New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4098110 = | 39 (1.690) | 3 (0.140) | 3/232 | NT | 8.2% | coding (624/975 nt) | qor‑II | quinone oxidoreductase |
? | NC_002947 | 4098152 = | 31 (1.450) | coding (582/975 nt) | qor‑II | quinone oxidoreductase |
GCACCGGAGGTGCCGCCGAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCAGCTGGCCCAAAGCACCGGCCGCACCGTACA > NC_002947/4098006‑4098300 | gCACCGGAGGTGCCGCCGAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGttttt < 1:269863/150‑1 (MQ=255) cgcgacacctgggggcgacggtgataggggtggtatcgcgcctgcaaagtgtggagcgggcacgggcggcgggttgccagcatgtgctggtgttcgacgcaaaaACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGttttt > 2:297996‑M1/105‑150 (MQ=255) aCCGGAGGTGCCGCCGAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGc > 2:5486/1‑150 (MQ=255) aCCGGAGGTGCCGCCGAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGc < 2:511369/150‑1 (MQ=255) cGGAGGTGCCGCCGAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGTGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACGCCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGt < 1:573645/150‑1 (MQ=255) cGGAGGTGCCGCCGAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGt < 1:460454/150‑1 (MQ=255) cGGAGGTGCCGCCGAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGt > 2:473907/1‑150 (MQ=255) ggTGCCGCCGAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGaa < 1:5486/150‑1 (MQ=255) ccgccgAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAACGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑Acc > 2:428222/1‑150 (MQ=255) gccgAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAg > 1:354740/1‑150 (MQ=255) ggtgataggggtggtatcgcgcctgcaaagtgtggagcgggcacgggcggcgggttgccagcatgtgctggtgttcgacgcaaaaACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGttt > 1:327883‑M1/86‑129 (MQ=255) ggtgataggggtggtatcgcgcctgcaaagtgtggagcgggcacgggcggcgggttgccagcatgtgctggtgttcgacgcaaaaACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGttt < 2:327883‑M1/44‑1 (MQ=255) aCCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTgg < 2:354740/150‑1 (MQ=255) aacaaGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCaa > 1:269406/1‑150 (MQ=255) cgcgCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACccgccg > 1:357193/1‑150 (MQ=255) ggcagccTGAGGGTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCgccgcc > 2:167957/6‑150 (MQ=255) cTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGcc > 2:181616/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGcc > 1:81007/1‑150 (MQ=255) acCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATaccacc < 1:582912/150‑1 (MQ=255) acCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATaccacc < 2:81007/150‑1 (MQ=255) cTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGcc > 2:342294/1‑118 (MQ=255) cTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGcc < 1:342294/118‑1 (MQ=255) cACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCAc > 1:246474/1‑150 (MQ=255) gCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGt < 1:427844/150‑1 (MQ=255) tCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGcc > 1:306082/1‑150 (MQ=255) tACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACccgc > 2:417138/1‑92 (MQ=255) tACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACccgc < 1:417138/92‑1 (MQ=255) cTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGgt > 1:512943/1‑150 (MQ=255) gCCACCCCGTGGCGTTGGATCAGCTCGCTCACCTATTTTGCCAAGGTTTTTGCGTCGTACAATAAATTCCTGC‑AGCACCCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTcgc < 1:11242/150‑1 (MQ=255) aaaaaccttggccagccaggtgcgtgagctgacccaaggccaaggtTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTcgcg > 2:297996‑M2/47‑150 (MQ=255) aaaccttggccagccaggtgcgtgagctgacccaaggccaaggtTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCAcc > 1:327883‑M2/45‑129 (MQ=255) aaaccttggccagccaggtgcgtgagctgacccaaggccaaggtTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCAcc < 2:327883‑M2/85‑1 (MQ=255) CCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCaa < 1:582815‑M1/150‑1 (MQ=255) TTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCCTGCCCAAgg < 1:26448‑M1/150‑1 (MQ=255) TTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACAAGGCACGCCAAGATATTTGGGACGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAgg < 2:71158‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCAAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCTCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCAcc > 2:357193‑M1/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCAg < 2:582815/150‑1 (MQ=255) gTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCAGc > 1:297135/1‑150 (MQ=255) tCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAg > 2:61038/1‑91 (MQ=255) tCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAg < 1:61038/91‑1 (MQ=255) cGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCAGCTGGCCCaaa < 2:269406/150‑1 (MQ=255) ctggctggCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCAGCTGGCCCAAAGCAcc > 2:314297/1‑150 (MQ=255) gctggcCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCAGCTGGCCCAAAGCACCGGc > 1:561509/1‑150 (MQ=255) gccaaggtTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGgc > 2:71682‑M2/9‑73 (MQ=255) gccaaggtTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGgc < 1:71682‑M2/65‑1 (MQ=255) gccaaggtTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAgg > 1:287278‑M2/9‑119 (MQ=255) gccaaggtTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAgg < 2:287278‑M2/111‑1 (MQ=255) caaggaTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCCGCTGGCCCAAAGCACCGGCCGCAcc > 2:92543‑M2/7‑150 (MQ=255) aaggtTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGACAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCAGCTGGCCCAAAGCACCGGCCGCACCg > 1:366233‑M2/6‑150 (MQ=255) aggtTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCAGCTGGCCCAAAGCACCGGCCGCACCGt < 2:366366‑M2/146‑1 (MQ=255) tTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCAGCTGGCCCAAAGCACCGGCCGCACCGTACa > 2:342154‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCACCGGAGGTGCCGCCGAACGATACCAACAAGCCGCGCACCCTCAGGCTGCCCAACGAGGCCTCAAGCGACACCTTGCCCACGCAATCGTACACTACGGCCACACCTTGGCCTTGGGTCAGCTCACGCACCTGGCTGGCCAAGGTTTTTGCGTCGAAC‑ACCAGCACATGCTGGCAACCCGCCGCCCGTGCCCGCTCCACACTTTGCAGGCGCGATACCACCCCTATCACCGTCGCCCCCAGGTGTCGCGCCCAAGGCACCATCAGCTGGCCCAAAGCACCGGCCGCACCGTACA > NC_002947/4098006‑4098300 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |