New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 22558 = | 17 (0.070) | 248 (1.040) | 121/292 | 0.3 | 93.6% | intergenic (+28/‑618) | PP_0017/PP_0018 | transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3969310 = | NA (NA) | intergenic (+215/‑100) | PP_3498/PP_3499 | transposase/transposase |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
GACCGTCGCAGACCGATGCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCAGGTCGTT > NC_002947/3969164‑3969457 | gACCGTCGCAGACCGATGCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTaa < 2:3372496/150‑1 (MQ=32) aCCGTCGCAGACCGATGCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAg > 1:750606/1‑150 (MQ=33) cGTCGCAGACCGATGCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCg > 2:860449/1‑150 (MQ=35) aGACCGATGCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGc < 1:753504/150‑1 (MQ=40) aGACCGATGCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGc < 2:1721287/150‑1 (MQ=40) cGATGCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAAc > 2:314513/1‑150 (MQ=255) gATGCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACt > 1:3165579/1‑150 (MQ=255) tGCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCa < 2:2352575/150‑1 (MQ=255) gCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGGGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCAc < 1:2495951/150‑1 (MQ=255) tCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGACCTCACCtt > 1:3184914/1‑150 (MQ=255) tCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCtt > 1:4586076/1‑150 (MQ=255) tCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCtt > 1:5183136/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTcc < 2:4039857/150‑1 (MQ=255) cGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTcc < 2:559577/150‑1 (MQ=255) cGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTcc < 2:2180242/150‑1 (MQ=255) tACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGACTAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTACGCGTCCGGCGAACTCACCGTCCGAACTc > 2:2735339/1‑150 (MQ=255) tACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTc > 1:2468402/1‑150 (MQ=255) aCAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTcc < 1:384794/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCATCCTGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAg < 2:4430047/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAg > 2:1075077/1‑150 (MQ=255) gCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCa < 2:5136210/150‑1 (MQ=255) tGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTa > 2:4738219/1‑150 (MQ=255) aTAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAg < 2:4539686/150‑1 (MQ=255) aTAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAg > 2:63031/1‑150 (MQ=255) tAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAgg < 2:11157/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGc < 1:3450182/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGc < 1:63031/150‑1 (MQ=255) gCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGAt > 1:3777361/1‑150 (MQ=255) cTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATgg > 2:3445078/1‑150 (MQ=255) cTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATgg > 1:525731/1‑150 (MQ=255) cTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATg > 1:188190/1‑149 (MQ=255) tCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGgt > 2:3672369/1‑150 (MQ=255) aTGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTc < 2:814078/150‑1 (MQ=255) 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ccTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCtt > 1:1121896/1‑150 (MQ=255) tGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTcc > 2:1241473/1‑84 (MQ=255) tGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTcc < 1:1241473/84‑1 (MQ=255) gATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATc > 2:5008033/1‑150 (MQ=255) aTAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGAcg > 1:3869398/1‑97 (MQ=255) aTAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGaaa > 1:1015287/1‑150 (MQ=255) aTAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGaaa < 2:750606/150‑1 (MQ=255) tAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAAc < 1:3323456/150‑1 (MQ=255) tAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAAc > 1:4165514/1‑150 (MQ=255) aTGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGt < 2:3730864/150‑1 (MQ=255) tGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGtt < 1:1379818/150‑1 (MQ=255) gCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTc < 1:3584969/150‑1 (MQ=255) aaCCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCaa > 1:3732306/1‑150 (MQ=255) cGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGa > 2:915974/1‑137 (MQ=40) cGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGa < 1:915958/137‑1 (MQ=40) cGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGc > 2:3723758/1‑150 (MQ=39) gTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCa < 2:3165579/150‑1 (MQ=37) ttCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCAg < 1:812636/150‑1 (MQ=35) cTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCAGGTc < 2:129349/150‑1 (MQ=33) cTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCAGGTc > 1:2997995/1‑150 (MQ=33) cTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCAGGTc > 1:1456038/1‑150 (MQ=33) tATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGGAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCAGGTCg > 1:4036838/1‑150 (MQ=17) tATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCAGGTCg < 2:2546605/150‑1 (MQ=32) tATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCAGGTCg > 2:1101639/1‑150 (MQ=32) tGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCAGGTCGtt < 2:5183136/150‑1 (MQ=31) | GACCGTCGCAGACCGATGCCTCCGCTCCTACAGGCCTGATAGTGGCCTCAATGTAAACGGCACACTGCGAGCTCACCACGATGTTGGCCAGAAGCAAAAAGCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCGAAACCGTTCAAAGCCCAGGTCGTT > NC_002947/3969164‑3969457 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |