| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1514973 = | 20 (0.870) | 4 (0.180) | 4/242 | NT | 18.5% | coding (156/294 nt) | ftsL | cell division protein FtsL |
| ? | NC_002947 | 1515008 = | 16 (0.720) | coding (191/294 nt) | ftsL | cell division protein FtsL | |||||
CTTGCCAAACCCTTGCCAGGCGGAAGCTTCCTGATGCTTTTGCTGTTCGTCGGCGTGTTGGTTTCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCGAGAACCTGGCCTCCGAGCAGTTGAAGATGCGCGTGCCGTCAGCTGACGAAGTCCGGATGGTGGCGCCATGAT > NC_002947/1514830‑1515112 | cTTGCCAAACCCTTGCCAGGCGGAAGCTTCCTGATGCTTTTGCTGTTCGTCGGCGTGTTGGTTTCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCt > 1:305760/1‑150 (MQ=255) ccAAACCCTTGCCAGGCGGAAGCTTCCTGATGCTTTTGCTGTTCGTCGGCGTGTTGGTTTCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAgg < 1:116693/150‑1 (MQ=255) aaaCCCTTGCCAGGCGGAAGCTTCCTGATGCTTTTGCTGTTCGTCGGCGTGTTGGTTTCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGcc > 1:507133/1‑150 (MQ=255) gAAGCTTCCTGATGCTTTTGCTGTTCGTCGGCGTGTTGGTTTCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGa < 2:86389/150‑1 (MQ=255) gAAGCTTCCTGATGCTTTTGCTGTTCGTCGGCGTGTTGGTTTCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGa < 2:507133/150‑1 (MQ=255) atggcgccaccatccggacttcgtcagctgacggcacgcgcatcttcaactgctcggaggccaggttctcgatgcggctggcagcggtccaggtactctgctCaa < 1:331810‑M1/3‑1 (MQ=255) atggcgccaccatccggacttcgtcagctgacggcacgcgcatcttcaactgctcggaggccaggttctcgatgcggctggcagcggtccaggtactctgctCaa > 2:331810‑M1/103‑105 (MQ=255) caccatccggacttcgtcagctgacggcacgcgcatcttcaactgctcggaggccaggttctcgatgcggctggcagcggtccaggtactctgctCAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCaga < 1:238423‑M1/41‑1 (MQ=255) caccatccggacttcgtcagctgacggcacgcgcatcttcaactgctcggaggccaggttctcgatgcggctggcagcggtccaggtactctgctCAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCaga > 2:238423‑M1/96‑136 (MQ=255) cgGCGTGTTGGTTTCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCTCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGc < 2:218546/150‑1 (MQ=255) ggCGTGTTGGTTTCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGcc > 2:519917/1‑150 (MQ=255) tttCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCg > 2:534499/1‑150 (MQ=255) tttCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCg > 1:190861/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCga < 2:190861/150‑1 (MQ=255) ggCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑Gc < 1:284750/104‑1 (MQ=255) ggCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑Gc > 2:284750/1‑104 (MQ=255) tGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCGAGAACCTGGc > 1:250951/1‑150 (MQ=255) ggcacgcgcatcttcaactgctcggaggccaggttctcgatgcggctggcagcggtccaggtactctgctc > 1:28764‑M1/71‑71 (MQ=255) ggcacgcgcatcttcaactgctcggaggccaggttctcgatgcggctggcagcggtccaggtactctgctc < 2:28764‑M1/1‑1 (MQ=255) cTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCGAGAACCTGGCCTCCGAGCa > 1:465202/1‑150 (MQ=255) cAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCGAGAACCTGGCCTCCGAGCAGtt < 2:140112/150‑1 (MQ=255) tGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCGAGAACCTGGCCTCCGAGCAGTTGAAGATgcgc > 2:363912/1‑150 (MQ=255) tcggaggccaggttctcgatgcggctggcagcggtcccggtactctgctCAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTg < 1:112038‑M1/35‑1 (MQ=255) tcggaggccaggttctcgatgcggctggcagcggtccaggtactctgctCAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTg > 2:112038‑M1/50‑84 (MQ=255) cTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAACGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGGCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCGAGAACCTTGCCTCCGAGCAGTTGAAGATGCGCGGGCCGTCAGCTGAc > 1:571097/1‑150 (MQ=255) tGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCGAGAACCTGGCCTCCGAGCAGTTGAAGATGCGCGTGCCGTCAGCTGACGAAGTCCGGa < 1:208041/150‑1 (MQ=255) gcaCGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGAGTTGTGCT‑CTTCCGATCCAGAGGAGTTTTACCGCTGCCAGCCGCATCGAGAACCTGGCCTCCGAGCAGTTGAAGATGCGCGTGCCGTCAGCTGACGAAGTCCGGAt < 1:534499/148‑1 (MQ=255) aCGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCGAGAACCTGGCCTCCGAGCAGTTGAAGATGCGCGTGCCGTCAGCTGACGAAGTCCGGATGGTGGCGCCatgat < 1:519917/150‑1 (MQ=255) | CTTGCCAAACCCTTGCCAGGCGGAAGCTTCCTGATGCTTTTGCTGTTCGTCGGCGTGTTGGTTTCGGCCATTGCCGTGTCCTACAGTGCGCACTGGAACCGTCAACTGCTCAACACTCTGTACGGTGAATTGAACGAGCGCGACAAGGCTCAGGCCGAATGGGGTCG‑GCTGATTCTTGAGCAGAGTACCTGGACCGCTGCCAGCCGCATCGAGAACCTGGCCTCCGAGCAGTTGAAGATGCGCGTGCCGTCAGCTGACGAAGTCCGGATGGTGGCGCCATGAT > NC_002947/1514830‑1515112 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |