| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,060,099 | Δ1 bp | 5.6% | coding (242/891 nt) | iciA → | chromosome initiation inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,060,099 | 0 | A | . | 5.6% | 345.9 / 12.8 | 108 | coding (242/891 nt) | iciA | chromosome initiation inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (53/49); new base . (3/3); total (56/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.47e-01 | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCAGGAA > NC_002947/1059950‑1060247 | ggCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCa > 2:97107/1‑150 (MQ=255)ggCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCa > 2:1038459/1‑150 (MQ=255)ggCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTCCAGCGCCa < 2:823242/150‑1 (MQ=255)ggCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCACGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCATGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCa < 1:657836/150‑1 (MQ=255) gCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAg > 1:1896013/1‑150 (MQ=255) aTTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTCCAGCGCC‑GGTAc < 1:519284/150‑1 (MQ=255) tCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑g > 2:233788/1‑150 (MQ=255) gcgcATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCt < 2:338696/150‑1 (MQ=255) gcgcATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCt > 1:30788/1‑150 (MQ=255) gcgcATCAAGTCGATTGCGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCt < 2:1637547/150‑1 (MQ=255) cATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGa < 2:1768722/150‑1 (MQ=255) aTCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAgg > 2:1722538/1‑136 (MQ=255) aTCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAgg < 1:1722538/136‑1 (MQ=255) aTCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGAc > 2:1924774/1‑150 (MQ=255) tCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACg > 2:1295207/1‑150 (MQ=255) tCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACg > 2:2371024/1‑150 (MQ=255) cAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTgcaggt < 1:547183/150‑6 (MQ=255) gTTGCTTGAGGCGCTGGTCGGCCAGACGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAaga > 2:1208541/1‑150 (MQ=255) ttGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGCGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAagag < 1:566979/150‑1 (MQ=255) tGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGAAAGTGCACCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAgg < 1:1995232/150‑1 (MQ=255) tGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCAt < 2:1896013/150‑1 (MQ=255) aGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGc > 1:770881/1‑150 (MQ=255) aGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGc < 1:1295207/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCgg < 1:1922515/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCgg > 2:2183258/1‑150 (MQ=255) gcgGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGa < 1:1657637/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑gc < 1:458380/150‑1 (MQ=255) cAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAaga > 2:1087174/1‑128 (MQ=255) cAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAaga < 1:1087174/128‑1 (MQ=255) cAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGa < 1:254095/140‑1 (MQ=255) cAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGa > 2:254095/1‑140 (MQ=255) cAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCCCGACCGAAGTCGGCCGCCCGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑gcgc > 2:193347/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGc > 1:1250178/1‑150 (MQ=255) cTGGTACGTGCCGCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTc < 2:136105/150‑1 (MQ=255) tGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCa > 2:2414737/1‑150 (MQ=255) gTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGa < 2:2381152/113‑1 (MQ=255) gTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGa > 1:2381152/1‑113 (MQ=255) cGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGcc < 2:584057/150‑1 (MQ=255) gTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCg > 2:2056206/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATa > 1:215430/1‑150 (MQ=255) gccgccCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCt > 2:1658670/1‑150 (MQ=255) gccgccCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCt > 1:1385929/1‑150 (MQ=255) ccgccCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGTGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTg < 2:868025/150‑1 (MQ=255) ccgccCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCt < 1:1066269/122‑1 (MQ=255) ccgccCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCt > 2:1066269/1‑122 (MQ=255) ccgccCGGCGAGCCCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTg < 1:1073333/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCa > 2:109067/1‑123 (MQ=255) ccGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCa < 1:109067/123‑1 (MQ=255) gcgACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCt < 1:1415299/86‑1 (MQ=255) gcgACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCt > 2:1415299/1‑86 (MQ=255) aaGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGc > 2:175460/1‑96 (MQ=255) aaGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGc < 1:175460/96‑1 (MQ=255) aaGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATTGCCCTCAACGCCGATAGCCGGCCCACCaggtggccag < 1:1038459/150‑5 (MQ=255) aGTCAGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCgg < 2:2430911/150‑1 (MQ=255) tCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGgcg > 2:415489/1‑150 (MQ=255) ccgccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGCAAC‑GGCGATGGTCCAAGAGGGCATGCCTGTTCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGt < 1:884797/150‑1 (MQ=255) ccgccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGATCCGCGATCGCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGt < 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tgCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCacaac < 2:473575/150‑1 (MQ=255) gcagGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGGGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGaa > 2:1374141/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGt > 1:984470/1‑150 (MQ=255) gTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTg > 2:841125/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGACGATATCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGc < 2:2158701/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCt < 2:1385929/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACCGCACGTGCCgacc > 2:1319699/1‑150 (MQ=255) tGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTgaccg > 2:792885/1‑150 (MQ=255) gCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTgaccga < 2:1629603/150‑1 (MQ=255) tCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GTCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGGGCTgaccgacc > 1:563796/1‑150 (MQ=255) tCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGt < 1:1819983/112‑1 (MQ=255) tCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGt > 2:1819983/1‑112 (MQ=255) gAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtg < 1:520106/150‑1 (MQ=255) gAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCAACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtg > 1:287711/1‑150 (MQ=255) aaCGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGTAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtgg > 2:1155892/1‑150 (MQ=255) aCGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTg > 1:204865/1‑136 (MQ=255) aCGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtggt < 2:761514/150‑1 (MQ=255) gcgACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCCCAACAGCACCTGCTGCCCGACCtggtgg > 2:128661/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGa > 2:1637205/1‑150 (MQ=255) tccAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAgg > 1:1723018/3‑150 (MQ=255) tGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAgg > 1:1370436/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAgg > 2:1437532/1‑150 (MQ=255) cAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCacaa > 1:422572/1‑117 (MQ=255) cAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCacaa < 2:422572/117‑1 (MQ=255) cAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGAc > 1:2081192/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCa < 1:1924774/150‑1 (MQ=255) gcCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTGAACGCCGATAGCCTGGCTATCTGGTGGGTCGGCGGGGTGGGCAAGTGCTGTGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCAgg < 2:866733/150‑1 (MQ=255) | GGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCT‑GCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCAGGAA > NC_002947/1059950‑1060247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |