New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5513290 = | 26 (1.120) | 3 (0.160) | 3/198 | NT | 16.0% | intergenic (+20/‑134) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 5513398 = | 11 (0.600) | intergenic (+128/‑26) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
CGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAA > NC_002947/5513156‑5513431 | gttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTG‑CCGGCctct > 1:314266‑M1/135‑150 (MQ=255) ggCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCtt > 2:585973/1‑150 (MQ=255) gcagcaTTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCATCTTc > 2:528968/1‑150 (MQ=255) gcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCgg < 1:110156‑M1/22‑1 (MQ=255) cGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAAcc < 1:585973/150‑1 (MQ=255) aCCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAAcccc > 1:555289/1‑150 (MQ=255) ccATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCg > 2:335210/1‑150 (MQ=255) gtgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 1:331743/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcga > 1:270832/1‑148 (MQ=255) gTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCgg < 2:510222/131‑1 (MQ=255) gTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCgg > 1:510222/1‑131 (MQ=255) gccgcACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTgg < 1:501053/147‑1 (MQ=255) gAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCAt < 1:528968/150‑1 (MQ=255) gCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTc > 1:395885/1‑150 (MQ=255) ggAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCgg < 2:129555/105‑1 (MQ=255) ggAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCgg > 1:129555/1‑105 (MQ=255) gAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAAt < 1:62181/132‑1 (MQ=255) gAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATGTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAAt > 2:62181/1‑132 (MQ=255) gCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCcgtcgt < 1:377351/150‑1 (MQ=255) gCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCcgtcgt < 2:395885/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCgg < 2:555289/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGTTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCggg < 1:480057/150‑1 (MQ=255) gTGAAGGCAGATCAGCGGGTCTTCGTGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGCTTTGAATTTTTGGC‑CCTGAGTGCGTCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAc < 1:346282/150‑1 (MQ=255) gccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGTGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:445874‑M1/88‑1 (MQ=255) gccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAccc > 2:505658‑M1/63‑150 (MQ=255) gcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGCAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTTCCCGCGa > 1:202079/1‑150 (MQ=255) tactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGTGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga > 1:445874‑M1/56‑150 (MQ=255) gCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGCCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCTTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 1:113858/150‑1 (MQ=255) aTCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATcc < 1:335210/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTc < 1:439305/150‑1 (MQ=255) tttttGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCaa > 2:285325/1‑150 (MQ=255) GCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGc < 2:190047‑M1/60‑1 (MQ=255) GCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGc > 1:190047‑M1/1‑60 (MQ=255) | CGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTG‑CCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAA > NC_002947/5513156‑5513431 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |