| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 713464 = | 19 (0.820) | 3 (0.140) | 3/238 | NT | 18.3% | coding (450/531 nt) | lspA | lipoprotein signal peptidase |
| ? | NC_002947 | 713501 = | 9 (0.410) | coding (487/531 nt) | lspA | lipoprotein signal peptidase | |||||
ACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTCAAGAGCAAGAAGTCCGAGGATCCGGTCCATGACTGACACCCGTATCGGCCAGAACACCGAAGTCACCCTGCACTTCGCGCTGCACCTGGAAAACGGC > NC_002947/713321‑713606 | tagccggggccttatcgaacgtgctgtcgacggtgtcgccgttttccaggtgcagcgcgaagtgcagggtgacttcggtgttctggccgatacgggtgtcagtcatggaccggatcctcggacttcttgctcttgaacatatcCAGCGcc > 2:424481‑M1/144‑150 (MQ=255) ccGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTg < 1:55756/150‑1 (MQ=255) ctggTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTg < 1:519326/150‑1 (MQ=255) tggTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTgg > 1:362095/1‑150 (MQ=255) ggtgtcgccgttttccaggtgcagcgcgaagtgcagggtgacttcggtgttctggccgatacgggtgtcagtcatggaccggatcctcggacttcttgctcttgaacatatcCAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTgg > 2:21063‑M1/113‑150 (MQ=255) ggggtgggGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTgg < 2:210762/149‑1 (MQ=255) gtgggGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGata > 1:122730/1‑150 (MQ=255) gccgttttccaggtgcagcgcgaagtgcagggtgacttcggtgttctggccgatacgggtgtcagtcatggaccggatcctcggacttcttgctcttgaacatatcCAGCGCCa > 1:160173‑M1/107‑114 (MQ=255) gccgttttccaggtgcagcgcgaagtgcagggtgacttcggtgttctggccgatacgggtgtcagtcatggaccggatcctcggacttcttgctcttgaacatatcCAGCGCCa < 2:160173‑M1/8‑1 (MQ=255) ggCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGAACTGGCAGAACAGATGGGAAGCTTCTGGATGCGATGGGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCTGAGGATATGtt > 1:596807/1‑150 (MQ=255) ttccaggtgcagcgcgaagtgcagggtgacttcggtgttctggccgatacgggtgtcagtcatggaccggatcctcggacttcttgctcttgaacatatcCAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTCAaga > 2:302745‑M1/101‑150 (MQ=255) ggCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGa < 1:499973/137‑1 (MQ=255) ggCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGa > 2:499973/1‑137 (MQ=255) tgcagcgcgaagtgcagggtgacttcggtgttctggccgatacgggtgtcagtcatggaccggatcctcggacttcttgctcttgaacatatcCAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTCAAGAGCaagaa > 1:383854‑M1/94‑150 (MQ=255) aCCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGt > 1:303071/1‑104 (MQ=255) aCCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGt < 2:303071/104‑1 (MQ=255) ccATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTc > 2:149302/1‑115 (MQ=255) ccATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTc < 1:149302/115‑1 (MQ=255) cGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTCAAGAGCAAGAAGTCCGAGGATCCGGTCCATGACTGACACCCGTa < 2:596807/150‑1 (MQ=255) aTCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCa > 2:70149/1‑64 (MQ=255) aTCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCa < 1:70149/64‑1 (MQ=255) ttACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTCAAGAGCAAGAAGTCCGAGGATCCGGTCCATGACTGACACCCGTATCGGCCAGAACACCGAAAAAACCCTGCACTTcg > 2:475283/1‑150 (MQ=255) ttCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTCAAGAGCAAGAAGTCCGAGGATCCGGTCCATGACTGACACCCGTATCGGCCAGAACACCGAAGTCACCCTGCACTTCGCGCt > 2:542663/1‑150 (MQ=255) aCGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTCAAGAGCAAGAAGTCCGAGGATCCGGTCCATGACTGACACCCGTATCGGCCAGAACACCGAAGTCACCCTGCACTTCGCGCTGCACCTGGAAAAc > 1:480157/1‑150 (MQ=255) tGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTCAAGAGCAAGAAGTCCGAGGATCCGGTCCATGACTGACACCCGTATCGGCCAGAACACCGAAGTCACCCTGCACTTCGCGCTGCACCTGGAAAACGGc < 1:475283/150‑1 (MQ=255) | ACCTGGCTGGCCGTGGCGCTGGCGCTGGTGCTGGGTGGGGCGATTGGCAACCTGTACGACCGCATCGTGCTGGGCCATGTGGTCGACTTCATCCTGGTGCACTGGCAGAACCGCCATTACTTCCCGGCCTTCAACGTGGCCGACAGCGCCATCACCGTTGGTGCGGTGATGCTGGCGCTGGATATGTTCAAGAGCAAGAAGTCCGAGGATCCGGTCCATGACTGACACCCGTATCGGCCAGAACACCGAAGTCACCCTGCACTTCGCGCTGCACCTGGAAAACGGC > NC_002947/713321‑713606 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |