| Predicted mutation | ||||||
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| JC | NC_002947 | 6,098,326 | (CAAGCTGCG)2→1 | coding (811‑819/867 nt) | PP_5350 ← | RpiR family transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 6098314 | 1 (0.000) | coding (831/867 nt) | PP_5350 | RpiR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
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acgcaagctgcgtttcacgctcttcaggtggttgaccaggctaggcccgcgcgccatggcaacgcccatggccagcacgtcgatcaccaccaggtgggcaatacgcgaggtcagtggggtgtagatctcggtgtcttc > 1:5186262‑M2/1‑1 (MQ=255) | ACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCCGTTCACACAGGAATTGCACCGATTTATAGAAGTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAACAGGCCAGTACAGGTTGAATTCAGTCGTCGGTAGCCTTGATCGACTTGGGCGACAGACGCAAGCTGCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCAT > NC_002947/6098166‑6098462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |