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| MC JC | NC_002947 | 3,226,018 | Δ12 bp | coding (351‑362/1023 nt) | PP_2827 → | alcohol dehydrogenase |
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| ? | NC_002947 | 3226030 = | 0 (0.000) | coding (363/1023 nt) | PP_2827 | alcohol dehydrogenase | |||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
GGTTGGTGAAGGGGTCGATGATATTGCCGTCGGTGACCGGGTCGCCAGCTTCCCGGCCACCAGTGCCAACGACCACCCGGTGTACGGCGATGTCATCGTACTGCCCCGTACAGCCATCACGCGCTACCCGAATGTGCTCACCCCGATCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAGGGCCCTGGGGCT > NC_002947/3225883‑3226179 | ggtggtgactgcggttggtgaaggggtcgatgatattgccgtcggtgaccgggtcgccagcttcccggccaccagtgccaacgaccacccggtgtacggcgatgtcatcgtactgccccgtacagccatcacgcgctacccgaatgtCGa < 1:2780179‑M2/3‑1 (MQ=255) gtggtgactgcggttggtgaaggggtcgatgatattgccgtcggtgaccgggtcgccagcttcccggccaccagtgccaacgaccacccggtgtacggcgatgtcatcgtactgccccgtacagccatcacgcgctacccgaatgtCGAg < 1:4828803‑M2/4‑1 (MQ=255) tggtgactgcggttggtgaaggggtcgatgatattgccgtcggtgaccgggtcgccagcttcccggccaccagtgccaacgaccacccggtgtacggcgatgtcatcgtactgccccgtacagccatcacgcgctacccgaatgtCGAgg > 2:4049896‑M2/146‑150 (MQ=255) 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ccgtacagccatcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGgcctgc > 1:483869‑M2/31‑150 (MQ=255) gtacagccatcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGgcctgcct < 2:3158093‑M2/122‑1 (MQ=255) tacagccatcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCtt > 1:1027849‑M2/28‑150 (MQ=255) acagccatcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTc < 1:1316242‑M2/124‑1 (MQ=255) agccatcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGt < 2:1336486‑M2/126‑1 (MQ=255) agccatcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGt > 1:4894162‑M2/25‑150 (MQ=255) agccatcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTGCGt > 2:3926036‑M2/25‑150 (MQ=255) ccatcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGc > 2:2301426‑M2/23‑150 (MQ=255) ccatcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGc > 2:4526439‑M2/23‑150 (MQ=255) atcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAg > 1:2923984‑M2/21‑150 (MQ=255) tcacgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACACCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCAAAGCGCCGCGCCTGCCTTCGTGCAGc > 1:3085411‑M2/20‑150 (MQ=255) acgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTg > 1:616649‑M2/18‑150 (MQ=255) cgcgctacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTgg < 1:4082499‑M2/134‑1 (MQ=255) tacccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAgg > 1:5154241‑M2/12‑150 (MQ=255) ccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAGGGcc > 2:170366‑M2/9‑150 (MQ=255) ccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAGGGcc > 1:3446672‑M2/9‑150 (MQ=255) ccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAGGGcc > 1:4940526‑M2/9‑150 (MQ=255) ccgaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAGGGcc > 2:1571683‑M2/9‑150 (MQ=255) gaatgtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAGGGCCCt > 2:4541940‑M2/7‑150 (MQ=255) gtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAGGGCCCTgggg < 1:949796‑M2/148‑1 (MQ=255) gtCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTACTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAGGGCCCTgggg < 2:93157‑M2/148‑1 (MQ=255) tCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAGGGCCCTGGGGc > 2:3875996‑M2/2‑150 (MQ=255) | GGTTGGTGAAGGGGTCGATGATATTGCCGTCGGTGACCGGGTCGCCAGCTTCCCGGCCACCAGTGCCAACGACCACCCGGTGTACGGCGATGTCATCGTACTGCCCCGTACAGCCATCACGCGCTACCCGAATGTGCTCACCCCGATCGAGGCCAGCGTGCACTACACCCCGCTGCTGATCGCCTATTTCGCCTACGTCGACCTGGCACGTGCCAAGGCCGGGCAGACAGCACTGGTCACCGATGCCAGCCATTGCGCCGGGCCTGCCTTCGTGCAGCTGGGCAGGGCCCTGGGGCT > NC_002947/3225883‑3226179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |