2537079/150‑1 (MQ=255) | GTAGAGAAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCGAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGTA > NC_002947/1851095‑1851385 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |