| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,997,250 | Δ1 bp | 36.2% | intergenic (‑163/+37) | PP_5252 ← / ← PP_5253 | hypothetical protein/arylesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,997,250 | 0 | C | . | 36.2% | 165.4 / 112.9 | 80 | intergenic (‑163/+37) | PP_5252/PP_5253 | hypothetical protein/arylesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/26); new base . (15/14); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.39e-01 | |||||||||||
AGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTCC > NC_002947/5997102‑5997398 | aGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCt < 1:2339201/150‑1 (MQ=255)aGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCt < 1:1032098/150‑1 (MQ=255) ggCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAg < 2:1746598/150‑1 (MQ=39) gCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGc < 2:913967/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGc < 2:628933/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGCGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGc < 1:736024/150‑1 (MQ=255) cAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTCCGGTGTGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGNGCg < 2:1520056/150‑1 (MQ=39) aGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTTGGCTTGAATGTATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCGGGTCAAGCTTTTTGCTGCTTGGGCCGTACTCTCCGCGGGTAACCCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCgg < 1:417052/150‑1 (MQ=255) aGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCgg < 2:792209/150‑1 (MQ=255) aGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCgg < 1:2031442/150‑1 (MQ=255) gggggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCggg < 1:247155/150‑1 (MQ=255) gggggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGCAGGAGCggg < 2:676604/150‑1 (MQ=255) gCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCcg > 1:2321339/1‑150 (MQ=255) aGCATGACGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTAAACCcg‑ctcc < 1:2328943/150‑4 (MQ=255) gCCGGTTGATGAAAGTCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCCGCCTCTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGttt < 2:1324237/150‑1 (MQ=255) cAAGGCCTGGGGTTGAATGGATGTGGGGTGGGTTGAAGAAGGTGAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCGCTGCGCGGGCAAACCCGATCTTCCA‑ACGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAAGGTTTCCCACAATTAc < 2:2165900/150‑1 (MQ=255) cTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGa > 2:2391693/1‑150 (MQ=255) ttGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAg > 2:505533/1‑103 (MQ=255) ttGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAg < 1:505533/103‑1 (MQ=255) gAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCgg < 2:1030488/107‑1 (MQ=255) gAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCgg > 1:1030488/1‑107 (MQ=255) gAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCAGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGc > 2:2382369/1‑150 (MQ=255) gAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGCCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCt > 1:498872/1‑97 (MQ=255) gAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGCCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCt < 2:498872/97‑1 (MQ=255) aaTGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGcc > 2:40118/1‑150 (MQ=255) aTGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCa < 2:949653/150‑1 (MQ=255) tgCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCAGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTc < 1:2382369/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTcc < 1:2391693/150‑1 (MQ=255) gTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGaagag < 2:2267413/110‑4 (MQ=21) gTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGaagag > 1:2267413/1‑107 (MQ=21) gTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCcg‑c < 2:1549622/104‑1 (MQ=255) gTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCcg‑c > 1:1549622/1‑104 (MQ=255) ggTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTc < 1:1200015/150‑1 (MQ=255) gTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCggg < 1:1578417/81‑1 (MQ=255) gTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCggg > 2:1578417/1‑81 (MQ=255) gTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGAGCCGGCCTTTTCTTGCAATGCTTCTGTCCTACA‑ACGTCTTGAGTAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCATCAAGTCCTCATTCAGCTGCTgcgc > 1:2254450/1‑150 (MQ=255) ttAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCa > 2:1325013/1‑150 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAAc < 1:1260608/116‑1 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAAc > 2:1260608/1‑116 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa < 1:2148275/149‑1 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa > 2:2148275/1‑149 (MQ=255) cTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGa > 1:2017735/1‑69 (MQ=21) cTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGa < 2:2017735/69‑1 (MQ=21) ggTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCAc < 2:2321339/150‑1 (MQ=255) gTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCCGGGTG‑TGCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACt > 1:746442/1‑150 (MQ=38) aaGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCaa < 1:708401/116‑1 (MQ=255) aaGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCaa > 2:708401/1‑116 (MQ=255) aaGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCa > 1:1006126/1‑150 (MQ=255) tttttGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAAc < 1:1006698/150‑1 (MQ=255) ctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCgg > 1:1988768/1‑57 (MQ=14) ctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCgg < 2:1988768/57‑1 (MQ=14) gccggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCg < 2:1006126/150‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATacac < 2:17243/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTc > 1:1060471/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCg < 1:1099775/132‑1 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCg > 2:1099775/1‑132 (MQ=255) aCCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTCGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgc < 1:1883750/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgc > 1:96311/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcg > 1:1829184/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcg > 1:2433479/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCTACAGACGT‑TGTAGGGGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAAGTACTGCTCGAGGAACGCAAACAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTAAGCTCGgcgc > 2:297039/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCAtt > 2:1376263/1‑85 (MQ=25) ccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCAtt < 1:1376263/85‑1 (MQ=25) ccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa < 2:1567664/101‑1 (MQ=37) ccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa > 1:1567664/1‑101 (MQ=37) ccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 1:1775524/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 2:1611395/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAgctgct < 1:2366211/93‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAgctgct > 2:2366211/1‑93 (MQ=255) cGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCTcc > 2:287603/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGcc > 2:1050701/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCtgctgc > 2:2041156/1‑93 (MQ=37) gCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCtgctgc < 1:2041156/93‑1 (MQ=37) gCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCa > 2:2306476/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTTAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATAAACAATCAGCTCGGCGCCa > 2:1239020/1‑150 (MQ=255) aatCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCa > 1:1664330/3‑150 (MQ=255) aCGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGc > 2:2416630/1‑150 (MQ=255) cGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCt > 1:309817/1‑150 (MQ=255) gTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTc > 2:1648616/1‑150 (MQ=255) tCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTcc > 2:1469022/1‑150 (MQ=255) | AGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCG‑CGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTCC > NC_002947/5997102‑5997398 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |