| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 2177745 = | 247 (1.060) | intergenic (+103/‑63) | PP_5485/PP_1931 | GNAT family acetyltransferase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 516 total aligned reads displayed.
TAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAACCCA > NC_002947/2177596‑2177894 | aaaCTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCa < 1:1554505/150‑1 (MQ=255) aaaCTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCATCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCACAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCa > 2:4379667/1‑150 (MQ=255) gatttcgatggtttccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGAc > 2:1500711‑M2/146‑150 (MQ=255) 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tgtCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACtgtgt > 1:4767330/1‑150 (MQ=255) cgatggtttccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACtgtgt < 2:3348263‑M2/10‑1 (MQ=255) tggtttccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTGTGaa > 1:1675887‑M2/138‑150 (MQ=255) ggtttccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcgtcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTGTGaaa < 2:3060661‑M2/14‑1 (MQ=255) ccacAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGACTCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGaaaa > 1:2313145/1‑150 (MQ=255) cacaGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAAc > 2:3907702/1‑150 (MQ=255) caGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGc < 2:2208662/150‑1 (MQ=255) caggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgctgggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTGTGAAAACGccc < 1:4495844‑M2/20‑1 (MQ=255) gTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCcg > 1:2700191/1‑150 (MQ=255) aaCTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCcgcg < 1:4548822/150‑1 (MQ=255) 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tAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCt > 1:3506179/1‑150 (MQ=255) tcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTg < 2:3485584‑M2/123‑1 (MQ=255) tccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGgac > 2:1348498‑M2/25‑150 (MQ=255) tccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGgac > 2:426737‑M2/25‑150 (MQ=255) cacCTCGAACGGCTGCAATGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGgac < 1:4379667/150‑1 (MQ=255) cTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGgacgac > 1:1852478/1‑150 (MQ=255) tCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACt > 2:3622833/1‑150 (MQ=255) tCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACt > 2:4502531/1‑150 (MQ=255) tcatggctgcccatggtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTAc < 2:3973545‑M2/132‑1 (MQ=255) atggctgcccatggtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGt > 2:3558854‑M2/17‑150 (MQ=255) atggctgcccatggtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGt > 2:1246676‑M2/17‑150 (MQ=255) tGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTCCGTCACCg > 1:2836411/1‑150 (MQ=255) tGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCg > 1:2176125/1‑150 (MQ=255) gcccatggtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGa < 2:4065307‑M2/140‑1 (MQ=255) cccatggtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGAt < 2:2372307‑M2/141‑1 (MQ=255) cccatggtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGAt > 2:3231947‑M2/10‑150 (MQ=255) ggtcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTACCCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGaaaa < 2:1810184‑M2/146‑1 (MQ=255) tcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAAcc > 1:3191365‑M2/3‑150 (MQ=255) tcCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAAcc < 2:1207715‑M2/148‑1 (MQ=255) cAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAACCCa > 1:3950961/1‑150 (MQ=255) cAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGCCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAACCCa > 2:474895/1‑150 (MQ=255) | TAAACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAACCCA > NC_002947/2177596‑2177894 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |